Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HP00

Protein Details
Accession A0A179HP00    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
215-234AAAGRKRKKRWDVSSAPSEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
218-224GRKRKKR
Subcellular Location(s) plas 17, nucl 4.5, cyto_nucl 4.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR021133  HEAT_type_2  
IPR015016  SF3b_su1  
IPR038737  SF3b_su1-like  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000245  P:spliceosomal complex assembly  
KEGG plj:VFPFJ_05232  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08920  SF3b1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50077  HEAT_REPEAT  
Amino Acid Sequences MSDADFRAVTKSQQERNAASAAKKGSRGLDVAAAQRTDSTRQKLTDSADNDLYDKDAGDKYAGYHTSLPMGDDDDDMAVDTTRRLVGQYTASREMIDEFARGDGVEEEDILANRGEKSGRIIDRETDYQKRRFNRVLTPTRADPFAENRQAGAAENGTTYREIMESQELDREEERVRRAIQAKQAENEASENGDLRPTLQHPDKENEDAGSTEAAAAGRKRKKRWDVSSAPSEEKPQTEEAAAPTKRSRWDEIPTLPEKQRSRWDQAPSATPMANSGQATPAPASQVPSLPVAFGTDAGRSFGISDEELDLLLPGEDQGYKILEFPPGFVQLRAPTHRAMATPAPASGFMMQDPDQVRLGGAPMPAEISGVGDLQFLKPEDMNYFGKLNDGADESSMSVDELKERKIMKLLLKIKNGTPPMRKTALRQITDNARQFGAGPLFAQILPLLMEKTLEEQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNVAKAAGLATMISVMRPDIDNVDDYVRNTTARAFAVVASALSIPALLPFLRAVCGSKKSWHARHTGVKIVQQIAILMGCAILPHLKGLVDCIAPNLNDEQTKVRTVTSLAIAALAEASNPYGIESFDEILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGFIIPLMDEEYANYYTTQIMEILLREFSSPDEEMKKVVLKVVSQCAATKGVAANYLKDHVLDDFFKSFWVRRMALDKRNYKQVVETTVDIGQKVGVSEILERIVNNLKDESEPYRKMTVETIEKIISSLGAADIDERLEERLVDGILYAFQEQTVEDIVILNGFGSVVNALGDRCGPFLPQITSTILWRLNNKSPTVRQQAADLISRIAMVMKQCGEDELMGKLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILGALRSIVTVVGIAQMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLSNLRVQERQSRVNTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKALSFLFEYIGEMGKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHIALGVVGLGCEDAMVHLLNLLYPNLFETSPHVIDRIIEAIEGIRMAVGPGVVLNYVWAGLFHPARKVRTPYWRLYNDAYIQGADSMVPYYPNLEEETLDRSELGIML
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.51
3 0.53
4 0.55
5 0.5
6 0.44
7 0.43
8 0.41
9 0.4
10 0.39
11 0.39
12 0.37
13 0.36
14 0.35
15 0.31
16 0.31
17 0.3
18 0.32
19 0.33
20 0.3
21 0.27
22 0.28
23 0.29
24 0.3
25 0.34
26 0.35
27 0.37
28 0.39
29 0.42
30 0.44
31 0.47
32 0.49
33 0.44
34 0.44
35 0.42
36 0.4
37 0.38
38 0.34
39 0.3
40 0.22
41 0.19
42 0.17
43 0.14
44 0.14
45 0.15
46 0.15
47 0.15
48 0.22
49 0.23
50 0.22
51 0.23
52 0.23
53 0.26
54 0.26
55 0.25
56 0.18
57 0.2
58 0.18
59 0.16
60 0.16
61 0.12
62 0.11
63 0.11
64 0.1
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.09
