Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A179HFJ2

Protein Details
Accession A0A179HFJ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-81ENGTPTDKRKAKPPKGKRKMDPSRYSTRFIHydrophilic
153-172GLRVRSNRPLPKKRARLEGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-71KRKAKPPKGKRKM
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 7.5, pero 7, mito 6, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020097  PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom  
IPR020095  PsdUridine_synth_TruA_C  
IPR041707  Pus3-like  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG plj:VFPFJ_06755  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01416  PseudoU_synth_1  
CDD cd02569  PseudoU_synth_ScPus3  
Amino Acid Sequences MAGESNYNAWTKTGLIQRVKELEAELKARPAAPVPAEPASTELQATSTAGAENGTPTDKRKAKPPKGKRKMDPSRYSTRFIALKLAYLGKNYGGFEFQAMGNQPSIEEELWNALTKACLIFPEDERVVQFDCCEYSKCGRTDRGVSAFGQVIGLRVRSNRPLPKKRARLEGDGAADATAAVEQRPDEMEVEVDEAEEAQEKPFDDAKDELCYPRILNRLLPKDIRILAWCPSPPADFSARFSCRERQYRYFFTQPAFTPEPSSPGAASTTTGGVKTGWLDIEAMRDAAKRYEGEHDFRNVCKVDPAKQITNFRRRIFESDVVEVKDVASALPYLRQAGFAAPGMATGEPYPKVYYFHVRGSAFLWHQIRHMVALLFLVGQGLEKPSLISELLDVAANPRKPSYVMADEVPLVLWDCLFPDLDDEASRVAAAPDGVLTERTDALQWIFVGDEYAPNKHGQFGVVDGLWELWRERKMDELLAGQLLQLLSQQGVPAGSAPGGHGGKAAASARVYEGANAGRLAGKYVPVMKKELMQSPEEQNDKYAKRKGYASAEDMREQKALGRARDEAASDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.38
3 0.41
4 0.47
5 0.5
6 0.49
7 0.44
8 0.39
9 0.36
10 0.34
11 0.34
12 0.29
13 0.28
14 0.28
15 0.28
16 0.26
17 0.23
18 0.23
19 0.24
20 0.26
21 0.27
22 0.28
23 0.28
24 0.27
25 0.28
26 0.25
27 0.22
28 0.19
29 0.14
30 0.12
31 0.13
32 0.13
33 0.11
34 0.09
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.09
40 0.1
41 0.12
42 0.13
43 0.16
44 0.26
45 0.33
46 0.34
47 0.43
48 0.53
49 0.61
50 0.71
51 0.79
52 0.8
53 0.84
54 0.93
55 0.92
56 0.92
57 0.93
58 0.92
59 0.91
60 0.87
61 0.87
62 0.8
63 0.76
64 0.66
65 0.61
66 0.53
67 0.44
68 0.44
69 0.34
70 0.32
71 0.29
72 0.33
73 0.28
74 0.26
75 0.26
76 0.2
77 0.23
78 0.21
79 0.19
80 0.15
81 0.15
82 0.14
83 0.15
84 0.13
85 0.13
86 0.14
87 0.15
88 0.14
89 0.14
90 0.13
91 0.12
92 0.15
93 0.12
94 0.1
95 0.1
96 0.12
97 0.13
98 0.14
99 0.12
100 0.1
101 0.1
102 0.11
103 0.11
104 0.08
105 0.08
106 0.1
107 0.13
108 0.15
109 0.21
110 0.21
111 0.21
112 0.21
113 0.22
114 0.21
115 0.18
116 0.17
117 0.11
118 0.13
119 0.14
120 0.15
121 0.17
122 0.22
123 0.28
124 0.3
125 0.34
126 0.36
127 0.39
128 0.43
129 0.45
130 0.43
131 0.39
132 0.37
133 0.34
134 0.31
135 0.26
136 0.21
137 0.15
138 0.12
139 0.11
140 0.12
141 0.1
142 0.12
143 0.15
144 0.2
145 0.28
146 0.35
147 0.45
148 0.54
149 0.63
150 0.71
151 0.78
152 0.78
153 0.81
154 0.77
155 0.73
156 0.68
157 0.64
158 0.55
159 0.46
160 0.4
161 0.3
162 0.24
163 0.17
164 0.12
165 0.07
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.1
189 0.14
190 0.14
191 0.14
192 0.16
193 0.17
194 0.2
195 0.2
196 0.19
197 0.17
198 0.17
199 0.15
200 0.19
201 0.22
202 0.19
203 0.22
204 0.29
205 0.33
206 0.36
207 0.37
208 0.33
209 0.33
210 0.33
211 0.3
212 0.24
213 0.21
214 0.19
215 0.2
216 0.19
217 0.16
218 0.16
219 0.16
220 0.14
221 0.16
222 0.18
223 0.16
224 0.19
225 0.26
226 0.27
227 0.29
228 0.31
229 0.35
230 0.39
231 0.46
232 0.5
233 0.49
234 0.54
235 0.58
236 0.6
237 0.58
238 0.52
239 0.45
240 0.43
241 0.35
242 0.36
243 0.32
244 0.27
245 0.25
246 0.23
247 0.25
248 0.22
249 0.22
250 0.14
251 0.12
252 0.13
253 0.1
254 0.1
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.08
277 0.09
278 0.15
279 0.18
280 0.2
281 0.21
282 0.25
283 0.25
284 0.25
285 0.27
286 0.21
287 0.19
288 0.21
289 0.2
290 0.22
291 0.28
292 0.32
293 0.33
294 0.37
295 0.45
296 0.49
297 0.57
298 0.58
299 0.52
300 0.51
301 0.49
302 0.5
303 0.47
304 0.45
305 0.38
306 0.35
307 0.36
308 0.32
309 0.3
310 0.25
311 0.19
312 0.14
313 0.11
314 0.07
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.07
319 0.07
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.09
337 0.1
338 0.09
339 0.12
340 0.14
341 0.2
342 0.22
343 0.24
344 0.29
345 0.28
346 0.29
347 0.28
348 0.3
349 0.23
350 0.26
351 0.25
352 0.19
353 0.2
354 0.21
355 0.19
356 0.16
357 0.17
358 0.11
359 0.09
360 0.08
361 0.08
362 0.06
363 0.06
364 0.05
365 0.03
366 0.03
367 0.04
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.08
382 0.14
383 0.15
384 0.15
385 0.15
386 0.15
387 0.16
388 0.18
389 0.21
390 0.2
391 0.21
392 0.21
393 0.22
394 0.22
395 0.21
396 0.19
397 0.12
398 0.09
399 0.07
400 0.06
401 0.05
402 0.05
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.07
407 0.08
408 0.09
409 0.1
410 0.09
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.07
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.05
419 0.05
420 0.06
421 0.06
422 0.07
423 0.07
424 0.08
425 0.08
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.1
430 0.1
431 0.1
432 0.09
433 0.09
434 0.08
435 0.09
436 0.08
437 0.12
438 0.12
439 0.14
440 0.14
441 0.16
442 0.16
443 0.17
444 0.18
445 0.14
446 0.13
447 0.13
448 0.15
449 0.13
450 0.13
451 0.11
452 0.12
453 0.11
454 0.11
455 0.1
456 0.12
457 0.15
458 0.16
459 0.16
460 0.21
461 0.23
462 0.25
463 0.26
464 0.24
465 0.23
466 0.23
467 0.22
468 0.16
469 0.15
470 0.13
471 0.11
472 0.09
473 0.08
474 0.07
475 0.08
476 0.08
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.08
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.13
486 0.14
487 0.13
488 0.13
489 0.12
490 0.12
491 0.16
492 0.16
493 0.12
494 0.12
495 0.13
496 0.14
497 0.17
498 0.17
499 0.14
500 0.16
501 0.15
502 0.16
503 0.15
504 0.15
505 0.15
506 0.15
507 0.17
508 0.15
509 0.15
510 0.16
511 0.25
512 0.29
513 0.29
514 0.33
515 0.32
516 0.36
517 0.4
518 0.44
519 0.39
520 0.37
521 0.4
522 0.43
523 0.49
524 0.47
525 0.42
526 0.39
527 0.44
528 0.45
529 0.49
530 0.49
531 0.46
532 0.47
533 0.51
534 0.55
535 0.56
536 0.58
537 0.57
538 0.58
539 0.58
540 0.59
541 0.57
542 0.51
543 0.42
544 0.36
545 0.34
546 0.33
547 0.35
548 0.34
549 0.35
550 0.36
551 0.37
552 0.4