Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HXY2

Protein Details
Accession A0A179HXY2    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-92DASEVKQKKAKKDKKDKKDKKDKKKDKKESRRERKDKRKDLQDLPEEDBasic
108-140DVEKEQKKAEKKSKKESKKKESKEKKADKEGAEBasic
144-169AEEQEKPKKSKKDKKANKKDNETSTSHydrophilic
288-309GGKTKHRKDKIIAKNKKLDENRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-83KQKKAKKDKKDKKDKKDKKKDKKESRRERKDKRK
113-162QKKAEKKSKKESKKKESKEKKADKEGAEGAAAEEQEKPKKSKKDKKANKK
288-322GGKTKHRKDKIIAKNKKLDENRAKRIEKEKTAKEN
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG plj:VFPFJ_00408  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MKSKRAREAAATNDEEKPAPAAATAADEQPAKKRRRDDAAAADDDASEVKQKKAKKDKKDKKDKKDKKKDKKESRRERKDKRKDLQDLPEEDDGVGEEAEDAVIGDADVEKEQKKAEKKSKKESKKKESKEKKADKEGAEGAAAEEQEKPKKSKKDKKANKKDNETSTSTPTTTTTAAADGDDSSSAKQNGDGGKPDRHIVFVGNLPYTATQETVRAHFASLNPVSVRCLTKRDDTTTSGATCRGIAFVEFANVWTMRTCLDKFHHSSFEDGKSAARKINVELTAGGGGKTKHRKDKIIAKNKKLDENRAKRIEKEKTAKENGEGGGAQKERQSVSESIHPSRLARNPRLGHR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.41
3 0.34
4 0.28
5 0.2
6 0.16
7 0.13
8 0.11
9 0.1
10 0.14
11 0.14
12 0.13
13 0.15
14 0.16
15 0.17
16 0.26
17 0.34
18 0.35
19 0.4
20 0.48
21 0.54
22 0.62
23 0.68
24 0.67
25 0.69
26 0.71
27 0.67
28 0.6
29 0.52
30 0.43
31 0.36
32 0.27
33 0.17
34 0.15
35 0.15
36 0.18
37 0.22
38 0.27
39 0.37
40 0.49
41 0.58
42 0.63
43 0.73
44 0.8
45 0.87
46 0.94
47 0.94
48 0.94
49 0.96
50 0.96
51 0.95
52 0.96
53 0.96
54 0.96
55 0.97
56 0.97
57 0.97
58 0.97
59 0.97
60 0.97
61 0.97
62 0.97
63 0.96
64 0.96
65 0.96
66 0.96
67 0.95
68 0.93
69 0.93
70 0.9
71 0.87
72 0.86
73 0.82
74 0.75
75 0.68
76 0.6
77 0.5
78 0.41
79 0.32
80 0.23
81 0.15
82 0.11
83 0.06
84 0.05
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.04
95 0.04
96 0.06
97 0.07
98 0.08
99 0.1
100 0.16
101 0.23
102 0.32
103 0.42
104 0.5
105 0.58
106 0.68
107 0.78
108 0.83
109 0.87
110 0.88
111 0.89
112 0.9
113 0.92
114 0.92
115 0.92
116 0.92
117 0.93
118 0.92
119 0.89
120 0.88
121 0.85
122 0.75
123 0.69
124 0.59
125 0.49
126 0.39
127 0.3
128 0.2
129 0.15
130 0.13
131 0.08
132 0.08
133 0.1
134 0.14
135 0.16
136 0.2
137 0.26
138 0.35
139 0.46
140 0.54
141 0.63
142 0.7
143 0.79
144 0.87
145 0.91
146 0.93
147 0.91
148 0.9
149 0.87
150 0.82
151 0.77
152 0.7
153 0.61
154 0.55
155 0.47
156 0.38
157 0.31
158 0.24
159 0.21
160 0.16
161 0.14
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.07
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.11
177 0.13
178 0.14
179 0.18
180 0.19
181 0.22
182 0.23
183 0.25
184 0.22
185 0.2
186 0.19
187 0.15
188 0.14
189 0.13
190 0.14
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.12
196 0.1
197 0.09
198 0.07
199 0.1
200 0.11
201 0.12
202 0.14
203 0.13
204 0.13
205 0.14
206 0.14
207 0.18
208 0.17
209 0.18
210 0.16
211 0.16
212 0.18
213 0.19
214 0.21
215 0.15
216 0.19
217 0.2
218 0.27
219 0.3
220 0.34
221 0.35
222 0.36
223 0.38
224 0.37
225 0.35
226 0.29
227 0.26
228 0.21
229 0.18
230 0.14
231 0.11
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.13
246 0.13
247 0.15
248 0.19
249 0.26
250 0.3
251 0.35
252 0.39
253 0.36
254 0.4
255 0.4
256 0.39
257 0.34
258 0.29
259 0.28
260 0.26
261 0.27
262 0.26
263 0.24
264 0.21
265 0.23
266 0.3
267 0.28
268 0.25
269 0.24
270 0.22
271 0.22
272 0.21
273 0.19
274 0.14
275 0.13
276 0.2
277 0.3
278 0.35
279 0.43
280 0.48
281 0.54
282 0.6
283 0.7
284 0.73
285 0.75
286 0.78
287 0.77
288 0.81
289 0.8
290 0.81
291 0.76
292 0.76
293 0.76
294 0.76
295 0.77
296 0.77
297 0.75
298 0.72
299 0.77
300 0.75
301 0.74
302 0.74
303 0.73
304 0.73
305 0.78
306 0.74
307 0.68
308 0.64
309 0.54
310 0.48
311 0.39
312 0.31
313 0.3
314 0.28
315 0.26
316 0.23
317 0.26
318 0.23
319 0.24
320 0.28
321 0.22
322 0.26
323 0.34
324 0.37
325 0.38
326 0.41
327 0.41
328 0.38
329 0.43
330 0.46
331 0.47
332 0.49
333 0.55