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.14
74 0.22
75 0.28
76 0.33
77 0.37
78 0.37
79 0.36
80 0.35
81 0.34
82 0.28
83 0.23
84 0.17
85 0.13
86 0.14
87 0.14
88 0.13
89 0.12
90 0.1
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.1
95 0.11
96 0.12
97 0.12
98 0.11
99 0.1
100 0.11
101 0.13
102 0.12
103 0.12
104 0.17
105 0.24
106 0.27
107 0.3
108 0.32
109 0.35
110 0.4
111 0.46
112 0.47
113 0.49
114 0.52
115 0.55
116 0.61
117 0.63
118 0.65
119 0.66
120 0.65
121 0.65
122 0.69
123 0.71
124 0.71
125 0.71
126 0.68
127 0.63
128 0.59
129 0.5
130 0.43
131 0.4
132 0.42
133 0.43
134 0.38
135 0.35
136 0.35
137 0.34
138 0.31
139 0.26
140 0.18
141 0.12
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.13
146 0.12
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.11
151 0.16
152 0.16
153 0.17
154 0.21
155 0.21
156 0.23
157 0.23
158 0.23
159 0.22
160 0.26
161 0.28
162 0.28
163 0.29
164 0.34
165 0.38
166 0.41
167 0.46
168 0.5
169 0.51
170 0.48
171 0.51
172 0.44
173 0.41
174 0.36
175 0.28
176 0.21
177 0.17
178 0.16
179 0.12
180 0.13
181 0.11
182 0.11
183 0.14
184 0.14
185 0.21
186 0.26
187 0.31
188 0.35
189 0.41
190 0.44
191 0.44
192 0.44
193 0.37
194 0.32
195 0.27
196 0.24
197 0.18
198 0.13
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.12
204 0.2
205 0.28
206 0.35
207 0.42
208 0.51
209 0.61
210 0.69
211 0.76
212 0.77
213 0.78
214 0.79
215 0.82
216 0.76
217 0.7
218 0.6
219 0.56
220 0.47
221 0.4
222 0.35
223 0.27
224 0.24
225 0.21
226 0.21
227 0.2
228 0.27
229 0.27
230 0.27
231 0.27
232 0.3
233 0.35
234 0.38
235 0.4
236 0.36
237 0.42
238 0.46
239 0.49
240 0.52
241 0.49
242 0.51
243 0.49
244 0.51
245 0.47
246 0.46
247 0.5
248 0.49
249 0.54
250 0.54
251 0.58
252 0.57
253 0.58
254 0.58
255 0.52
256 0.49
257 0.41
258 0.34
259 0.3
260 0.25
261 0.24
262 0.19
263 0.16
264 0.15
265 0.14
266 0.16
267 0.15
268 0.14
269 0.13
270 0.13
271 0.15
272 0.14
273 0.16
274 0.16
275 0.17
276 0.16
277 0.14
278 0.13
279 0.12
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.09
284 0.1
285 0.11
286 0.11
287 0.09
288 0.1
289 0.09
290 0.1
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.09
296 0.09
297 0.08
298 0.06
299 0.06
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.05
304 0.05
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.09
309 0.1
310 0.13
311 0.13
312 0.15
313 0.16
314 0.2
315 0.21
316 0.2
317 0.21
318 0.21
319 0.27
320 0.29
321 0.29
322 0.24
323 0.26
324 0.27
325 0.25
326 0.24
327 0.22
328 0.21
329 0.2
330 0.19
331 0.18
332 0.17
333 0.17
334 0.14
335 0.12
336 0.09
337 0.11
338 0.11
339 0.15
340 0.16
341 0.17
