FuNGI

A0A179HVH9

Protein Details

Accession

A0A179HVH9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
702-724	APEHPFYCRKIPPRLRMRLAPSP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 11, extr 7, cyto 4, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
KEGG	plj:VFPFJ_03055 -
Pfam	View protein in Pfam PF00075 RNase_H PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1 PS50878 RT_POL
CDD	cd09276 Rnase_HI_RT_non_LTR cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MIEKPGKRDLSKPRAWRPISLLSCLGKGLERLIARRLAWASIHYGVLQPQQIGALPKRSAVDLVAALIHDIEVALARGMVATLVTMDVQGAFDTVMRNRLILRLRQQGWPLNLVKWAASFMQARLAAVRFQDITTPPSPLECGLAQGFPASPILFALYIAPIYRLGNFGGRFGYADDTAMLRVGYSLDETTALASRDMQELLAWGASNGVTFDPDKTEIMHFSRKKDPARPLIFQNDTEIVPADSMRWLGLWLDRKLSFNTHVDEWTAKARRIANHLKALANTRQGPLPSAVRRAVKACIEPTLFYGVEAWYPGQMAPGTGNATRLVSTQIKHLVDRFDAVLRHAIRAALPIWKTTPVPALHREAGIPPASILLESQRIRFSARLKSLDVRHPLVARTSPKPARAYHSSIKRKFLVERRSQKTRLERTDALLLNCARPVLLPRQYSDSEASPLQTATKADTAEEFLEWLKDAAVGKLIVYSDGSQLPSGAVGYGFTVQRNEQPIAHGSGRLGPAEVFDAEAVGALEGLQAAIAAAVNTTTSIVVCIDNLAVATCLRGNPADSSQDAFTKFQDLARAHGDVEVRWIPGHAGIPGNEEADSLAKAGCLLPEPPGAVPSLAHLRRLARQQPRDAFKAWWTTEAPESYKPMHLEVTTSCPPELMLPRATLHSVLAARSRHGDFADYHERFNHDDACLDCSCGRRKAPEHPFYCRKIPPRLRMRLAPSPAEAIHHAVGKGFKAFVEMTSESSFFQRICPRH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.78
2	0.78
3	0.75
4	0.71
5	0.71
6	0.65
7	0.6
8	0.55
9	0.47
10	0.45
11	0.4
12	0.33
13	0.24
14	0.22
15	0.19
16	0.2
17	0.2
18	0.22
19	0.26
20	0.3
21	0.29
22	0.33
23	0.33
24	0.29
25	0.28
26	0.27
27	0.27
28	0.25
29	0.25
30	0.2
31	0.2
32	0.21
33	0.24
34	0.24
35	0.19
36	0.17
37	0.17
38	0.19
39	0.23
40	0.24
41	0.27
42	0.25
43	0.28
44	0.29
45	0.29
46	0.27
47	0.23
48	0.22
49	0.15
50	0.16
51	0.14
52	0.13
53	0.12
54	0.11
55	0.09
56	0.06
57	0.05
58	0.04
59	0.04
60	0.05
61	0.05
62	0.04
63	0.04
64	0.05
65	0.05
66	0.04
67	0.04
68	0.03
69	0.04
70	0.04
71	0.04
72	0.04
73	0.05
74	0.05
75	0.05
76	0.05
77	0.05
78	0.05
79	0.06
80	0.09
81	0.1
82	0.14
83	0.14
84	0.15
85	0.15
86	0.21
87	0.26
88	0.3
89	0.36
90	0.42
91	0.44
92	0.49
93	0.53
94	0.54
95	0.52
96	0.52
97	0.47
98	0.38
99	0.39
100	0.34
101	0.29
102	0.23
103	0.22
104	0.15
105	0.17
106	0.17
107	0.15
108	0.21
109	0.21
110	0.21
111	0.21
112	0.22
113	0.2
114	0.18
115	0.21
116	0.14
117	0.14
118	0.18
119	0.17
120	0.22
121	0.21
122	0.22
123	0.2
124	0.2
125	0.21
126	0.17
127	0.18
128	0.13
129	0.15
130	0.14
131	0.14
132	0.14
133	0.13
134	0.13
135	0.1
136	0.12
137	0.08
138	0.07
139	0.07
140	0.08
141	0.07
142	0.07
143	0.08
144	0.07
145	0.07
146	0.08
147	0.08
148	0.08
149	0.09
150	0.09
151	0.1
152	0.1
153	0.15
154	0.15
155	0.16
156	0.15
157	0.15
158	0.15
159	0.15
160	0.16
161	0.11
162	0.11
163	0.11
164	0.1
165	0.1
166	0.1
167	0.09
168	0.06
169	0.06
170	0.06
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.06
175	0.07
176	0.07
177	0.08
178	0.1
179	0.1
180	0.09
181	0.09
182	0.1
183	0.12
184	0.12
185	0.11
186	0.09
187	0.09
188	0.09
189	0.09
190	0.07
191	0.05
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.06
196	0.05
197	0.06
198	0.07
199	0.07
200	0.1
201	0.11
202	0.12
203	0.13
204	0.14
205	0.16
206	0.2
207	0.29
208	0.29
209	0.32
210	0.4
211	0.45
212	0.49
213	0.54
214	0.58
215	0.59
216	0.63
217	0.61
218	0.58
219	0.6
220	0.57
221	0.5
222	0.44
223	0.36
224	0.3
225	0.27
226	0.22
227	0.14
228	0.11
229	0.11
230	0.08
231	0.07
232	0.07
233	0.06
234	0.05
235	0.06
236	0.06
237	0.1
238	0.16
239	0.17
240	0.21
241	0.22
242	0.24
243	0.25
244	0.27
245	0.27
246	0.23
247	0.25
248	0.23
249	0.22
250	0.21
251	0.21
252	0.19
253	0.23
254	0.23
255	0.21
256	0.23
257	0.26
258	0.28
259	0.35
260	0.43
261	0.41
262	0.45
263	0.47
264	0.44
265	0.42
266	0.44
267	0.39
268	0.35
269	0.31
270	0.25
271	0.25
272	0.24
273	0.24
274	0.22
275	0.24
276	0.21
277	0.24
278	0.27
279	0.26
280	0.27
281	0.28
282	0.28
283	0.25
284	0.25
285	0.22
286	0.22
287	0.21
288	0.2
289	0.2
290	0.2
291	0.18
292	0.15
293	0.15
294	0.11
295	0.1
296	0.1
297	0.09
298	0.05
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.06
305	0.07
306	0.09
307	0.09
308	0.1
309	0.09
310	0.1
311	0.1
312	0.1
313	0.12
314	0.13
315	0.13
316	0.15
317	0.2
318	0.21
319	0.21
320	0.22
321	0.2
322	0.18
323	0.19
324	0.17
325	0.13
326	0.13
327	0.13
328	0.17
329	0.15
330	0.16
331	0.15
332	0.14
333	0.12
334	0.13
335	0.13
336	0.12
337	0.12
338	0.12
339	0.12
340	0.14
341	0.14
342	0.13
343	0.18
344	0.15
345	0.18
346	0.21
347	0.24
348	0.23
349	0.23
350	0.23
351	0.18
352	0.19
353	0.16
354	0.13
355	0.09
356	0.08
357	0.08
358	0.07
359	0.07
360	0.06
361	0.11
362	0.11
363	0.13
364	0.13
365	0.13
366	0.15
367	0.17
368	0.2
369	0.21
370	0.25
371	0.27
372	0.28
373	0.32
374	0.35
375	0.39
376	0.39
377	0.34
378	0.31
379	0.29
380	0.28
381	0.25
382	0.25
383	0.23
384	0.21
385	0.27
386	0.28
387	0.31
388	0.34
389	0.34
390	0.36
391	0.38
392	0.42
393	0.41
394	0.49
395	0.54
396	0.54
397	0.57
398	0.53
399	0.5
400	0.5
401	0.52
402	0.51
403	0.51
404	0.58
405	0.6
406	0.65
407	0.66
408	0.66
409	0.67
410	0.66
411	0.62
412	0.59
413	0.54
414	0.49
415	0.54
416	0.49
417	0.4
418	0.35
419	0.3
420	0.23
421	0.22
422	0.19
423	0.12
424	0.1
425	0.12
426	0.14
427	0.2
428	0.21
429	0.22
430	0.27
431	0.28
432	0.3
433	0.29
434	0.24
435	0.19
436	0.19
437	0.18
438	0.14
439	0.13
440	0.12
441	0.11
442	0.1
443	0.1
444	0.11
445	0.11
446	0.1
447	0.11
448	0.12
449	0.12
450	0.11
451	0.1
452	0.08
453	0.08
454	0.08
455	0.07
456	0.05
457	0.06
458	0.07
459	0.07
460	0.08
461	0.08
462	0.07
463	0.09
464	0.08
465	0.07
466	0.07
467	0.08
468	0.08
469	0.1
470	0.1
471	0.09
472	0.09
473	0.09
474	0.08
475	0.07
476	0.06
477	0.04
478	0.04
479	0.05
480	0.07
481	0.07
482	0.08
483	0.09
484	0.09
485	0.13
486	0.17
487	0.18
488	0.16
489	0.18
490	0.2
491	0.23
492	0.23
493	0.2
494	0.16
495	0.19
496	0.2
497	0.18
498	0.16
499	0.11
500	0.11
501	0.12
502	0.11
503	0.08
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.05
509	0.04
510	0.03
511	0.03
512	0.03
513	0.03
514	0.03
515	0.02
516	0.02
517	0.02
518	0.02
519	0.02
520	0.02
521	0.02
522	0.03
523	0.03
524	0.03
525	0.04
526	0.04
527	0.03
528	0.04
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.06
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.05
537	0.05
538	0.05
539	0.05
540	0.06
541	0.06
542	0.07
543	0.08
544	0.09
545	0.11
546	0.13
547	0.15
548	0.15
549	0.18
550	0.18
551	0.2
552	0.21
553	0.19
554	0.18
555	0.17
556	0.17
557	0.16
558	0.22
559	0.2
560	0.21
561	0.23
562	0.23
563	0.21
564	0.23
565	0.23
566	0.16
567	0.2
568	0.18
569	0.16
570	0.15
571	0.15
572	0.13
573	0.14
574	0.15
575	0.11
576	0.12
577	0.12
578	0.16
579	0.16
580	0.17
581	0.14
582	0.13
583	0.12
584	0.11
585	0.11
586	0.08
587	0.07
588	0.06
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.08
593	0.08
594	0.1
595	0.12
596	0.13
597	0.13
598	0.13
599	0.13
600	0.12
601	0.11
602	0.12
603	0.2
604	0.2
605	0.21
606	0.23
607	0.25
608	0.31
609	0.39
610	0.45
611	0.45
612	0.52
613	0.6
614	0.66
615	0.69
616	0.68
617	0.62
618	0.56
619	0.51
620	0.53
621	0.44
622	0.4
623	0.35
624	0.34
625	0.36
626	0.37
627	0.35
628	0.29
629	0.32
630	0.3
631	0.33
632	0.31
633	0.28
634	0.28
635	0.24
636	0.24
637	0.22
638	0.28
639	0.27
640	0.28
641	0.26
642	0.23
643	0.23
644	0.26
645	0.29
646	0.26
647	0.24
648	0.24
649	0.25
650	0.27
651	0.28
652	0.23
653	0.19
654	0.19
655	0.18
656	0.18
657	0.22
658	0.21
659	0.22
660	0.26
661	0.27
662	0.25
663	0.24
664	0.25
665	0.21
666	0.28
667	0.37
668	0.33
669	0.33
670	0.34
671	0.36
672	0.35
673	0.37
674	0.33
675	0.23
676	0.25
677	0.25
678	0.28
679	0.26
680	0.26
681	0.25
682	0.27
683	0.32
684	0.35
685	0.37
686	0.4
687	0.45
688	0.53
689	0.62
690	0.66
691	0.66
692	0.69
693	0.75
694	0.72
695	0.75
696	0.72
697	0.69
698	0.7
699	0.74
700	0.75
701	0.77
702	0.81
703	0.8
704	0.8
705	0.81
706	0.8
707	0.76
708	0.69
709	0.61
710	0.55
711	0.48
712	0.43
713	0.36
714	0.31
715	0.27
716	0.26
717	0.24
718	0.22
719	0.24
720	0.22
721	0.22
722	0.19
723	0.16
724	0.17
725	0.18
726	0.16
727	0.21
728	0.2
729	0.23
730	0.25
731	0.26
732	0.23
733	0.25
734	0.26
735	0.18
736	0.24

A0A179HVH9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer