Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HH00

Protein Details
Accession A0A179HH00    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
126-145VRDKRRSRIRLLGPRRQRQEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
130-133RRSR
Subcellular Location(s) mito 19, cyto 5, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002867  IBR_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
KEGG plj:VFPFJ_05611  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
cd22585  Rcat_RBR_DEAH12-like  
Amino Acid Sequences MSLNNTPLPFNKNGKLTVQLVHSARLKIPTRVYDAVEQEIAEHKQAWVEQHLVYIAYPPSQSLRVLKLEGESREDVAKAKDTLEAIIGGEVLMRDGEAVWSPSFAANGPAFEKMRQLERELGILIVRDKRRSRIRLLGPRRQRQEAQQALTELSKADSSSTHVIELDAKQHSRAVKGGYQAIVAAIGKDKVSVDITTRRISVMGSELDHRAAREILRGKDLESWAKQEGGSIAECAICWTEAENPVQTSCKHVYCAGCFENLCLAGVDPGPSIQCQGDVGNCRKVVLKSELQAHLPSAALEDVLEAAFATHLARNLNHLKNCPTPDCPQIYRTAKPSEHQGDASGTGESPLITCPSCLKVVCTACNASHDGQTCAEHRDLISGGYEALEASKDENGIKNCPGCGIMIQKTFGCNHMTCPNCQTHLCWVCLETFSEGLLVYAHMRREHGGIGVAEFPHLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.47
3 0.44
4 0.41
5 0.38
6 0.39
7 0.36
8 0.39
9 0.4
10 0.37
11 0.36
12 0.41
13 0.41
14 0.39
15 0.44
16 0.44
17 0.47
18 0.48
19 0.49
20 0.46
21 0.46
22 0.43
23 0.38
24 0.32
25 0.26
26 0.28
27 0.26
28 0.21
29 0.18
30 0.15
31 0.17
32 0.19
33 0.2
34 0.19
35 0.2
36 0.19
37 0.2
38 0.2
39 0.18
40 0.17
41 0.17
42 0.15
43 0.14
44 0.13
45 0.13
46 0.15
47 0.17
48 0.19
49 0.19
50 0.23
51 0.25
52 0.26
53 0.26
54 0.27
55 0.31
56 0.3
57 0.32
58 0.29
59 0.27
60 0.27
61 0.26
62 0.24
63 0.21
64 0.23
65 0.19
66 0.18
67 0.19
68 0.19
69 0.19
70 0.17
71 0.15
72 0.12
73 0.11
74 0.1
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.05
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.05
84 0.06
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.09
92 0.12
93 0.11
94 0.12
95 0.13
96 0.17
97 0.17
98 0.18
99 0.21
100 0.19
101 0.25
102 0.25
103 0.27
104 0.29
105 0.29
106 0.3
107 0.26
108 0.25
109 0.18
110 0.17
111 0.17
112 0.19
113 0.2
114 0.26
115 0.28
116 0.35
117 0.44
118 0.49
119 0.52
120 0.55
121 0.63
122 0.67
123 0.74
124 0.76
125 0.77
126 0.81
127 0.79
128 0.75
129 0.67
130 0.63
131 0.65
132 0.62
133 0.55
134 0.48
135 0.44
136 0.4
137 0.37
138 0.3
139 0.19
140 0.13
141 0.1
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.11
146 0.14
147 0.14
148 0.14
149 0.13
150 0.14
151 0.16
152 0.16
153 0.16
154 0.16
155 0.16
156 0.16
157 0.18
158 0.19
159 0.18
160 0.19
161 0.18
162 0.18
163 0.2
164 0.22
165 0.2
166 0.19
167 0.18
168 0.15
169 0.13
170 0.1
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.08
179 0.08
180 0.1
181 0.16
182 0.19
183 0.2
184 0.2
185 0.19
186 0.18
187 0.18
188 0.16
189 0.12
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.12
194 0.13
195 0.13
196 0.12
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.13
201 0.18
202 0.18
203 0.2
204 0.2
205 0.2
206 0.23
207 0.24
208 0.23
209 0.19
210 0.21
211 0.19
212 0.19
213 0.18
214 0.15
215 0.14
216 0.11
217 0.1
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.05
225 0.04
226 0.05
227 0.07
228 0.09
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.14
234 0.13
235 0.15
236 0.16
237 0.16
238 0.16
239 0.19
240 0.2
241 0.2
242 0.25
243 0.21
244 0.2
245 0.19
246 0.18
247 0.17
248 0.15
249 0.14
250 0.09
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.1
265 0.15
266 0.19
267 0.22
268 0.22
269 0.23
270 0.25
271 0.25
272 0.27
273 0.27
274 0.27
275 0.25
276 0.31
277 0.33
278 0.31
279 0.31
280 0.26
281 0.21
282 0.18
283 0.15
284 0.1
285 0.08
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.04
297 0.05
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.14
302 0.22
303 0.28
304 0.3
305 0.32
306 0.35
307 0.4
308 0.44
309 0.42
310 0.38
311 0.36
312 0.4
313 0.43
314 0.41
315 0.36
316 0.42
317 0.43
318 0.42
319 0.44
320 0.45
321 0.4
322 0.4
323 0.47
324 0.42
325 0.4
326 0.37
327 0.34
328 0.28
329 0.28
330 0.27
331 0.18
332 0.13
333 0.11
334 0.1
335 0.09
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.09
341 0.1
342 0.13
343 0.16
344 0.15
345 0.17
346 0.22
347 0.26
348 0.28
349 0.3
350 0.3
351 0.28
352 0.31
353 0.32
354 0.26
355 0.26
356 0.26
357 0.24
358 0.23
359 0.25
360 0.24
361 0.24
362 0.23
363 0.2
364 0.18
365 0.19
366 0.17
367 0.15
368 0.15
369 0.11
370 0.11
371 0.1
372 0.1
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.06
377 0.07
378 0.08
379 0.09
380 0.11
381 0.17
382 0.19
383 0.22
384 0.26
385 0.27
386 0.26
387 0.26
388 0.25
389 0.2
390 0.21
391 0.24
392 0.26
393 0.27
394 0.29
395 0.29
396 0.31
397 0.31
398 0.3
399 0.28
400 0.22
401 0.25
402 0.31
403 0.33
404 0.33
405 0.38
406 0.4
407 0.38
408 0.39
409 0.37
410 0.39
411 0.42
412 0.41
413 0.37
414 0.33
415 0.31
416 0.32
417 0.31
418 0.22
419 0.17
420 0.16
421 0.15
422 0.14
423 0.12
424 0.1
425 0.09
426 0.1
427 0.13
428 0.16
429 0.17
430 0.19
431 0.2
432 0.22
433 0.23
434 0.21
435 0.22
436 0.2
437 0.2
438 0.22
439 0.2