342 0.16
343 0.16
344 0.15
345 0.12
346 0.13
347 0.11
348 0.1
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.11
368 0.15
369 0.16
370 0.16
371 0.17
372 0.15
373 0.16
374 0.15
375 0.14
376 0.11
377 0.11
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.1
388 0.11
389 0.12
390 0.16
391 0.17
392 0.18
393 0.22
394 0.26
395 0.26
396 0.34
397 0.42
398 0.46
399 0.49
400 0.5
401 0.49
402 0.51
403 0.51
404 0.47
405 0.45
406 0.42
407 0.43
408 0.46
409 0.45
410 0.42
411 0.48
412 0.5
413 0.45
414 0.43
415 0.41
416 0.45
417 0.52
418 0.51
419 0.42
420 0.33
421 0.31
422 0.3
423 0.29
424 0.21
425 0.13
426 0.1
427 0.1
428 0.11
429 0.1
430 0.1
431 0.07
432 0.06
433 0.06
434 0.07
435 0.06
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.08
440 0.11
441 0.12
442 0.12
443 0.13
444 0.16
445 0.18
446 0.18
447 0.16
448 0.15
449 0.14
450 0.18
451 0.2
452 0.18
453 0.18
454 0.18
455 0.18
456 0.18
457 0.18
458 0.13
459 0.13
460 0.14
461 0.14
462 0.15
463 0.17
464 0.16
465 0.17
466 0.18
467 0.18
468 0.16
469 0.15
470 0.13
471 0.13
472 0.14
473 0.13
474 0.12
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.06
480 0.04
481 0.03
482 0.04
483 0.05
484 0.05
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.07
489 0.09
490 0.1
491 0.12
492 0.12
493 0.14
494 0.14
495 0.14
496 0.13
497 0.12
498 0.1
499 0.07
500 0.07
501 0.05
502 0.04
503 0.03
504 0.03
505 0.04
506 0.04
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.06
515 0.07
516 0.08
517 0.1
518 0.1
519 0.11
520 0.12
521 0.12
522 0.11
523 0.11
524 0.11
525 0.1
526 0.1
527 0.1
528 0.09
529 0.08
530 0.09
531 0.08
532 0.07
533 0.06
534 0.06
535 0.05
536 0.04
537 0.04
538 0.03
539 0.03
540 0.04
541 0.03
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.05
546 0.06
547 0.07
548 0.09
549 0.13
550 0.14
551 0.17
552 0.25
553 0.32
554 0.38
555 0.4
556 0.42
557 0.44
558 0.51
559 0.5
560 0.49
561 0.43
562 0.4
563 0.38
564 0.35
565 0.3
566 0.23
567 0.2
568 0.13
569 0.11
570 0.08
571 0.05
572 0.04
573 0.03
574 0.03
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.03
579 0.04
580 0.04
581 0.04
582 0.05
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.08
587 0.09
588 0.08
589 0.09
590 0.09
591 0.08
592 0.08
593 0.1
594 0.12
595 0.12
596 0.13
597 0.13
598 0.12
599 0.11
600 0.12
601 0.13
602 0.11
603 0.1
604 0.08
605 0.08
606 0.08
607 0.07
608 0.06
609 0.04
610 0.03
611 0.03
612 0.03
613 0.03
614 0.03
615 0.03
616 0.03
617 0.04
618 0.05
619 0.05
620 0.06
621 0.06
622 0.06
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.06
627 0.05
628 0.05
629 0.06
630 0.08
631 0.13
632 0.22
633 0.24
