FuNGI

A0A179HQC6

Protein Details

Accession

A0A179HQC6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
368-388	RMNVRQQTKFCQKHRKQTALE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
272-287	KQKKPRLRAKKHAVAA

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 6, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
KEGG	plj:VFPFJ_03370 -
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MYPSRVLGLSKNQKPPPLLSQVGKESAKKPTFKQLKIPKAFDDPPVSSDEDDDQGTPIKAQESSSSAKRSNEDADLDALLRSSGSSGDERATRGGIRRTSFRGKTGNAKRKSDDDDPDSSQGADHITSTSASTKRRRVNGKGTTYGGGSGHSQAPASSAEHLQDERGFTKVRASKATYGKKKSSSQSQTDKEEVKKVAKLKLHVPEPLVSPEKPKAGKLRAPSGSPPPPSTESSLKLTQGSGDEKLKTIVSPPRRKQVFKTVNSIESLLSAKQKKPRLRAKKHAVAARSPSPPPAVFKMPTSFSQFKVQAGEGGEGHLPGIDSDSDDSIAIVEKADTEAEADAAATTCPWCGEPVDKAALNDFSKGKRMNVRQQTKFCQKHRKQTALETWQAKGYPDVQWHDLTERFAKHRGHLLGIVNGNASHYRSILADRIASGQARSLRKEDNLNPGYYGPRGFNLMCDYLVGEFSDLLKTRAVDDRVIAGRGSAAFIQAVLVAELAVRLVEDDMGVGEEEARRIMEESKTIGELVHEEQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.63
3	0.6
4	0.58
5	0.56
6	0.49
7	0.52
8	0.52
9	0.56
10	0.53
11	0.5
12	0.45
13	0.5
14	0.53
15	0.51
16	0.49
17	0.53
18	0.6
19	0.6
20	0.66
21	0.67
22	0.71
23	0.75
24	0.76
25	0.69
26	0.68
27	0.67
28	0.62
29	0.59
30	0.5
31	0.43
32	0.42
33	0.39
34	0.31
35	0.3
36	0.26
37	0.21
38	0.2
39	0.18
40	0.16
41	0.17
42	0.17
43	0.16
44	0.15
45	0.14
46	0.14
47	0.15
48	0.17
49	0.19
50	0.24
51	0.29
52	0.33
53	0.35
54	0.37
55	0.38
56	0.39
57	0.39
58	0.38
59	0.34
60	0.3
61	0.28
62	0.26
63	0.24
64	0.2
65	0.16
66	0.12
67	0.09
68	0.07
69	0.06
70	0.06
71	0.08
72	0.09
73	0.1
74	0.13
75	0.15
76	0.17
77	0.17
78	0.18
79	0.18
80	0.23
81	0.28
82	0.31
83	0.33
84	0.36
85	0.42
86	0.5
87	0.51
88	0.51
89	0.5
90	0.48
91	0.56
92	0.62
93	0.65
94	0.63
95	0.65
96	0.63
97	0.62
98	0.65
99	0.62
100	0.58
101	0.54
102	0.52
103	0.5
104	0.49
105	0.44
106	0.37
107	0.29
108	0.23
109	0.18
110	0.13
111	0.1
112	0.08
113	0.08
114	0.08
115	0.09
116	0.14
117	0.17
118	0.23
119	0.3
120	0.37
121	0.44
122	0.52
123	0.59
124	0.62
125	0.68
126	0.72
127	0.72
128	0.69
129	0.64
130	0.57
131	0.49
132	0.43
133	0.32
134	0.23
135	0.17
136	0.15
137	0.14
138	0.13
139	0.12
140	0.11
141	0.12
142	0.12
143	0.12
144	0.11
145	0.11
146	0.11
147	0.13
148	0.13
149	0.13
150	0.13
151	0.15
152	0.13
153	0.15
154	0.15
155	0.13
156	0.21
157	0.25
158	0.26
159	0.29
160	0.32
161	0.38
162	0.46
163	0.57
164	0.57
165	0.6
166	0.62
167	0.64
168	0.66
169	0.63
170	0.64
171	0.61
172	0.61
173	0.64
174	0.63
175	0.62
176	0.6
177	0.6
178	0.52
179	0.5
180	0.45
181	0.38
182	0.37
183	0.36
184	0.38
185	0.36
186	0.36
187	0.37
188	0.41
189	0.41
190	0.39
191	0.37
192	0.33
193	0.32
194	0.34
195	0.3
196	0.23
197	0.24
198	0.24
199	0.28
200	0.26
201	0.27
202	0.3
203	0.33
204	0.37
205	0.38
206	0.44
207	0.41
208	0.42
209	0.42
210	0.42
211	0.42
212	0.4
213	0.37
214	0.33
215	0.33
216	0.33
217	0.34
218	0.3
219	0.27
220	0.3
221	0.3
222	0.27
223	0.24
224	0.22
225	0.19
226	0.18
227	0.17
228	0.15
229	0.15
230	0.15
231	0.15
232	0.16
233	0.15
234	0.13
235	0.15
236	0.19
237	0.26
238	0.36
239	0.39
240	0.47
241	0.51
242	0.53
243	0.53
244	0.58
245	0.58
246	0.51
247	0.55
248	0.48
249	0.46
250	0.45
251	0.42
252	0.3
253	0.21
254	0.19
255	0.12
256	0.15
257	0.16
258	0.18
259	0.24
260	0.32
261	0.36
262	0.45
263	0.54
264	0.61
265	0.68
266	0.75
267	0.78
268	0.79
269	0.79
270	0.74
271	0.66
272	0.58
273	0.54
274	0.49
275	0.42
276	0.34
277	0.3
278	0.28
279	0.27
280	0.25
281	0.24
282	0.22
283	0.2
284	0.21
285	0.23
286	0.22
287	0.24
288	0.29
289	0.27
290	0.26
291	0.31
292	0.3
293	0.28
294	0.28
295	0.26
296	0.21
297	0.2
298	0.19
299	0.13
300	0.13
301	0.12
302	0.1
303	0.1
304	0.07
305	0.06
306	0.04
307	0.06
308	0.04
309	0.05
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.05
316	0.06
317	0.05
318	0.05
319	0.04
320	0.04
321	0.05
322	0.05
323	0.04
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.05
337	0.05
338	0.06
339	0.09
340	0.1
341	0.13
342	0.17
343	0.17
344	0.17
345	0.18
346	0.22
347	0.2
348	0.21
349	0.2
350	0.18
351	0.23
352	0.25
353	0.27
354	0.31
355	0.38
356	0.45
357	0.54
358	0.62
359	0.65
360	0.7
361	0.75
362	0.78
363	0.79
364	0.77
365	0.78
366	0.76
367	0.79
368	0.81
369	0.81
370	0.74
371	0.74
372	0.76
373	0.72
374	0.72
375	0.63
376	0.54
377	0.48
378	0.45
379	0.36
380	0.27
381	0.22
382	0.19
383	0.22
384	0.24
385	0.25
386	0.25
387	0.26
388	0.27
389	0.27
390	0.26
391	0.26
392	0.26
393	0.26
394	0.32
395	0.32
396	0.32
397	0.38
398	0.37
399	0.35
400	0.35
401	0.35
402	0.34
403	0.33
404	0.31
405	0.23
406	0.21
407	0.2
408	0.16
409	0.15
410	0.1
411	0.1
412	0.1
413	0.1
414	0.13
415	0.15
416	0.15
417	0.15
418	0.15
419	0.18
420	0.19
421	0.18
422	0.16
423	0.18
424	0.23
425	0.26
426	0.28
427	0.29
428	0.31
429	0.34
430	0.42
431	0.43
432	0.47
433	0.46
434	0.45
435	0.42
436	0.4
437	0.39
438	0.32
439	0.29
440	0.19
441	0.17
442	0.2
443	0.19
444	0.2
445	0.22
446	0.22
447	0.2
448	0.19
449	0.18
450	0.15
451	0.16
452	0.13
453	0.09
454	0.08
455	0.09
456	0.13
457	0.13
458	0.14
459	0.15
460	0.15
461	0.18
462	0.25
463	0.26
464	0.22
465	0.23
466	0.29
467	0.29
468	0.3
469	0.27
470	0.2
471	0.19
472	0.18
473	0.19
474	0.12
475	0.11
476	0.09
477	0.09
478	0.1
479	0.09
480	0.09
481	0.07
482	0.07
483	0.06
484	0.06
485	0.06
486	0.05
487	0.04
488	0.03
489	0.04
490	0.04
491	0.05
492	0.05
493	0.05
494	0.05
495	0.06
496	0.07
497	0.06
498	0.07
499	0.09
500	0.09
501	0.1
502	0.1
503	0.1
504	0.11
505	0.15
506	0.17
507	0.19
508	0.21
509	0.23
510	0.24
511	0.23
512	0.22
513	0.19

A0A179HQC6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer