Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J9DLW5

Protein Details
Accession J9DLW5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-43NSSNKDEKHKTYHNKYVPQKRPQQFQPAQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito_nucl 11, mito 5.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038635  CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf  
IPR040168  Not2/3/5  
IPR007282  NOT2/3/5_C  
Gene Ontology GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04153  NOT2_3_5  
Amino Acid Sequences MRRNQQDPKNYGNSNSSNKDEKHKTYHNKYVPQKRPQQFQPAQPAQQPTNEKKISPAEFWASATSRMDKLSISTEPSQPKNTPQLFTQENEKPRSFDFSDVLQKRDAYLKARHDHFNSQFSPTEANERFFQTETELSFNFGLDYEKLHDFTIYKPEKPIQIPNEYSFFPKKPMIEFEGPMIYDKLNIDTLFFIFYRHKGSIRQYFAAKELKNYSWRFHTKYLTWFQRLEEPKILTEDYEQGTYIFFDYDVTWTNRKKRDFTFEFKYLENIEM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.56
3 0.53
4 0.52
5 0.52
6 0.58
7 0.59
8 0.58
9 0.59
10 0.64
11 0.69
12 0.71
13 0.79
14 0.78
15 0.8
16 0.84
17 0.86
18 0.85
19 0.84
20 0.86
21 0.82
22 0.83
23 0.8
24 0.81
25 0.76
26 0.74
27 0.75
28 0.72
29 0.68
30 0.64
31 0.62
32 0.53
33 0.53
34 0.53
35 0.47
36 0.5
37 0.48
38 0.43
39 0.43
40 0.49
41 0.46
42 0.4
43 0.39
44 0.33
45 0.33
46 0.33
47 0.32
48 0.25
49 0.24
50 0.24
51 0.22
52 0.19
53 0.18
54 0.18
55 0.15
56 0.15
57 0.17
58 0.16
59 0.19
60 0.2
61 0.25
62 0.3
63 0.33
64 0.36
65 0.34
66 0.37
67 0.42
68 0.42
69 0.38
70 0.34
71 0.37
72 0.35
73 0.35
74 0.38
75 0.34
76 0.37
77 0.41
78 0.4
79 0.35
80 0.34
81 0.39
82 0.33
83 0.29
84 0.25
85 0.23
86 0.33
87 0.33
88 0.34
89 0.28
90 0.27
91 0.25
92 0.29
93 0.27
94 0.21
95 0.26
96 0.32
97 0.37
98 0.4
99 0.43
100 0.42
101 0.47
102 0.46
103 0.46
104 0.39
105 0.37
106 0.34
107 0.3
108 0.29
109 0.22
110 0.26
111 0.21
112 0.22
113 0.2
114 0.21
115 0.22
116 0.2
117 0.2
118 0.14
119 0.14
120 0.13
121 0.14
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.06
130 0.07
131 0.08
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.11
138 0.21
139 0.2
140 0.2
141 0.21
142 0.23
143 0.27
144 0.28
145 0.34
146 0.29
147 0.33
148 0.35
149 0.35
150 0.35
151 0.32
152 0.33
153 0.3
154 0.26
155 0.23
156 0.23
157 0.23
158 0.22
159 0.25
160 0.28
161 0.28
162 0.27
163 0.26
164 0.25
165 0.24
166 0.23
167 0.2
168 0.13
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.11
176 0.11
177 0.12
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.13
182 0.17
183 0.18
184 0.19
185 0.22
186 0.3
187 0.37
188 0.41
189 0.43
190 0.4
191 0.4
192 0.43
193 0.46
194 0.38
195 0.34
196 0.34
197 0.34
198 0.4
199 0.41
200 0.4
201 0.42
202 0.48
203 0.48
204 0.49
205 0.51
206 0.47
207 0.53
208 0.59
209 0.58
210 0.56
211 0.52
212 0.48
213 0.52
214 0.52
215 0.5
216 0.46
217 0.4
218 0.38
219 0.4
220 0.38
221 0.29
222 0.27
223 0.26
224 0.22
225 0.21
226 0.19
227 0.16
228 0.16
229 0.16
230 0.14
231 0.1
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.1
236 0.14
237 0.18
238 0.24
239 0.3
240 0.39
241 0.46
242 0.51
243 0.55
244 0.58
245 0.64
246 0.66
247 0.68
248 0.68
249 0.67
250 0.64
251 0.59
252 0.55