Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HME8

Protein Details
Accession A0A179HME8    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-37SPALSHHQKQQQQQQQQQQQQQQQQQQHydrophilic
279-301AAPNSTRTRRAPRKHTTKEEANFHydrophilic
338-358SGCNKKFVRKTDLQRHHQSVHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
KEGG plj:VFPFJ_04880  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00096  zf-C2H2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MDLTPSPVIPSPALSHHQKQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPPPLPPQNRHQEAQQHRQHQQQHATPHYGMVPNRSSAPSAARYPPAALFDLDRGSSSMTSRPLLGRPHQAIAPRTITEPQWEYSHQLPPVLAASHELFSNYDVVQPQEPVAEIYHAHPSPNQEWAARHAAHIAGDRTVHPVVHSSEFAYAPHDVGMLGVNPHDPPSGPSSHQALTLPTCPSDDAADTLLSTSINAFPSQSPPRFVTQGWIRPGDSNLLPQGVPSASTAPASAAPNSTRTRRAPRKHTTKEEANFQCTVEGCGKFFSRSYNYKSHLETHDDQREYPFPCLVSGCNKKFVRKTDLQRHHQSVHVKERNHRCDYCGRLFARKDTLRRSVDTTSCPAASTLNADTGRLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.37
3 0.42
4 0.51
5 0.55
6 0.61
7 0.66
8 0.71
9 0.74
10 0.78
11 0.81
12 0.82
13 0.84
14 0.84
15 0.83
16 0.82
17 0.8
18 0.8
19 0.78
20 0.77
21 0.77
22 0.77
23 0.77
24 0.77
25 0.77
26 0.77
27 0.77
28 0.77
29 0.77
30 0.77
31 0.77
32 0.75
33 0.74
34 0.69
35 0.65
36 0.66
37 0.66
38 0.64
39 0.6
40 0.62
41 0.66
42 0.66
43 0.63
44 0.59
45 0.6
46 0.62
47 0.68
48 0.67
49 0.64
50 0.64
51 0.69
52 0.71
53 0.69
54 0.69
55 0.64
56 0.64
57 0.61
58 0.62
59 0.54
60 0.48
61 0.44
62 0.4
63 0.35
64 0.33
65 0.29
66 0.26
67 0.28
68 0.28
69 0.25
70 0.22
71 0.26
72 0.24
73 0.26
74 0.29
75 0.28
76 0.28
77 0.29
78 0.29
79 0.27
80 0.24
81 0.2
82 0.17
83 0.17
84 0.18
85 0.16
86 0.14
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.14
92 0.15
93 0.15
94 0.16
95 0.18
96 0.21
97 0.25
98 0.28
99 0.33
100 0.33
101 0.34
102 0.35
103 0.38
104 0.36
105 0.35
106 0.34
107 0.26
108 0.26
109 0.25
110 0.24
111 0.23
112 0.24
113 0.21
114 0.21
115 0.21
116 0.22
117 0.24
118 0.28
119 0.24
120 0.22
121 0.2
122 0.18
123 0.19
124 0.16
125 0.13
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.11
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.15
149 0.14
150 0.14
151 0.15
152 0.19
153 0.19
154 0.23
155 0.22
156 0.18
157 0.19
158 0.23
159 0.27
160 0.23
161 0.22
162 0.19
163 0.18
164 0.18
165 0.19
166 0.15
167 0.1
168 0.11
169 0.11
170 0.13
171 0.13
172 0.12
173 0.1
174 0.11
175 0.13
176 0.14
177 0.14
178 0.11
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.12
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.07
199 0.1
200 0.12
201 0.13
202 0.15
203 0.18
204 0.18
205 0.19
206 0.18
207 0.16
208 0.15
209 0.17
210 0.16
211 0.13
212 0.13
213 0.12
214 0.12
215 0.11
216 0.1
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.08
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.08
231 0.15
232 0.21
233 0.22
234 0.23
235 0.25
236 0.27
237 0.28
238 0.28
239 0.29
240 0.3
241 0.36
242 0.36
243 0.36
244 0.34
245 0.33
246 0.34
247 0.3
248 0.24
249 0.19
250 0.16
251 0.16
252 0.14
253 0.13
254 0.14
255 0.1
256 0.11
257 0.09
258 0.1
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.13
267 0.13
268 0.19
269 0.22
270 0.25
271 0.27
272 0.32
273 0.42
274 0.5
275 0.58
276 0.63
277 0.71
278 0.79
279 0.83
280 0.86
281 0.84
282 0.83
283 0.78
284 0.78
285 0.72
286 0.65
287 0.56
288 0.47
289 0.4
290 0.31
291 0.3
292 0.25
293 0.21
294 0.17
295 0.19
296 0.2
297 0.19
298 0.2
299 0.23
300 0.24
301 0.3
302 0.35
303 0.41
304 0.44
305 0.48
306 0.5
307 0.5
308 0.48
309 0.49
310 0.48
311 0.49
312 0.53
313 0.5
314 0.48
315 0.46
316 0.47
317 0.42
318 0.39
319 0.32
320 0.23
321 0.24
322 0.24
323 0.23
324 0.27
325 0.34
326 0.35
327 0.43
328 0.45
329 0.51
330 0.56
331 0.61
332 0.6
333 0.6
334 0.68
335 0.69
336 0.78
337 0.79
338 0.82
339 0.82
340 0.75
341 0.71
342 0.69
343 0.66
344 0.67
345 0.65
346 0.6
347 0.63
348 0.71
349 0.74
350 0.75
351 0.67
352 0.61
353 0.63
354 0.66
355 0.65
356 0.62
357 0.56
358 0.57
359 0.59
360 0.6
361 0.61
362 0.6
363 0.59
364 0.59
365 0.66
366 0.61
367 0.61
368 0.61
369 0.59
370 0.57
371 0.54
372 0.52
373 0.47
374 0.43
375 0.4
376 0.34
377 0.28
378 0.24
379 0.23
380 0.2
381 0.22
382 0.22