Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HPA1

Protein Details
Accession A0A179HPA1    Localization Confidence Low Confidence Score 6.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-57AAYSSQASRRRSKPQSRTSGAISHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 11.5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG plj:VFPFJ_03544  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MPGRPLLLDLGSRSGPICRACLSSIRRQAAQPSAAAYSSQASRRRSKPQSRTSGAISRQPDQNELRQYLQGIQELQGAPKNGDKEGFSVRFFEQNDKSRTELDEDEFGTSLSRLDGSELKDALFDLRSALATQEERDAFQTVMREMGGDVDKVASADDLEKMMAKMQAYTDSIDAEIEEAGAGLPKEILDELRQDLPDLPLLDESGRRQAAPPQIPERPWTPNQRKKITRLNSILARVFRDLRRDPGLTKKSVSSVYKAYHAARLPLARGWSNVPIDVWDLLWTIFSADESINTHRLAHVSMLARDMSEAKITLAPSQQLLTIEAVFVDGWESKAIDNWKRCMSTLGDEKSETFQQFWELGVRMYCRVGDMEQAERATAKLLERHMDARILMPLIRTLSEQGTSESQERAWATYRQMRDLLGKEMKLADYDQVVSYFLTTNQTENALYAFVDMMSDGQIDLKRQRYMPSVVANKFFLGKWLKRLIGAGDLDGAFSVVEFMRSKGVEAAPIHLNGLIGAWQRSGGADDLVKADKLAWDMIESRTNFVRARQAGSKQQQSLSSGTAPWPRATLETFSLLAENYRLRDLHGKLESLWDAFRDSEISPDAFMMNQLLESYIQAGQPKEAMTLYHSFVAERGLAPDPYTFSALWKTLAVNRLHVVAPDALQEETEATRALFKETLKFKQVFQPDGIDGQLARKMLHTFRRLKDNAGLLVALTALKDVFGFLPPETLAMELLLGTTKLAWDTPSQRRRLMLAKRDLDRALLAWADGDAERLEGDARRGEALYEYLQKKYWPDEGAYEDKRRVLVEVAKEMGVYELLAPKSRRKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.21
4 0.22
5 0.2
6 0.23
7 0.25
8 0.33
9 0.37
10 0.43
11 0.5
12 0.53
13 0.53
14 0.52
15 0.57
16 0.56
17 0.52
18 0.43
19 0.36
20 0.34
21 0.31
22 0.29
23 0.23
24 0.19
25 0.21
26 0.27
27 0.31
28 0.34
29 0.43
30 0.5
31 0.59
32 0.66
33 0.73
34 0.77
35 0.81
36 0.86
37 0.83
38 0.8
39 0.77
40 0.75
41 0.68
42 0.65
43 0.58
44 0.52
45 0.52
46 0.49
47 0.49
48 0.45
49 0.48
50 0.49
51 0.48
52 0.47
53 0.43
54 0.42
55 0.4
56 0.39
57 0.34
58 0.28
59 0.25
60 0.27
61 0.26
62 0.27
63 0.26
64 0.24
65 0.22
66 0.25
67 0.26
68 0.21
69 0.23
70 0.22
71 0.22
72 0.3
73 0.32
74 0.28
75 0.3
76 0.3
77 0.34
78 0.35
79 0.39
80 0.38
81 0.43
82 0.47
83 0.46
84 0.47
85 0.43
86 0.43
87 0.4
88 0.36
89 0.3
90 0.3
91 0.28
92 0.28
93 0.25
94 0.23
95 0.19
96 0.15
97 0.13
98 0.09
99 0.08
100 0.07
101 0.1
102 0.14
103 0.16
104 0.21
105 0.21
106 0.21
107 0.2
108 0.2
109 0.19
110 0.16
111 0.13
112 0.09
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.11
117 0.13
118 0.13
119 0.14
120 0.19
121 0.18
122 0.19
123 0.2
124 0.21
125 0.18
126 0.18
127 0.2
128 0.14
129 0.15
130 0.14
131 0.12
132 0.1
133 0.14
134 0.14
135 0.11
136 0.11
137 0.1
138 0.11
139 0.1
140 0.11
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.09
148 0.09
149 0.11
150 0.12
151 0.11
152 0.12
153 0.12
154 0.16
155 0.16
156 0.17
157 0.16
158 0.14
159 0.14
160 0.13
161 0.12
162 0.08
163 0.07
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.1
178 0.12
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.17
183 0.17
184 0.19
185 0.18
186 0.16
187 0.13
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.15
