Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I3EJV5

Protein Details
Accession I3EJV5    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-35KEDSKAKKTFDCDKKRKDKIKPERVLRIPCDBasic
295-315GSAFSKKDPRRENKEVPREVNHydrophilic
392-417ISTPHMKSTSPKKQDKTKPVPRAIIAHydrophilic
440-459APSPGQAPDKEKKRREKTFCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-25KRKDKIK
451-453KKR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
Amino Acid Sequences MNTQKEDSKAKKTFDCDKKRKDKIKPERVLRIPCDIKKGDFYKVTLHNSENGTGRVVDFNEREIRFSEYTESDSTVVYEYTHKVDNIVSIEPMIQSLQKEKSVKNNIVIVTMRTGTTGYGELQRETKDVLVLDNFVFFSDGSIPYDITIKKVLIREYLKLNVPVGEVIDSEELERTFQVDDEISKKKEGQEGRVKEFQPFYSSKDTPVNESIHKAGHGKRVWNQFEANEKLFGMKATFDESMYTTVLDKNSKEYKKYAHEAECIARKIDKPSSSNPHIEEERGRISNKPEDEKYGSAFSKKDPRRENKEVPREVNEPVKEVPVKEFKETVNEPIKEETKEPINEPAVEVNEITKEVKDMTKDVSQTDPKSTESAEVSGIPETKQNNIQRNIISTPHMKSTSPKKQDKTKPVPRAIIAQAGVDLSDMVFSSMRNKNKADSAPSPGQAPDKEKKRREKTFC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.75
3 0.75
4 0.79
5 0.84
6 0.89
7 0.92
8 0.92
9 0.92
10 0.92
11 0.93
12 0.92
13 0.91
14 0.91
15 0.89
16 0.88
17 0.8
18 0.79
19 0.76
20 0.69
21 0.68
22 0.6
23 0.54
24 0.54
25 0.54
26 0.51
27 0.46
28 0.44
29 0.44
30 0.49
31 0.52
32 0.48
33 0.46
34 0.44
35 0.43
36 0.44
37 0.39
38 0.32
39 0.28
40 0.24
41 0.23
42 0.21
43 0.2
44 0.22
45 0.2
46 0.23
47 0.3
48 0.3
49 0.3
50 0.29
51 0.33
52 0.28
53 0.29
54 0.29
55 0.23
56 0.26
57 0.26
58 0.26
59 0.21
60 0.2
61 0.19
62 0.16
63 0.14
64 0.11
65 0.13
66 0.13
67 0.15
68 0.17
69 0.17
70 0.17
71 0.17
72 0.19
73 0.19
74 0.18
75 0.16
76 0.13
77 0.14
78 0.13
79 0.13
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.14
84 0.17
85 0.23
86 0.26
87 0.28
88 0.38
89 0.45
90 0.47
91 0.46
92 0.48
93 0.43
94 0.43
95 0.42
96 0.33
97 0.26
98 0.24
99 0.19
100 0.15
101 0.14
102 0.1
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.15
107 0.16
108 0.17
109 0.19
110 0.19
111 0.19
112 0.19
113 0.18
114 0.14
115 0.13
116 0.13
117 0.12
118 0.13
119 0.12
120 0.12
121 0.11
122 0.09
123 0.1
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.1
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.15
133 0.14
134 0.13
135 0.14
136 0.13
137 0.16
138 0.19
139 0.21
140 0.23
141 0.26
142 0.26
143 0.29
144 0.32
145 0.31
146 0.29
147 0.28
148 0.22
149 0.2
150 0.18
151 0.14
152 0.11
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.06
167 0.08
168 0.12
169 0.17
170 0.17
171 0.18
172 0.19
173 0.21
174 0.26
175 0.27
176 0.32
177 0.37
178 0.41
179 0.46
180 0.51
181 0.49
182 0.46
183 0.45
184 0.37
185 0.32
186 0.28
187 0.26
188 0.28
189 0.28
190 0.27
191 0.32
192 0.31
193 0.3
194 0.32
195 0.31
196 0.24
197 0.26
198 0.24
199 0.19
200 0.19
201 0.19
202 0.18
203 0.24
204 0.25
205 0.26
206 0.31
207 0.4
208 0.41
209 0.4
210 0.38
211 0.31
212 0.36
213 0.37
214 0.31
215 0.23
216 0.2
217 0.19
218 0.18
219 0.16
220 0.1
221 0.07
222 0.06
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.1
231 0.08
232 0.09
233 0.11
234 0.12
235 0.11
236 0.16
237 0.24
238 0.25
239 0.27
240 0.28
241 0.32
242 0.37
243 0.42
244 0.42
245 0.37
246 0.38
247 0.38
248 0.4
249 0.39
250 0.34
251 0.3
252 0.26
253 0.23
254 0.26
255 0.29
256 0.29
257 0.27
258 0.33
259 0.41
260 0.43
261 0.45
262 0.42
263 0.42
264 0.38
265 0.36
266 0.32
267 0.27
268 0.27
269 0.26
270 0.25
271 0.22
272 0.26
273 0.3
274 0.31
275 0.33
276 0.3
277 0.33
278 0.36
279 0.35
280 0.33
281 0.32
282 0.29
283 0.26
284 0.26
285 0.24
286 0.31
287 0.34
288 0.41
289 0.45
290 0.54
291 0.61
292 0.7
293 0.76
294 0.77
295 0.83
296 0.81
297 0.75
298 0.71
299 0.64
300 0.57
301 0.54
302 0.44
303 0.37
304 0.31
305 0.31
306 0.27
307 0.25
308 0.28
309 0.29
310 0.3
311 0.3
312 0.31
313 0.28
314 0.34
315 0.34
316 0.36
317 0.37
318 0.36
319 0.36
320 0.38
321 0.4
322 0.34
323 0.34
324 0.3
325 0.28
326 0.29
327 0.29
328 0.3
329 0.3
330 0.29
331 0.29
332 0.28
333 0.23
334 0.22
335 0.2
336 0.14
337 0.13
338 0.13
339 0.13
340 0.1
341 0.09
342 0.11
343 0.13
344 0.14
345 0.15
346 0.18
347 0.22
348 0.23
349 0.24
350 0.3
351 0.33
352 0.34
353 0.37
354 0.35
355 0.32
356 0.32
357 0.31
358 0.27
359 0.23
360 0.22
361 0.18
362 0.17
363 0.17
364 0.17
365 0.17
366 0.14
367 0.17
368 0.17
369 0.19
370 0.26
371 0.32
372 0.39
373 0.42
374 0.46
375 0.44
376 0.48
377 0.47
378 0.41
379 0.39
380 0.34
381 0.33
382 0.35
383 0.35
384 0.31
385 0.36
386 0.44
387 0.51
388 0.56
389 0.62
390 0.63
391 0.72
392 0.82
393 0.86
394 0.86
395 0.86
396 0.86
397 0.85
398 0.84
399 0.76
400 0.73
401 0.64
402 0.6
403 0.49
404 0.39
405 0.32
406 0.25
407 0.23
408 0.16
409 0.13
410 0.06
411 0.06
412 0.05
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.14
417 0.22
418 0.28
419 0.33
420 0.34
421 0.38
422 0.45
423 0.51
424 0.51
425 0.49
426 0.52
427 0.53
428 0.53
429 0.51
430 0.45
431 0.45
432 0.41
433 0.44
434 0.45
435 0.49
436 0.58
437 0.65
438 0.74
439 0.79