Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HF86

Protein Details
Accession A0A179HF86    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-43QHLVDQRQRYKSKKRRGPPNLENVVQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-33SKKRR
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12.333, nucl 11, mito_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR006590  RNA_pol_Rpb4/RPC9_core  
IPR005574  Rpb4/RPC9  
IPR038324  Rpb4/RPC9_sf  
IPR038846  RPC9  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0006384  P:transcription initiation at RNA polymerase III promoter  
KEGG plj:VFPFJ_06753  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03874  RNA_pol_Rpb4  
Amino Acid Sequences MKVIESQTAVLSNYEVYQHLVDQRQRYKSKKRRGPPNLENVVQELLQYLQAAPGPLSQEPTTYTPESIAQLLERLRPFDLSKGEVVMILNVRPASVIGLNTVVEEMSERFTDEQQLEMVYIIADVLGKFETAEPDEGHDEAAEGGDVNMDDAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.12
4 0.12
5 0.13
6 0.17
7 0.23
8 0.28
9 0.35
10 0.41
11 0.48
12 0.55
13 0.61
14 0.68
15 0.72
16 0.78
17 0.8
18 0.82
19 0.84
20 0.88
21 0.9
22 0.88
23 0.88
24 0.84
25 0.75
26 0.66
27 0.57
28 0.48
29 0.36
30 0.27
31 0.17
32 0.11
33 0.09
34 0.09
35 0.07
36 0.06
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.08
41 0.09
42 0.09
43 0.12
44 0.11
45 0.12
46 0.14
47 0.16
48 0.19
49 0.17
50 0.17
51 0.15
52 0.16
53 0.16
54 0.14
55 0.12
56 0.08
57 0.09
58 0.1
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.13
64 0.13
65 0.14
66 0.16
67 0.14
68 0.14
69 0.13
70 0.13
71 0.12
72 0.11
73 0.09
74 0.08
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.09
97 0.09
98 0.14
99 0.13
100 0.13
101 0.12
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.06
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.06
117 0.09
118 0.11
119 0.13
120 0.13
121 0.16
122 0.18
123 0.18
124 0.18
125 0.15
126 0.13
127 0.11
128 0.11
129 0.07
130 0.05
131 0.05
132 0.06
133 0.06
134 0.06