FuNGI

A0A179GYM3

Protein Details

Accession

A0A179GYM3

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-34	MSAPPPGGRKPNPLRPMRRKPRPANPLVARKPPA	Hydrophilic
172-199	KIAPVVKENKPQRPKKQKEEKTMFNRAP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-32	PGGRKPNPLRPMRRKPRPANPLVARKP
180-194	NKPQRPKKQKEEKTM
197-197	R
461-501	HAESKDKAKGGAPKGTLTPQGKQKHGDLVKKTKSLKRAGSP
512-518	SRKKMKK
657-663	KRLRRRK

Subcellular Location(s)

nucl 17, mito 7, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	plj:VFPFJ_08890 -

Amino Acid Sequences

MSAPPPGGRKPNPLRPMRRKPRPANPLVARKPPANAGQNASAASSQVAKQNGAKPSTEELRKQFGGWSEPPPQYQYSDIPIMTTKKALLEGVRYHLMKFSQSKITDKSVDPTDQDAFTRPVTLHRRDARQPPPGRAVKEEAPEPTPVDETERERLAQIKAEREAQRAIDQAKIAPVVKENKPQRPKKQKEEKTMFNRAPKSEAAKKEADLRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAALSQSNVAFMIDKSVFRMVPLEKWYKFNSKPPFQPFTIDQAEAFMNRKVDVGRWVMKDEEKKLGQSDLEATRRLLYGRGQMVKTESDTFKAASRLEKMDHDELDVSGDEFQDDDEATYVDRNEDEDTKESKERIRREQLGANLFGDGDEQEVDKELHEQLREELERQKYGKSTKKALIKRDREDIYQSDDSEENPWSSSSDDESSDEEDEEGKDDEKKEGEGKDGHAESKDKAKGGAPKGTLTPQGKQKHGDLVKKTKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKMKKSSTTAPGSRAGTPLPQGTAVRRPKVGGAGSGSDGEATGGEMSDGAGPRKKIKVMGSSAKGTPAVSRAGSPNPAPGASPSSQAGGAIEPWEILEKIPPEGIAIGDLIKPFQGRVGDKPGQMPKTEWIRLVKQLCDYGPDKRLRRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.81
2	0.83
3	0.9
4	0.9
5	0.92
6	0.92
7	0.93
8	0.93
9	0.93
10	0.89
11	0.89
12	0.87
13	0.87
14	0.84
15	0.83
16	0.76
17	0.68
18	0.63
19	0.58
20	0.57
21	0.53
22	0.5
23	0.46
24	0.46
25	0.45
26	0.43
27	0.38
28	0.3
29	0.23
30	0.19
31	0.17
32	0.14
33	0.17
34	0.19
35	0.2
36	0.25
37	0.31
38	0.37
39	0.37
40	0.36
41	0.35
42	0.4
43	0.46
44	0.47
45	0.46
46	0.45
47	0.5
48	0.5
49	0.47
50	0.44
51	0.4
52	0.41
53	0.38
54	0.39
55	0.39
56	0.41
57	0.42
58	0.42
59	0.39
60	0.35
61	0.35
62	0.32
63	0.29
64	0.3
65	0.28
66	0.26
67	0.29
68	0.3
69	0.27
70	0.26
71	0.21
72	0.19
73	0.2
74	0.21
75	0.19
76	0.22
77	0.24
78	0.28
79	0.33
80	0.32
81	0.31
82	0.32
83	0.31
84	0.3
85	0.31
86	0.3
87	0.33
88	0.35
89	0.4
90	0.41
91	0.46
92	0.44
93	0.42
94	0.42
95	0.39
96	0.39
97	0.36
98	0.35
99	0.32
100	0.28
101	0.28
102	0.26
103	0.23
104	0.21
105	0.21
106	0.18
107	0.24
108	0.31
109	0.35
110	0.41
111	0.45
112	0.52
113	0.57
114	0.66
115	0.65
116	0.68
117	0.68
118	0.65
119	0.68
120	0.67
121	0.63
122	0.58
123	0.55
124	0.5
125	0.49
126	0.45
127	0.38
128	0.34
129	0.33
130	0.3
131	0.26
132	0.21
133	0.18
134	0.2
135	0.2
136	0.23
137	0.26
138	0.26
139	0.25
140	0.24
141	0.28
142	0.24
143	0.28
144	0.27
145	0.28
146	0.29
147	0.36
148	0.38
149	0.37
150	0.38
151	0.34
152	0.33
153	0.31
154	0.3
155	0.25
156	0.23
157	0.21
158	0.2
159	0.21
160	0.18
161	0.15
162	0.19
163	0.23
164	0.26
165	0.34
166	0.4
167	0.48
168	0.57
169	0.66
170	0.72
171	0.77
172	0.83
173	0.85
174	0.89
175	0.88
176	0.89
177	0.88
178	0.87
179	0.85
180	0.85
181	0.79
182	0.76
183	0.71
184	0.61
185	0.56
186	0.49
187	0.48
188	0.46
189	0.45
190	0.42
191	0.39
192	0.39
193	0.45
194	0.45
195	0.4
196	0.34
197	0.32
198	0.29
199	0.28
200	0.28
201	0.19
202	0.19
203	0.17
204	0.15
205	0.12
206	0.1
207	0.09
208	0.11
209	0.12
210	0.14
211	0.13
212	0.13
213	0.13
214	0.13
215	0.12
216	0.11
217	0.09
218	0.05
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.08
226	0.08
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.11
233	0.09
234	0.1
235	0.11
236	0.13
237	0.13
238	0.12
239	0.16
240	0.13
241	0.16
242	0.21
243	0.26
244	0.25
245	0.29
246	0.33
247	0.37
248	0.38
249	0.43
250	0.47
251	0.47
252	0.53
253	0.57
