FuNGI

A0A179HUK0

Protein Details

Accession

A0A179HUK0

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
34-75	AAKSGARRMARRRPARGQNETPVFVSRRHRRRPSFNPANVHQ	Hydrophilic
107-134	APKPSSTGFPQHRRRWKPSASKQQKAGT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
37-50	SGARRMARRRPARG
61-64	RHRR

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
KEGG	plj:VFPFJ_02231 -
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MFDTLAASETSDSPMSPSHVGCGSCRQSQAGIMAAKSGARRMARRRPARGQNETPVFVSRRHRRRPSFNPANVHQFVTQVHSMDPTLLIGDIVERDSESRKPVQFSAPKPSSTGFPQHRRRWKPSASKQQKAGTQPDNASSAGSGPGTVDSGAPGQPVTQKQAFEEAERRRIDLENQQKLSSMSPQEIAQAQEDIMTGLNPALIQRLLQRANIDDQNGPSPFDPVPAQQQEAAAPPPEIKVEAPSKSTAVTSASTETKATSSSVRSSKKIAPDYDEDQAPAQIPSDLFPITDQPSSTHFPVPDVPDLDPSDPNFLQTLHEKYFPSLPSDPSKLAWMAPVPTKDSQADKESPYYPHPEIGVSALRFDFRGRFLSPRVSRSIPSTKGLHHHGEAPEAAGYTIAELARLARSAVPAQRCMAYQTLGRILYRLGRGEWGKTENDPIATGVWDAVKKGRVLESLMEAASGEGGHRGSRAYATEALWLFEKGGWKETHKGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.18
3	0.19
4	0.18
5	0.19
6	0.23
7	0.24
8	0.24
9	0.32
10	0.34
11	0.35
12	0.36
13	0.35
14	0.31
15	0.33
16	0.33
17	0.3
18	0.27
19	0.22
20	0.22
21	0.21
22	0.22
23	0.2
24	0.2
25	0.2
26	0.23
27	0.31
28	0.39
29	0.5
30	0.58
31	0.67
32	0.74
33	0.78
34	0.84
35	0.86
36	0.86
37	0.83
38	0.83
39	0.79
40	0.72
41	0.63
42	0.58
43	0.5
44	0.46
45	0.49
46	0.49
47	0.53
48	0.61
49	0.7
50	0.74
51	0.83
52	0.87
53	0.88
54	0.89
55	0.86
56	0.83
57	0.78
58	0.78
59	0.69
60	0.62
61	0.51
62	0.42
63	0.35
64	0.32
65	0.29
66	0.21
67	0.19
68	0.18
69	0.17
70	0.16
71	0.15
72	0.1
73	0.09
74	0.08
75	0.07
76	0.05
77	0.06
78	0.06
79	0.06
80	0.06
81	0.06
82	0.08
83	0.11
84	0.13
85	0.17
86	0.23
87	0.25
88	0.28
89	0.31
90	0.39
91	0.44
92	0.46
93	0.53
94	0.5
95	0.47
96	0.46
97	0.44
98	0.38
99	0.34
100	0.4
101	0.38
102	0.45
103	0.54
104	0.62
105	0.72
106	0.77
107	0.81
108	0.8
109	0.81
110	0.82
111	0.83
112	0.85
113	0.84
114	0.83
115	0.82
116	0.79
117	0.75
118	0.69
119	0.66
120	0.59
121	0.54
122	0.49
123	0.44
124	0.4
125	0.34
126	0.29
127	0.21
128	0.17
129	0.12
130	0.11
131	0.08
132	0.06
133	0.06
134	0.07
135	0.07
136	0.06
137	0.06
138	0.07
139	0.07
140	0.07
141	0.07
142	0.07
143	0.11
144	0.13
145	0.18
146	0.19
147	0.19
148	0.2
149	0.27
150	0.27
151	0.26
152	0.33
153	0.32
154	0.37
155	0.37
156	0.37
157	0.32
158	0.32
159	0.33
160	0.34
161	0.39
162	0.4
163	0.41
164	0.41
165	0.4
166	0.39
167	0.37
168	0.32
169	0.24
170	0.16
171	0.16
172	0.16
173	0.17
174	0.17
175	0.17
176	0.13
177	0.12
178	0.1
179	0.1
180	0.09
181	0.08
182	0.07
183	0.05
184	0.05
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.07
193	0.13
194	0.14
195	0.15
196	0.16
197	0.16
198	0.2
199	0.21
200	0.21
201	0.16
202	0.16
203	0.19
204	0.19
205	0.18
206	0.14
207	0.15
208	0.13
209	0.14
210	0.13
211	0.11
212	0.17
213	0.17
214	0.18
215	0.16
216	0.17
217	0.16
218	0.16
219	0.16
220	0.1
221	0.09
222	0.09
223	0.09
224	0.08
225	0.08
226	0.07
227	0.1
228	0.13
229	0.14
230	0.15
231	0.15
232	0.16
233	0.15
234	0.15
235	0.12
236	0.1
237	0.1
238	0.09
239	0.11
240	0.11
241	0.11
242	0.12
243	0.11
244	0.1
245	0.1
246	0.1
247	0.09
248	0.1
249	0.15
250	0.22
251	0.24
252	0.25
253	0.29
254	0.32
255	0.37
256	0.4
257	0.37
258	0.34
259	0.36
260	0.37
261	0.36
262	0.32
263	0.25
264	0.21
265	0.2
266	0.16
267	0.12
268	0.09
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.08
273	0.08
274	0.07
275	0.07
276	0.1
277	0.11
278	0.12
279	0.11
280	0.11
281	0.15
282	0.19
283	0.2
284	0.2
285	0.18
286	0.19
287	0.22
288	0.24
289	0.23
290	0.21
291	0.2
292	0.21
293	0.22
294	0.22
295	0.2
296	0.18
297	0.2
298	0.18
299	0.19
300	0.16
301	0.15
302	0.15
303	0.17
304	0.21
305	0.18
306	0.21
307	0.21
308	0.22
309	0.26
310	0.25
311	0.27
312	0.24
313	0.25
314	0.27
315	0.3
316	0.3
317	0.26
318	0.27
319	0.22
320	0.2
321	0.18
322	0.15
323	0.14
324	0.17
325	0.18
326	0.2
327	0.2
328	0.23
329	0.23
330	0.25
331	0.26
332	0.27
333	0.29
334	0.28
335	0.31
336	0.31
337	0.32
338	0.31
339	0.34
340	0.29
341	0.27
342	0.26
343	0.22
344	0.2
345	0.2
346	0.22
347	0.16
348	0.17
349	0.16
350	0.15
351	0.15
352	0.16
353	0.15
354	0.13
355	0.17
356	0.17
357	0.2
358	0.23
359	0.33
360	0.36
361	0.37
362	0.41
363	0.39
364	0.38
365	0.42
366	0.48
367	0.41
368	0.41
369	0.4
370	0.37
371	0.41
372	0.45
373	0.41
374	0.34
375	0.37
376	0.33
377	0.33
378	0.3
379	0.26
380	0.21
381	0.17
382	0.16
383	0.1
384	0.09
385	0.07
386	0.08
387	0.07
388	0.06
389	0.06
390	0.08
391	0.08
392	0.09
393	0.09
394	0.08
395	0.11
396	0.16
397	0.21
398	0.24
399	0.25
400	0.27
401	0.28
402	0.27
403	0.28
404	0.25
405	0.22
406	0.2
407	0.21
408	0.25
409	0.25
410	0.25
411	0.22
412	0.22
413	0.25
414	0.26
415	0.24
416	0.2
417	0.25
418	0.27
419	0.29
420	0.33
421	0.31
422	0.3
423	0.29
424	0.33
425	0.29
426	0.28
427	0.25
428	0.22
429	0.19
430	0.18
431	0.16
432	0.13
433	0.13
434	0.13
435	0.13
436	0.17
437	0.19
438	0.19
439	0.22
440	0.24
441	0.23
442	0.26
443	0.27
444	0.27
445	0.26
446	0.26
447	0.23
448	0.19
449	0.17
450	0.14
451	0.12
452	0.07
453	0.07
454	0.07
455	0.08
456	0.08
457	0.09
458	0.1
459	0.13
460	0.15
461	0.17
462	0.2
463	0.21
464	0.27
465	0.27
466	0.27
467	0.25
468	0.24
469	0.2
470	0.19
471	0.25
472	0.2
473	0.26
474	0.28
475	0.31

A0A179HUK0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer