Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179GY93

Protein Details
Accession A0A179GY93    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-57LAAPEPPSKRARRALKKGKALPAKPHydrophilic
288-312DAGEKQKQKQFKTRKWWVNRMLGRQHydrophilic
340-361GARAPRERSERQHNGRRRDDDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
39-56PSKRARRALKKGKALPAK
326-356KKRFTKGGAGAGGPGARAPRERSERQHNGRR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG plj:VFPFJ_08749  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAAKEGTPPADAGSPDKTSTKRKSAVDEIEVDLAAPEPPSKRARRALKKGKALPAKPSSDDENDGDGEDKKENKEKVRSEHAVWIGNLPFSATPELIRRWLVDNSGGVITDESITRIKLPTTKEPGRDKSQKPANKGFAYVDFAELGPKVGAVALSENDMGGRKLLIKDATSFEGRPAKEKEPADGAEAGGDAQSRSDANASRKVFVGNMSFGTTEDDLRKNFEKCGEIEWVKLATFEDSGKCKGFGWVKFKEPEAAAWAVKGFVKIKEQIETEDDFKDEEDEDEDADAGEKQKQKQFKTRKWWVNRMLGRQLKLELAEDDQTRYKKRFTKGGAGAGGPGARAPRERSERQHNGRRRDDDAGEPAKQTAQELQEARLMGKVVPHTGTKMTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.29
4 0.32
5 0.39
6 0.46
7 0.52
8 0.55
9 0.56
10 0.62
11 0.66
12 0.69
13 0.64
14 0.59
15 0.52
16 0.47
17 0.42
18 0.34
19 0.25
20 0.18
21 0.13
22 0.1
23 0.11
24 0.1
25 0.16
26 0.25
27 0.3
28 0.37
29 0.47
30 0.57
31 0.65
32 0.75
33 0.81
34 0.82
35 0.87
36 0.88
37 0.88
38 0.87
39 0.79
40 0.78
41 0.75
42 0.7
43 0.62
44 0.58
45 0.53
46 0.47
47 0.47
48 0.4
49 0.34
50 0.3
51 0.27
52 0.26
53 0.22
54 0.2
55 0.2
56 0.21
57 0.22
58 0.29
59 0.34
60 0.4
61 0.48
62 0.52
63 0.56
64 0.63
65 0.63
66 0.58
67 0.61
68 0.57
69 0.52
70 0.45
71 0.42
72 0.33
73 0.29
74 0.25
75 0.18
76 0.15
77 0.12
78 0.14
79 0.1
80 0.11
81 0.15
82 0.17
83 0.18
84 0.19
85 0.18
86 0.2
87 0.21
88 0.21
89 0.19
90 0.18
91 0.18
92 0.18
93 0.16
94 0.13
95 0.11
96 0.1
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.1
104 0.11
105 0.15
106 0.19
107 0.27
108 0.35
109 0.4
110 0.47
111 0.54
112 0.59
113 0.64
114 0.68
115 0.62
116 0.63
117 0.67
118 0.64
119 0.63
120 0.66
121 0.64
122 0.56
123 0.55
124 0.47
125 0.4
126 0.39
127 0.32
128 0.24
129 0.17
130 0.16
131 0.15
132 0.13
133 0.11
134 0.07
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.09
153 0.1
154 0.11
155 0.13
156 0.15
157 0.17
158 0.17
159 0.16
160 0.17
161 0.22
162 0.21
163 0.24
164 0.26
165 0.26
166 0.31
167 0.31
168 0.3
169 0.28
170 0.29
171 0.26
172 0.22
173 0.2
174 0.13
175 0.12
176 0.11
177 0.07
178 0.06
179 0.04
180 0.03
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.06
185 0.09
186 0.12
187 0.2
188 0.21
189 0.22
190 0.22
191 0.22
192 0.21
193 0.2
194 0.18
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.11
199 0.11
200 0.13
201 0.11
202 0.11
203 0.12
204 0.14
205 0.13
206 0.17
207 0.2
208 0.18
209 0.19
210 0.21
211 0.21
212 0.19
213 0.22
214 0.25
215 0.22
216 0.21
217 0.22
218 0.19
219 0.17
220 0.17
221 0.14
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.11
226 0.13
227 0.15
228 0.15
229 0.16
230 0.15
231 0.19
232 0.24
233 0.27
234 0.31
235 0.33
236 0.37
237 0.39
238 0.39
239 0.38
240 0.32
241 0.27
242 0.24
243 0.23
244 0.18
245 0.16
246 0.16
247 0.13
248 0.13
249 0.14
250 0.11
251 0.11
252 0.15
253 0.19
254 0.21
255 0.24
256 0.24
257 0.24
258 0.26
259 0.26
260 0.25
261 0.21
262 0.2
263 0.16
264 0.15
265 0.14
266 0.11
267 0.1
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.12
278 0.16
279 0.21
280 0.26
281 0.33
282 0.38
283 0.48
284 0.58
285 0.62
286 0.69
287 0.75
288 0.81
289 0.83
290 0.87
291 0.85
292 0.85
293 0.82
294 0.79
295 0.78
296 0.74
297 0.66
298 0.58
299 0.51
300 0.42
301 0.36
302 0.31
303 0.22
304 0.19
305 0.21
306 0.19
307 0.21
308 0.25
309 0.28
310 0.31
311 0.32
312 0.37
313 0.4
314 0.45
315 0.51
316 0.52
317 0.59
318 0.61
319 0.66
320 0.61
321 0.54
322 0.49
323 0.41
324 0.35
325 0.24
326 0.19
327 0.12
328 0.11
329 0.14
330 0.18
331 0.25
332 0.34
333 0.41
334 0.48
335 0.57
336 0.67
337 0.74
338 0.8
339 0.8
340 0.81
341 0.84
342 0.81
343 0.76
344 0.72
345 0.65
346 0.61
347 0.61
348 0.56
349 0.48
350 0.44
351 0.4
352 0.35
353 0.32
354 0.27
355 0.24
356 0.22
357 0.27
358 0.28
359 0.29
360 0.3
361 0.31
362 0.29
363 0.26
364 0.24
365 0.17
366 0.2
367 0.21
368 0.21
369 0.23
370 0.24
371 0.25
372 0.28