Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HHV4

Protein Details
Accession A0A179HHV4    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-74EDRASPPPRRRSPSPAHRRDBasic
214-233LEDFKYRKERHLRRYGLKNDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-74RRKRKASSPEARSDDGRAKRPRQGSEDRASPPPRRRSPSPAHRRD
92-93KR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039853  Pinin  
IPR006786  Pinin_SDK_MemA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG plj:VFPFJ_05560  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04696  Pinin_SDK_memA  
Amino Acid Sequences MATEQSALDVDAPASPPRASEHHSPTNEDRRKRKASSPEARSDDGRAKRPRQGSEDRASPPPRRRSPSPAHRRDSYGSGQERRPSVTQEDKKRGKRLFGGLLNTLSQTGSSSQQKRRQEIERRQQIKMKEQTAEDDKRRAEKKAELHKIRMEQQIHFEEQVMRNRHAKELRLAQFLRTRARPVIYYRPYRLTEREEDIIDDQISDVKVDIARDLEDFKYRKERHLRRYGLKNDIDSRPREPSPAPMRVPDIGPPPSPRPSANAEDADQHPETEDREVRDAEPIEQQPGPQSHHHDPHDDSGDVLVEGEEDMVIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.14
4 0.17
5 0.21
6 0.24
7 0.31
8 0.38
9 0.46
10 0.48
11 0.54
12 0.59
13 0.65
14 0.69
15 0.69
16 0.69
17 0.69
18 0.75
19 0.74
20 0.74
21 0.74
22 0.77
23 0.78
24 0.78
25 0.79
26 0.76
27 0.73
28 0.66
29 0.6
30 0.58
31 0.54
32 0.55
33 0.54
34 0.53
35 0.58
36 0.63
37 0.65
38 0.64
39 0.67
40 0.66
41 0.64
42 0.66
43 0.62
44 0.63
45 0.63
46 0.63
47 0.63
48 0.65
49 0.66
50 0.67
51 0.69
52 0.7
53 0.75
54 0.78
55 0.8
56 0.8
57 0.77
58 0.73
59 0.72
60 0.66
61 0.61
62 0.55
63 0.52
64 0.49
65 0.48
66 0.48
67 0.47
68 0.46
69 0.44
70 0.4
71 0.35
72 0.35
73 0.4
74 0.45
75 0.5
76 0.59
77 0.64
78 0.7
79 0.75
80 0.71
81 0.66
82 0.63
83 0.6
84 0.58
85 0.54
86 0.5
87 0.44
88 0.42
89 0.37
90 0.31
91 0.25
92 0.16
93 0.12
94 0.09
95 0.08
96 0.12
97 0.19
98 0.26
99 0.33
100 0.41
101 0.47
102 0.51
103 0.55
104 0.6
105 0.63
106 0.67
107 0.7
108 0.73
109 0.72
110 0.7
111 0.69
112 0.63
113 0.62
114 0.58
115 0.51
116 0.42
117 0.38
118 0.4
119 0.43
120 0.46
121 0.39
122 0.36
123 0.34
124 0.38
125 0.4
126 0.37
127 0.33
128 0.33
129 0.39
130 0.45
131 0.54
132 0.51
133 0.52
134 0.54
135 0.54
136 0.53
137 0.51
138 0.42
139 0.33
140 0.35
141 0.34
142 0.31
143 0.28
144 0.23
145 0.19
146 0.21
147 0.27
148 0.25
149 0.25
150 0.28
151 0.29
152 0.33
153 0.33
154 0.31
155 0.29
156 0.35
157 0.37
158 0.39
159 0.38
160 0.36
161 0.38
162 0.39
163 0.39
164 0.31
165 0.3
166 0.26
167 0.27
168 0.26
169 0.27
170 0.34
171 0.36
172 0.41
173 0.41
174 0.45
175 0.46
176 0.47
177 0.45
178 0.4
179 0.38
180 0.36
181 0.35
182 0.3
183 0.29
184 0.27
185 0.25
186 0.19
187 0.15
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.09
200 0.11
201 0.11
202 0.17
203 0.17
204 0.2
205 0.29
206 0.3
207 0.38
208 0.47
209 0.55
210 0.59
211 0.69
212 0.74
213 0.72
214 0.81
215 0.8
216 0.78
217 0.72
218 0.66
219 0.61
220 0.61
221 0.57
222 0.5
223 0.47
224 0.44
225 0.41
226 0.4
227 0.35
228 0.38
229 0.4
230 0.45
231 0.43
232 0.39
233 0.42
234 0.41
235 0.41
236 0.35
237 0.33
238 0.28
239 0.3
240 0.32
241 0.33
242 0.36
243 0.37
244 0.34
245 0.33
246 0.35
247 0.38
248 0.39
249 0.37
250 0.34
251 0.36
252 0.37
253 0.38
254 0.32
255 0.27
256 0.22
257 0.2
258 0.21
259 0.22
260 0.24
261 0.22
262 0.25
263 0.27
264 0.26
265 0.31
266 0.31
267 0.26
268 0.31
269 0.29
270 0.29
271 0.28
272 0.28
273 0.28
274 0.31
275 0.33
276 0.3
277 0.37
278 0.41
279 0.5
280 0.52
281 0.5
282 0.5
283 0.54
284 0.54
285 0.46
286 0.38
287 0.3
288 0.28
289 0.23
290 0.2
291 0.12
292 0.07
293 0.07
294 0.07