192 0.18
193 0.18
194 0.17
195 0.18
196 0.23
197 0.32
198 0.35
199 0.39
200 0.39
201 0.43
202 0.44
203 0.46
204 0.43
205 0.41
206 0.42
207 0.47
208 0.52
209 0.56
210 0.65
211 0.72
212 0.74
213 0.74
214 0.79
215 0.75
216 0.74
217 0.7
218 0.68
219 0.63
220 0.61
221 0.58
222 0.49
223 0.43
224 0.36
225 0.35
226 0.31
227 0.33
228 0.31
229 0.32
230 0.36
231 0.35
232 0.35
233 0.41
234 0.45
235 0.39
236 0.39
237 0.35
238 0.33
239 0.38
240 0.37
241 0.3
242 0.3
243 0.29
244 0.31
245 0.33
246 0.31
247 0.3
248 0.29
249 0.28
250 0.25
251 0.25
252 0.23
253 0.22
254 0.23
255 0.18
256 0.19
257 0.19
258 0.21
259 0.2
260 0.19
261 0.17
262 0.15
263 0.15
264 0.14
265 0.12
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.05
276 0.06
277 0.08
278 0.11
279 0.13
280 0.13
281 0.13
282 0.12
283 0.13
284 0.13
285 0.11
286 0.13
287 0.13
288 0.14
289 0.15
290 0.14
291 0.13
292 0.13
293 0.14
294 0.1
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.1
299 0.1
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.09
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.06
314 0.05
315 0.05
316 0.04
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.05
321 0.09
322 0.14
323 0.18
324 0.21
325 0.25
326 0.28
327 0.28
328 0.29
329 0.28
330 0.26
331 0.26
332 0.31
333 0.3
334 0.27
335 0.27
336 0.27
337 0.27
338 0.28
339 0.22
340 0.15
341 0.12
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.12
346 0.1
347 0.1
348 0.11
349 0.11
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.1
357 0.11
358 0.12
359 0.13
360 0.13
361 0.13
362 0.12
363 0.12
364 0.1
365 0.09
366 0.08
367 0.1
368 0.11
369 0.12
370 0.14
371 0.15
372 0.15
373 0.15
374 0.14
375 0.12
376 0.11
377 0.1
378 0.09
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.07
384 0.08
385 0.08
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.1
390 0.11
391 0.12
392 0.11
393 0.1
394 0.12
395 0.12
396 0.12
397 0.13
398 0.13
399 0.15
400 0.2
401 0.21
402 0.21
403 0.21
404 0.21
405 0.22
406 0.22
407 0.25
408 0.22
409 0.21
410 0.19
411 0.2
412 0.19
413 0.16
414 0.14
415 0.09
416 0.07
417 0.08
418 0.08
419 0.07
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.06
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.1
430 0.1
431 0.09
432 0.09
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.05
437 0.04
438 0.04
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.05
445 0.06
446 0.07
447 0.11
448 0.14
449 0.16
450 0.17
451 0.2
452 0.22
453 0.24
454 0.26
455 0.3
456 0.34
457 0.34
458 0.35
459 0.33
460 0.3
461 0.28
462 0.24
463 0.22
464 0.21
465 0.2
466 0.24
467 0.28
468 0.28
469 0.27
470 0.28
471 0.24
472 0.22
473 0.21
474 0.16
475 0.13
476 0.12
477 0.12
478 0.11
479 0.1
480 0.05
481 0.04
482 0.05
483 0.03
484 0.05
485 0.06
486 0.06
487 0.09
488 0.09
489 0.1
490 0.11
491 0.12
492 0.14
493 0.14
494 0.17
495 0.17
496 0.17
497 0.17
498 0.14
499 0.14
500 0.09
501 0.09
502 0.08
503 0.07
504 0.08
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.08
510 0.07
511 0.07
512 0.06
513 0.07
514 0.09
515 0.1
516 0.1
517 0.08
518 0.08
519 0.08
520 0.09
521 0.09
522 0.07
523 0.08
524 0.1
525 0.12
526 0.17
527 0.16
528 0.17
529 0.18
530 0.2
531 0.2
532 0.2
533 0.26
534 0.22
535 0.26
536 0.29
537 0.33
538 0.39
539 0.46
540 0.5
541 0.44
542 0.45
543 0.43
544 0.41
545 0.38
546 0.31
547 0.25
548 0.19
549 0.2
550 0.23
551 0.23
552 0.2
553 0.19
554 0.18
555 0.18
556 0.19
557 0.19
558 0.16
559 0.17
560 0.17
561 0.16
562 0.16
563 0.14
564 0.13
565 0.12
566 0.11
567 0.1
568 0.11
569 0.11
570 0.12
571 0.2
572 0.21
573 0.27
574 0.28
575 0.27
576 0.26
577 0.3
578 0.29
579 0.22
580 0.21
581 0.14
582 0.13
583 0.12
584 0.13
585 0.11
586 0.1
587 0.11
588 0.13
589 0.12
590 0.11
591 0.12
592 0.11
593 0.09
594 0.09
595 0.08
596 0.06
597 0.06
598 0.05
599 0.06
600 0.06
601 0.06
602 0.08
603 0.08
604 0.1
605 0.12
606 0.12
607 0.12
608 0.13
609 0.14
610 0.13
611 0.12
612 0.11
613 0.12
614 0.15
615 0.16
616 0.17
617 0.17
618 0.16
619 0.16
620 0.17
621 0.14
622 0.12
623 0.13
624 0.13
625 0.13
626 0.14
627 0.14
628 0.15
629 0.16
630 0.18
631 0.15
632 0.14
633 0.17
634 0.17
635 0.17
636 0.16
637 0.16
638 0.18
639 0.25
640 0.24
641 0.23
642 0.23
643 0.25
644 0.24
645 0.23
646 0.21
647 0.15
648 0.15
649 0.14
650 0.14
651 0.12
652 0.11
653 0.11
654 0.1
655 0.1
656 0.1
657 0.08
658 0.07
659 0.11
660 0.11
661 0.14
662 0.15
663 0.16
664 0.23
665 0.29
666 0.34
667 0.37
668 0.38
669 0.37
670 0.43
671 0.48
672 0.43
673 0.39
674 0.38
675 0.33
676 0.33
677 0.31
678 0.24
679 0.18
680 0.17
681 0.17
682 0.14
683 0.13
684 0.14
685 0.17
686 0.23
687 0.31
688 0.38
689 0.44
690 0.48
691 0.58
692 0.57
693 0.58
694 0.58
695 0.54
696 0.47
697 0.4
698 0.35
699 0.24
700 0.23
701 0.19
702 0.13
703 0.08
704 0.06
705 0.05
706 0.05
707 0.05
708 0.05
709 0.06
710 0.08
711 0.1
712 0.09
713 0.12
714 0.12
715 0.12
716 0.12
717 0.11
718 0.1
719 0.08
720 0.08
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.05
725 0.05
726 0.05
727 0.05
728 0.06
729 0.07
730 0.08
731 0.14
732 0.22
733 0.33
734 0.41
735 0.45
736 0.48
737 0.49
738 0.52
739 0.56
740 0.57
741 0.57
742 0.59
743 0.62
744 0.63
745 0.66
746 0.62
747 0.54
748 0.45
749 0.36
750 0.28
751 0.2
752 0.17
753 0.12
754 0.11
755 0.11
756 0.1
757 0.1
758 0.08
759 0.08
760 0.08
761 0.08
762 0.1
763 0.1
764 0.12
765 0.14
766 0.15
767 0.16
768 0.17
769 0.17
770 0.17
771 0.18
772 0.2
773 0.26
774 0.27
775 0.28
776 0.29
777 0.3
778 0.32
779 0.34
780 0.36
781 0.3
782 0.3
783 0.33
784 0.39
785 0.46
786 0.5
787 0.5
788 0.47
789 0.46
790 0.45
791 0.4
792 0.35
793 0.32
794 0.32
795 0.33
796 0.37
797 0.37
798 0.35
799 0.34
800 0.32
801 0.27
802 0.21
803 0.14
804 0.11
805 0.14
806 0.16
807 0.22
808 0.24