634 0.25
635 0.31
636 0.34
637 0.36
638 0.36
639 0.37
640 0.32
641 0.3
642 0.29
643 0.24
644 0.2
645 0.18
646 0.15
647 0.08
648 0.05
649 0.03
650 0.03
651 0.03
652 0.03
653 0.04
654 0.04
655 0.04
656 0.04
657 0.07
658 0.08
659 0.08
660 0.08
661 0.08
662 0.08
663 0.08
664 0.08
665 0.06
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.06
672 0.06
673 0.06
674 0.06
675 0.09
676 0.09
677 0.1
678 0.12
679 0.13
680 0.13
681 0.14
682 0.16
683 0.13
684 0.15
685 0.14
686 0.13
687 0.16
688 0.19
689 0.19
690 0.18
691 0.18
692 0.17
693 0.18
694 0.16
695 0.14
696 0.11
697 0.1
698 0.14
699 0.14
700 0.13
701 0.13
702 0.14
703 0.13
704 0.12
705 0.12
706 0.09
707 0.11
708 0.1
709 0.11
710 0.11
711 0.11
712 0.11
713 0.12
714 0.13
715 0.15
716 0.19
717 0.18
718 0.2
719 0.28
720 0.34
721 0.4
722 0.48
723 0.51
724 0.49
725 0.57
726 0.55
727 0.48
728 0.45
729 0.4
730 0.36
731 0.31
732 0.29
733 0.22
734 0.25
735 0.24
736 0.2
737 0.17
738 0.13
739 0.11
740 0.1
741 0.08
742 0.05
743 0.05
744 0.06
745 0.07
746 0.07
747 0.07
748 0.07
749 0.09
750 0.14
751 0.14
752 0.15
753 0.15
754 0.15
755 0.15
756 0.18
757 0.21
758 0.23
759 0.24
760 0.26
761 0.29
762 0.28
763 0.28
764 0.29
765 0.28
766 0.27
767 0.27
768 0.26
769 0.24
770 0.23
771 0.22
772 0.2
773 0.14
774 0.08
775 0.06
776 0.04
777 0.04
778 0.04
779 0.04
780 0.04
781 0.05
782 0.05
783 0.05
784 0.05
785 0.05
786 0.05
787 0.05
788 0.06
789 0.06
790 0.06
791 0.06
792 0.05
793 0.05
794 0.06
795 0.06
796 0.05
797 0.05
798 0.05
799 0.05
800 0.06
801 0.06
802 0.05
803 0.05
804 0.06
805 0.05
806 0.05
807 0.05
808 0.04
809 0.03
810 0.03
811 0.03
812 0.03
813 0.03
814 0.03
815 0.04
816 0.04
817 0.04
818 0.04
819 0.05
820 0.06
821 0.07
822 0.07
823 0.07
824 0.08
825 0.11
826 0.13
827 0.13
828 0.15
829 0.16
830 0.17
831 0.17
832 0.2
833 0.2
834 0.2
835 0.23
836 0.26
837 0.31
838 0.34
839 0.36
840 0.38
841 0.4
842 0.47
843 0.51
844 0.49
845 0.42
846 0.4
847 0.42
848 0.39
849 0.36
850 0.28
851 0.2
852 0.17
853 0.17
854 0.14
855 0.1
856 0.09
857 0.08
858 0.1
859 0.1
860 0.11
861 0.11
862 0.12
863 0.12
864 0.11
865 0.11
866 0.1
867 0.1
868 0.09
869 0.08
870 0.08
871 0.07
872 0.06
873 0.06
874 0.05
875 0.04
876 0.05
877 0.05
878 0.06
879 0.06
880 0.06
881 0.06
882 0.06
883 0.06
884 0.05
885 0.05
886 0.04
887 0.04
888 0.04
889 0.04
890 0.05
891 0.04
892 0.04
893 0.04
894 0.04
895 0.04
896 0.04
897 0.04
898 0.03
899 0.03
900 0.04
901 0.05
902 0.05
903 0.05
904 0.06
905 0.09
906 0.1
907 0.1
908 0.11
909 0.12
910 0.13
911 0.16
912 0.17
913 0.21
914 0.23
915 0.24
916 0.26
917 0.28
918 0.33
919 0.37
920 0.46
921 0.45
922 0.5
