Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179H589

Protein Details
Accession A0A179H589    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
244-264RSGKAGPVRKGPKNRGPFWRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
246-260GKAGPVRKGPKNRGP
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 10.833, cyto_mito 7.166, mito 6.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
KEGG plj:VFPFJ_05674  -  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MESCCTCAVIQPPTSSQAAEKALPQDRRVECCGRIICGKCIQDNPRFAKYCPYCQVSTVPSPLPQRLRDPPSYTSVPSTRATTTEASSAPPPYTPTATPNPSEPHEKPAHAGDPEKSEAAAQDTLHFLDHEHDSITSLSLKYGVPATALRRTNNLTSDHLLVGRKTILIPAEYYRAGVSLSPRPVDGEEEELRKSKIRRFMTSCKVSDYDVALLYLEQSAYDLGASIEAFLDDEAWERSHPMQRSGKAGPVRKGPKNRGPFWRGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.3
3 0.26
4 0.26
5 0.26
6 0.24
7 0.25
8 0.28
9 0.35
10 0.39
11 0.39
12 0.42
13 0.43
14 0.47
15 0.5
16 0.48
17 0.41
18 0.46
19 0.46
20 0.4
21 0.44
22 0.41
23 0.4
24 0.43
25 0.44
26 0.4
27 0.46
28 0.49
29 0.49
30 0.54
31 0.56
32 0.57
33 0.57
34 0.54
35 0.57
36 0.54
37 0.56
38 0.54
39 0.53
40 0.44
41 0.44
42 0.47
43 0.41
44 0.41
45 0.35
46 0.3
47 0.3
48 0.33
49 0.37
50 0.38
51 0.36
52 0.38
53 0.43
54 0.48
55 0.48
56 0.5
57 0.47
58 0.48
59 0.48
60 0.43
61 0.39
62 0.35
63 0.33
64 0.29
65 0.29
66 0.24
67 0.22
68 0.24
69 0.2
70 0.2
71 0.19
72 0.18
73 0.17
74 0.18
75 0.18
76 0.15
77 0.14
78 0.15
79 0.14
80 0.16
81 0.15
82 0.19
83 0.24
84 0.26
85 0.26
86 0.27
87 0.28
88 0.28
89 0.35
90 0.31
91 0.32
92 0.32
93 0.31
94 0.29
95 0.29
96 0.3
97 0.24
98 0.25
99 0.19
100 0.21
101 0.21
102 0.2
103 0.17
104 0.14
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.09
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.09
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.09
133 0.12
134 0.17
135 0.2
136 0.2
137 0.22
138 0.24
139 0.26
140 0.27
141 0.27
142 0.23
143 0.23
144 0.24
145 0.22
146 0.21
147 0.2
148 0.17
149 0.15
150 0.13
151 0.11
152 0.09
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.1
157 0.11
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.12
162 0.11
163 0.11
164 0.1
165 0.12
166 0.15
167 0.17
168 0.17
169 0.17
170 0.18
171 0.19
172 0.2
173 0.18
174 0.18
175 0.19
176 0.21
177 0.22
178 0.23
179 0.23
180 0.25
181 0.27
182 0.27
183 0.33
184 0.37
185 0.44
186 0.5
187 0.59
188 0.64
189 0.69
190 0.65
191 0.6
192 0.55
193 0.48
194 0.43
195 0.36
196 0.28
197 0.2
198 0.19
199 0.14
200 0.13
201 0.12
202 0.1
203 0.08
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.07
221 0.08
222 0.09
223 0.1
224 0.12
225 0.16
226 0.23
227 0.26
228 0.32
229 0.39
230 0.41
231 0.47
232 0.48
233 0.51
234 0.52
235 0.57
236 0.55
237 0.57
238 0.63
239 0.66
240 0.73
241 0.75
242 0.77
243 0.79
244 0.81
245 0.81