Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HYD3

Protein Details
Accession A0A179HYD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
97-155QKVPRGLRRRTASHNPKRVPRRLRARAKKEMAEDNTPVVEPRRRKPRTTKARIRAETAKHydrophilic
184-222ITGVVGRKPRPKIRRNQLNEPPKPHAKFRRRQINKTWLPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
99-129VPRGLRRRTASHNPKRVPRRLRARAKKEMAE
133-215PVVEPRRRKPRTTKARIRAETAKRIGLLAARKRREKLKQAADLSRDGKAAEITGVVGRKPRPKIRRNQLNEPPKPHAKFRRRQ
Subcellular Location(s) mito 16, cyto 6, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
KEGG plj:VFPFJ_00479  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
Amino Acid Sequences MGPKTSGGGRGGSTSFDVASARRKGASPAANGRSDAIHQKRTKLHAARNVPAQPADAALKDGELDLQAFIAAREFEIKSLEQSMATSKAVSTSRAFQKVPRGLRRRTASHNPKRVPRRLRARAKKEMAEDNTPVVEPRRRKPRTTKARIRAETAKRIGLLAARKRREKLKQAADLSRDGKAAEITGVVGRKPRPKIRRNQLNEPPKPHAKFRRRQINKTWLPTHLWHAKRARMTEPKDPLWRFAVPLTPNEKIYRPTHRSQGERGTMIWDMSYMTTIGLYGNAAGIERVLKRVGILEESCWNERGRRWRLGTRTWCGMLSKSVGDSRRQMCPATVLWNPQTPESSDGEDSKRKQRQIFLRVHPSAFLELFNELLRLTKMENPRLYIEDLRFEIGSIELTGRKGEVGDGLACDFELLFGLSKAQHEEPTPSDAVVAEGDAMDIDRDEPLASRSDIGTHPLKLLRHISKATFDGLIASPMTSMDTPNATMNVKISLVARGVVSTCARIYRLPSMPSRVASSATAEVPSTLPPNNPHAVALPHDLRNQWLALADIQSSKRLQGSKRPWPTDMEARKRRLAGELIKQHIPYPLEPPNLRHVGGHPLVPDADDLIGFVTAGSYCLTDGRGAAMGSIAASKVLADVRDNKKEGRLCIVRNAGENVGWLARWDVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.15
4 0.16
5 0.14
6 0.22
7 0.24
8 0.25
9 0.26
10 0.27
11 0.3
12 0.38
13 0.42
14 0.42
15 0.47
16 0.52
17 0.52
18 0.51
19 0.49
20 0.42
21 0.38
22 0.4
23 0.37
24 0.41
25 0.42
26 0.49
27 0.54
28 0.59
29 0.66
30 0.64
31 0.66
32 0.67
33 0.72
34 0.7
35 0.72
36 0.7
37 0.62
38 0.54
39 0.47
40 0.37
41 0.32
42 0.28
43 0.2
44 0.17
45 0.14
46 0.14
47 0.12
48 0.12
49 0.1
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.08
58 0.07
59 0.07
60 0.11
61 0.11
62 0.12
63 0.15
64 0.15
65 0.16
66 0.18
67 0.18
68 0.14
69 0.15
70 0.18
71 0.18
72 0.18
73 0.16
74 0.13
75 0.18
76 0.19
77 0.21
78 0.2
79 0.26
80 0.33
81 0.39
82 0.39
83 0.38
84 0.47
85 0.53
86 0.6
87 0.62
88 0.62
89 0.62
90 0.71
91 0.74
92 0.7
93 0.71
94 0.72
95 0.73
96 0.76
97 0.81
98 0.78
99 0.81
100 0.85
101 0.85
102 0.83
103 0.82
104 0.83
105 0.83
106 0.87
107 0.89
108 0.88
109 0.89
110 0.87
111 0.83
112 0.77
113 0.76
114 0.69
115 0.64
116 0.56
117 0.47
118 0.41
119 0.35
120 0.3
121 0.26
122 0.28
123 0.28
124 0.35
125 0.44
126 0.48
127 0.55
128 0.65
129 0.72
130 0.76
131 0.82
132 0.84
133 0.83
134 0.9
135 0.85
136 0.81
137 0.79
138 0.76
139 0.74
140 0.67
141 0.59
142 0.48
143 0.45
144 0.39
145 0.34
146 0.34
147 0.34
148 0.4
149 0.44
150 0.48
151 0.52
152 0.6
153 0.64
154 0.66
155 0.67
156 0.67
157 0.7
158 0.72
159 0.75
160 0.69
161 0.66
162 0.58
163 0.5
164 0.4
165 0.31
166 0.25
167 0.18
168 0.16
169 0.1
170 0.08
171 0.07
172 0.09
173 0.1
174 0.1
175 0.14
176 0.17
177 0.24
178 0.31
179 0.4
180 0.48
181 0.56
182 0.67
183 0.74
184 0.81
185 0.81
186 0.85
187 0.85
188 0.86
189 0.84
190 0.79
191 0.75
192 0.72
193 0.67
194 0.66
195 0.66
196 0.66
197 0.68
198 0.72
199 0.76
200 0.75
201 0.8
202 0.81
203 0.82
204 0.79
205 0.79
206 0.72
207 0.63
208 0.6
209 0.54
210 0.51
211 0.49
212 0.43
213 0.42
214 0.43
215 0.46
216 0.45
217 0.47
218 0.47
219 0.47
220 0.51
221 0.52
222 0.53
223 0.54
224 0.58
225 0.56
226 0.5
227 0.45
228 0.41
229 0.33
230 0.29
231 0.29
232 0.22
233 0.26
234 0.29
235 0.26
236 0.27
237 0.28
238 0.28
239 0.27
240 0.3
241 0.35
242 0.36
243 0.37
244 0.44
245 0.48
246 0.49
247 0.5
248 0.54
249 0.48
250 0.43
251 0.4
252 0.34
253 0.29
254 0.25
255 0.2
256 0.12
257 0.08
258 0.07
259 0.08
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.05
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.04
271 0.03
272 0.03
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.15
285 0.17
286 0.18
287 0.17
288 0.17
289 0.16
290 0.2
291 0.28
292 0.3
293 0.34
294 0.38
295 0.43
296 0.47
297 0.55
298 0.58
299 0.52
300 0.5
301 0.44
302 0.4
303 0.34
304 0.3
305 0.22
306 0.17
307 0.13
308 0.11
309 0.14
310 0.15
311 0.16
312 0.21
313 0.22
314 0.25
315 0.25
316 0.24
317 0.21
318 0.22
319 0.21
320 0.19
321 0.19
322 0.17
323 0.17
324 0.2
325 0.2
326 0.18
327 0.18
328 0.15
329 0.17
330 0.16
331 0.16
332 0.14
333 0.16
334 0.19
335 0.23
336 0.24
337 0.3
338 0.34
339 0.36
340 0.37
341 0.42
342 0.48
343 0.53
344 0.59
345 0.56
346 0.61
347 0.59
348 0.56
349 0.5
350 0.41
351 0.34
352 0.25
353 0.19
354 0.1
355 0.08
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.12
365 0.17
366 0.23
367 0.24
368 0.26
369 0.28
370 0.29
371 0.3
372 0.27
373 0.24
374 0.2
375 0.2
376 0.18
377 0.16
378 0.14
379 0.12
380 0.09
381 0.09
382 0.06
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.06
398 0.06
399 0.05
400 0.04
401 0.03
402 0.03
403 0.04
404 0.04
405 0.05
406 0.06
407 0.06
408 0.09
409 0.1
410 0.11
411 0.12
412 0.15
413 0.16
414 0.2
415 0.2
416 0.17
417 0.16
418 0.14
419 0.14
420 0.11
421 0.09
422 0.05
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.04
432 0.04
433 0.05
434 0.06
435 0.08
436 0.08
437 0.09
438 0.09
439 0.12
440 0.12
441 0.16
442 0.17
443 0.16
444 0.18
445 0.2
446 0.21
447 0.22
448 0.29
449 0.29
450 0.31
451 0.32
452 0.32
453 0.32
454 0.33
455 0.31
456 0.23
457 0.19
458 0.17
459 0.15
460 0.15
461 0.11
462 0.1
463 0.08
464 0.08
465 0.09
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.08
470 0.1
471 0.11
472 0.12
473 0.11
474 0.12
475 0.12
476 0.12
477 0.11
478 0.11
479 0.11
480 0.11
481 0.11
482 0.12
483 0.11
484 0.1
485 0.1
486 0.12
487 0.12
488 0.11
489 0.11
490 0.12
491 0.13
492 0.14
493 0.17
494 0.22
495 0.26
496 0.28
497 0.31
498 0.37
499 0.38
500 0.39
501 0.39
502 0.32
503 0.29
504 0.26
505 0.26
506 0.21
507 0.19
508 0.18
509 0.15
510 0.15
511 0.14
512 0.14
513 0.13
514 0.12
515 0.14
516 0.17
517 0.22
518 0.24
519 0.23
520 0.23
521 0.22
522 0.23
523 0.23
524 0.26
525 0.25
526 0.26
527 0.28
528 0.27
529 0.27
530 0.27
531 0.24
532 0.18
533 0.15
534 0.13
535 0.12
536 0.13
537 0.13
538 0.15
539 0.16
540 0.18
541 0.18
542 0.18
543 0.21
544 0.25
545 0.28
546 0.34
547 0.43
548 0.51
549 0.61
550 0.63
551 0.61
552 0.61
553 0.64
554 0.64
555 0.65
556 0.65
557 0.64
558 0.65
559 0.68
560 0.64
561 0.59
562 0.54
563 0.51
564 0.48
565 0.49
566 0.52
567 0.52
568 0.53
569 0.52
570 0.49
571 0.46
572 0.41
573 0.32
574 0.31
575 0.33
576 0.38
577 0.39
578 0.41
579 0.45
580 0.45
581 0.44
582 0.39
583 0.34
584 0.35
585 0.35
586 0.34
587 0.26
588 0.24
589 0.24
590 0.23
591 0.21
592 0.13
593 0.12
594 0.09
595 0.08
596 0.07
597 0.07
598 0.06
599 0.06
600 0.05
601 0.05
602 0.06
603 0.06
604 0.06
605 0.06
606 0.08
607 0.09
608 0.09
609 0.09
610 0.1
611 0.12
612 0.11
613 0.11
614 0.1
615 0.09
616 0.09
617 0.1
618 0.07
619 0.06
620 0.06
621 0.05
622 0.07
623 0.09
624 0.1
625 0.13
626 0.23
627 0.31
628 0.39
629 0.42
630 0.42
631 0.49
632 0.53
633 0.52
634 0.53
635 0.52
636 0.47
637 0.54
638 0.59
639 0.54
640 0.52
641 0.53
642 0.44
643 0.37
644 0.35
645 0.28
646 0.22
647 0.19
648 0.16