923 0.53
924 0.59
925 0.62
926 0.64
927 0.61
928 0.61
929 0.57
930 0.53
931 0.5
932 0.42
933 0.35
934 0.28
935 0.23
936 0.14
937 0.11
938 0.08
939 0.08
940 0.08
941 0.09
942 0.1
943 0.11
944 0.14
945 0.17
946 0.2
947 0.22
948 0.23
949 0.23
950 0.26
951 0.25
952 0.24
953 0.24
954 0.22
955 0.21
956 0.19
957 0.18
958 0.19
959 0.19
960 0.19
961 0.15
962 0.18
963 0.22
964 0.22
965 0.24
966 0.22
967 0.27
968 0.33
969 0.43
970 0.49
971 0.5
972 0.59
973 0.65
974 0.72
975 0.67
976 0.6
977 0.51
978 0.41
979 0.36
980 0.28
981 0.2
982 0.11
983 0.13
984 0.13
985 0.12
986 0.11
987 0.11
988 0.11
989 0.1
990 0.09
991 0.07
992 0.07
993 0.07
994 0.08
995 0.09
996 0.1
997 0.11
998 0.13
999 0.15
1000 0.17
1001 0.26
1002 0.3
1003 0.37
1004 0.39
1005 0.44
1006 0.43
1007 0.44
1008 0.42
1009 0.33
1010 0.28
1011 0.2
1012 0.17
1013 0.11
1014 0.09
1015 0.06
1016 0.06
1017 0.05
1018 0.04
1019 0.04
1020 0.04
1021 0.05
1022 0.05
1023 0.06
1024 0.09
1025 0.1
1026 0.1
1027 0.11
1028 0.16
1029 0.16
1030 0.18
1031 0.18
1032 0.17
1033 0.18
1034 0.18
1035 0.19
1036 0.2
1037 0.23
1038 0.25
1039 0.26
1040 0.25
1041 0.26
1042 0.25
1043 0.24
1044 0.18
1045 0.14
1046 0.11
1047 0.1
1048 0.11
1049 0.08
1050 0.08
1051 0.08
1052 0.08
1053 0.1
1054 0.1
1055 0.11
1056 0.1
1057 0.1
1058 0.1
1059 0.09
1060 0.09
1061 0.09
1062 0.08
1063 0.07
1064 0.08
1065 0.08
1066 0.08
1067 0.08
1068 0.08
1069 0.08
1070 0.07
1071 0.06
1072 0.07
1073 0.1
1074 0.1
1075 0.1
1076 0.11
1077 0.14
1078 0.19
1079 0.21
1080 0.23
1081 0.2
1082 0.2
1083 0.22
1084 0.27
1085 0.3
1086 0.27
1087 0.27
1088 0.26
1089 0.26
1090 0.25
1091 0.23
1092 0.18
1093 0.11
1094 0.1
1095 0.08
1096 0.06
1097 0.05
1098 0.05
1099 0.05
1100 0.04
1101 0.04
1102 0.04
1103 0.03
1104 0.04
1105 0.05
1106 0.05
1107 0.06
1108 0.06
1109 0.07
1110 0.09
1111 0.09
1112 0.08
1113 0.08
1114 0.1
1115 0.11
1116 0.11
1117 0.1
1118 0.14
1119 0.21
1120 0.23
1121 0.24
1122 0.23
1123 0.21
1124 0.22
1125 0.23
1126 0.21
1127 0.14
1128 0.11
1129 0.11
1130 0.11
1131 0.11
1132 0.1
1133 0.08
1134 0.06
1135 0.05
1136 0.06
1137 0.06
1138 0.05
1139 0.05
1140 0.05
1141 0.06
1142 0.06
1143 0.06
1144 0.06
1145 0.06
1146 0.06
1147 0.06
1148 0.06
1149 0.06
1150 0.12
1151 0.16
1152 0.17
1153 0.25
1154 0.31
1155 0.36
1156 0.43
1157 0.49
1158 0.52
1159 0.59
1160 0.65
1161 0.66
1162 0.7
1163 0.7
1164 0.68
1165 0.66
1166 0.65
1167 0.58
1168 0.55
1169 0.47
1170 0.37
1171 0.33
1172 0.28
1173 0.23
1174 0.15
1175 0.12
1176 0.09
1177 0.08
1178 0.09
1179 0.08
1180 0.11
1181 0.11
1182 0.13
1183 0.15
1184 0.15
1185 0.15
1186 0.16
1187 0.21
1188 0.2
1189 0.19
1190 0.18
1191 0.15