254	0.58
255	0.51
256	0.52
257	0.46
258	0.43
259	0.4
260	0.32
261	0.25
262	0.21
263	0.21
264	0.19
265	0.18
266	0.13
267	0.1
268	0.1
269	0.11
270	0.1
271	0.11
272	0.14
273	0.17
274	0.2
275	0.21
276	0.22
277	0.23
278	0.26
279	0.28
280	0.27
281	0.29
282	0.25
283	0.24
284	0.24
285	0.24
286	0.2
287	0.17
288	0.19
289	0.18
290	0.19
291	0.19
292	0.18
293	0.18
294	0.18
295	0.18
296	0.15
297	0.11
298	0.15
299	0.18
300	0.22
301	0.21
302	0.21
303	0.23
304	0.22
305	0.22
306	0.2
307	0.16
308	0.14
309	0.15
310	0.15
311	0.15
312	0.16
313	0.15
314	0.14
315	0.16
316	0.16
317	0.17
318	0.18
319	0.2
320	0.2
321	0.2
322	0.18
323	0.16
324	0.14
325	0.14
326	0.12
327	0.08
328	0.06
329	0.06
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.06
344	0.07
345	0.09
346	0.1
347	0.13
348	0.15
349	0.18
350	0.2
351	0.2
352	0.23
353	0.28
354	0.32
355	0.37
356	0.44
357	0.45
358	0.47
359	0.51
360	0.51
361	0.48
362	0.44
363	0.35
364	0.27
365	0.22
366	0.18
367	0.14
368	0.08
369	0.05
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.07
377	0.08
378	0.1
379	0.1
380	0.11
381	0.11
382	0.16
383	0.17
384	0.17
385	0.22
386	0.23
387	0.26
388	0.26
389	0.27
390	0.26
391	0.33
392	0.4
393	0.39
394	0.42
395	0.45
396	0.53
397	0.57
398	0.63
399	0.66
400	0.66
401	0.65
402	0.67
403	0.63
404	0.56
405	0.55
406	0.46
407	0.43
408	0.36
409	0.33
410	0.27
411	0.25
412	0.23
413	0.21
414	0.2
415	0.13
416	0.11
417	0.11
418	0.1
419	0.1
420	0.1
421	0.11
422	0.11
423	0.12
424	0.13
425	0.14
426	0.15
427	0.15
428	0.15
429	0.12
430	0.11
431	0.1
432	0.1
433	0.1
434	0.09
435	0.11
436	0.12
437	0.13
438	0.13
439	0.15
440	0.17
441	0.17
442	0.2
443	0.2
444	0.21
445	0.26
446	0.26
447	0.26
448	0.24
449	0.25
450	0.22
451	0.28
452	0.28
453	0.22
454	0.23
455	0.26
456	0.31
457	0.35
458	0.4
459	0.33
460	0.33
461	0.34
462	0.36
463	0.39
464	0.34
465	0.34
466	0.37
467	0.41
468	0.42
469	0.43
470	0.43
471	0.45
472	0.49
473	0.51
474	0.51
475	0.55
476	0.59
477	0.62
478	0.67
479	0.62
480	0.63
481	0.63
482	0.63
483	0.59
484	0.61
485	0.59
486	0.57
487	0.53
488	0.48
489	0.43
490	0.36
491	0.29
492	0.22
493	0.23
494	0.22
495	0.21
496	0.22
497	0.22
498	0.27
499	0.36
500	0.41
501	0.39
502	0.45
503	0.55
504	0.61
505	0.67
506	0.7
507	0.71
508	0.74
509	0.74
510	0.68
511	0.64
512	0.56
513	0.5
514	0.42
515	0.33
516	0.27
517	0.26
518	0.23
519	0.19
520	0.19
521	0.18
522	0.21
523	0.3
524	0.34
525	0.35
526	0.35
527	0.35
528	0.35
529	0.39
530	0.36
531	0.3
532	0.26
533	0.25
534	0.25
535	0.24
536	0.22
537	0.16
538	0.15
539	0.12
540	0.08
541	0.06
542	0.05
543	0.04
544	0.04
545	0.04
546	0.05
547	0.08
548	0.09
549	0.11
550	0.15
551	0.17
552	0.22
553	0.26
554	0.28
555	0.3
556	0.35
557	0.41
558	0.46
559	0.54
560	0.54
561	0.54
562	0.53
563	0.5
564	0.45
565	0.36
566	0.3
567	0.23
568	0.21
569	0.17
570	0.19
571	0.2
572	0.24
573	0.27
574	0.26
575	0.28
576	0.27
577	0.26
578	0.25
579	0.24
580	0.26
581	0.23
582	0.25
583	0.21
584	0.21
585	0.2
586	0.19
587	0.18
588	0.13
589	0.12
590	0.11
591	0.1
592	0.08
593	0.09
594	0.11
595	0.1
596	0.09
597	0.13
598	0.14
599	0.15
600	0.16
601	0.16
602	0.15
603	0.15
604	0.15
605	0.11
606	0.1
607	0.1
608	0.11
609	0.11
610	0.1
611	0.11
612	0.11
613	0.11
614	0.14
615	0.19
616	0.2
617	0.26
618	0.35
619	0.39
620	0.41
621	0.49
622	0.54
623	0.51
624	0.5
625	0.46
626	0.45
627	0.49
628	0.5
629	0.48
630	0.46
631	0.47
632	0.54
633	0.56
634	0.52
635	0.47
636	0.49
637	0.45
638	0.44
639	0.42
640	0.41
641	0.44
642	0.5
643	0.53

A0A179GYM3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer