Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HPF8

Protein Details
Accession A0A179HPF8    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-24PQDPNLYSQRPAKKQKRGTALSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
165-184RRRRGTRAEKEKMERRARRG
276-311RKRTEQERKAREDQKEARRREIEQRRRDMGARRAKR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025066  CCDC174-like  
KEGG plj:VFPFJ_04066  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13300  DUF4078  
Amino Acid Sequences MPQDPNLYSQRPAKKQKRGTALSTSLDFKAQLSSLVSNASSSGTTSGRARPSKAPKDDIFRHKPKQAEKGDTNKLVLKEVAGTEEEAEQLARAKRKLEDKARRYAAMKRGDYVPGENEAEPLVDFDRKWTEGREDKDGYASTTSSDSDEDETADEIIEWDDEFGRRRRGTRAEKEKMERRARRGLLGAEELERMSARPAAPSQLIYGDAIQSMAFNPDDPDKMEELAQKRDRSATPPEMKHYDADREIRTKGVGFYKFSKDEEGRKREFASLEEERKRTEQERKAREDQKEARRREIEQRRRDMGARRAKRQADSFLDGLTDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.8
3 0.85
4 0.87
5 0.83
6 0.79
7 0.77
8 0.73
9 0.66
10 0.59
11 0.53
12 0.44
13 0.38
14 0.33
15 0.24
16 0.2
17 0.17
18 0.15
19 0.15
20 0.15
21 0.15
22 0.16
23 0.16
24 0.13
25 0.13
26 0.13
27 0.1
28 0.09
29 0.12
30 0.1
31 0.13
32 0.15
33 0.21
34 0.28
35 0.31
36 0.34
37 0.41
38 0.51
39 0.59
40 0.63
41 0.64
42 0.61
43 0.67
44 0.72
45 0.73
46 0.73
47 0.72
48 0.72
49 0.69
50 0.71
51 0.69
52 0.7
53 0.68
54 0.67
55 0.65
56 0.68
57 0.71
58 0.67
59 0.62
60 0.56
61 0.48
62 0.41
63 0.34
64 0.25
65 0.19
66 0.17
67 0.16
68 0.13
69 0.12
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.09
74 0.08
75 0.06
76 0.1
77 0.14
78 0.17
79 0.17
80 0.2
81 0.24
82 0.32
83 0.41
84 0.47
85 0.54
86 0.56
87 0.65
88 0.66
89 0.65
90 0.6
91 0.58
92 0.55
93 0.54
94 0.49
95 0.41
96 0.4
97 0.39
98 0.38
99 0.32
100 0.25
101 0.19
102 0.2
103 0.18
104 0.16
105 0.14
106 0.13
107 0.11
108 0.1
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.09
113 0.12
114 0.13
115 0.14
116 0.15
117 0.2
118 0.25
119 0.29
120 0.33
121 0.32
122 0.31
123 0.32
124 0.31
125 0.26
126 0.2
127 0.17
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.03
147 0.04
148 0.05
149 0.08
150 0.1
151 0.16
152 0.17
153 0.19
154 0.24
155 0.32
156 0.41
157 0.49
158 0.57
159 0.59
160 0.63
161 0.69
162 0.71
163 0.72
164 0.72
165 0.67
166 0.62
167 0.65
168 0.6
169 0.55
170 0.5
171 0.42
172 0.35
173 0.31
174 0.26
175 0.18
176 0.17
177 0.14
178 0.12
179 0.1
180 0.08
181 0.07
182 0.09
183 0.08
184 0.09
185 0.1
186 0.12
187 0.13
188 0.13
189 0.13
190 0.11
191 0.12
192 0.11
193 0.1
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.09
205 0.1
206 0.12
207 0.14
208 0.13
209 0.14
210 0.16
211 0.2
212 0.21
213 0.3
214 0.34
215 0.32
216 0.32
217 0.36
218 0.35
219 0.35
220 0.39
221 0.4
222 0.43
223 0.45
224 0.49
225 0.49
226 0.49
227 0.48
228 0.43
229 0.38
230 0.35
231 0.37
232 0.35
233 0.34
234 0.34
235 0.32
236 0.3
237 0.25
238 0.25
239 0.27
240 0.27
241 0.27
242 0.32
243 0.38
244 0.39
245 0.39
246 0.42
247 0.38
248 0.45
249 0.52
250 0.55
251 0.52
252 0.52
253 0.53
254 0.5
255 0.48
256 0.4
257 0.38
258 0.38
259 0.43
260 0.47
261 0.46
262 0.45
263 0.46
264 0.5
265 0.48
266 0.5
267 0.5
268 0.54
269 0.62
270 0.67
271 0.75
272 0.78
273 0.77
274 0.77
275 0.78
276 0.78
277 0.78
278 0.74
279 0.74
280 0.7
281 0.69
282 0.7
283 0.71
284 0.71
285 0.71
286 0.76
287 0.71
288 0.71
289 0.72
290 0.7
291 0.69
292 0.69
293 0.68
294 0.67
295 0.71
296 0.72
297 0.73
298 0.7
299 0.69
300 0.65
301 0.62
302 0.55
303 0.46