Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HQZ8

Protein Details
Accession A0A179HQZ8    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-50NPQSSKSKKLAKPADKMGKKHydrophilic
383-404GTTNGRKKQNERFSRIPKNIQVHydrophilic
427-450IVTKGKGFTKEKNKMKRGSFKGGMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-61KSKKLAKPADKMGKKSTTKAAAPAKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG plj:VFPFJ_04164  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSSRGPPSWLFSNNTDNDKKKQQQSSAADTNPQSSKSKKLAKPADKMGKKSTTKAAAPAKKEAPAAAAASTSQQAPDQLMDMVGDFLAENSFTKAHTAFMKQRGLSAEGLKGGDQKLLDVYSAWDKARAKGVTKTKKTGASDSSSDDSSSDESSSSSDSDSSSSEDSESDSSSSDDSDSESESDKEKETAKKPAASLKRKAPASSSSDSSSSDSSSSSDSSSDSDSDKASKPKTKKQKTAAAKSDSSDSDSSSEEEKMDVDSDSSSSSSDSDSDSDSSDSDSDESAVVKAEVAAKVALPESDSDSSSSSSDSSDSSDSEDDKKAKKANKSTKLVKVVSKTLSDSSVTLDSNSPEPTKASTTNPPLPPDPVLNGNGSSSNSTNGTTNGRKKQNERFSRIPKNIQVDSRFASNDYVSMDYSQRAHEGLIVTKGKGFTKEKNKMKRGSFKGGMIDINDKKGIYFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.56
3 0.54
4 0.56
5 0.61
6 0.66
7 0.66
8 0.7
9 0.69
10 0.71
11 0.74
12 0.76
13 0.74
14 0.67
15 0.64
16 0.56
17 0.55
18 0.48
19 0.44
20 0.39
21 0.34
22 0.4
23 0.44
24 0.53
25 0.51
26 0.59
27 0.67
28 0.72
29 0.77
30 0.8
31 0.81
32 0.77
33 0.78
34 0.76
35 0.75
36 0.69
37 0.66
38 0.64
39 0.6
40 0.56
41 0.59
42 0.61
43 0.58
44 0.59
45 0.62
46 0.56
47 0.52
48 0.51
49 0.43
50 0.35
51 0.3
52 0.27
53 0.19
54 0.16
55 0.13
56 0.14
57 0.14
58 0.12
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.11
63 0.11
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.07
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.1
81 0.1
82 0.12
83 0.15
84 0.21
85 0.27
86 0.34
87 0.4
88 0.38
89 0.41
90 0.41
91 0.4
92 0.36
93 0.31
94 0.26
95 0.22
96 0.22
97 0.2
98 0.2
99 0.17
100 0.17
101 0.14
102 0.13
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.09
107 0.11
108 0.13
109 0.16
110 0.16
111 0.19
112 0.2
113 0.22
114 0.3
115 0.3
116 0.28
117 0.34
118 0.44
119 0.5
120 0.54
121 0.57
122 0.55
123 0.59
124 0.59
125 0.56
126 0.51
127 0.45
128 0.42
129 0.41
130 0.38
131 0.31
132 0.29
133 0.23
134 0.19
135 0.16
136 0.14
137 0.1
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.1
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.1
168 0.1
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.14
173 0.17
174 0.23
175 0.25
176 0.33
177 0.34
178 0.36
179 0.37
180 0.43
181 0.49
182 0.49
183 0.52
184 0.51
185 0.55
186 0.53
187 0.52
188 0.46
189 0.42
190 0.41
191 0.38
192 0.33
193 0.27
194 0.27
195 0.28
196 0.26
197 0.21
198 0.15
199 0.13
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.09
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.12
214 0.15
215 0.18
216 0.21
217 0.26
218 0.3
219 0.39
220 0.49
221 0.56
222 0.62
223 0.65
224 0.71
225 0.74
226 0.79
227 0.78
228 0.72
229 0.64
230 0.56
231 0.52
232 0.42
233 0.36
234 0.26
235 0.19
236 0.15
237 0.15
238 0.15
239 0.13
240 0.13
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.09
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.06
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.09
284 0.08
285 0.06
286 0.06
287 0.1
288 0.11
289 0.12
290 0.12
291 0.13
292 0.14
293 0.14
294 0.13
295 0.1
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.12
303 0.13
304 0.14
305 0.16
306 0.2
307 0.22
308 0.24
309 0.29
310 0.32
311 0.37
312 0.44
313 0.52
314 0.58
315 0.65
316 0.7
317 0.74
318 0.76
319 0.78
320 0.73
321 0.68
322 0.61
323 0.57
324 0.52
325 0.45
326 0.39
327 0.32
328 0.3
329 0.26
330 0.22
331 0.19
332 0.19
333 0.17
334 0.16
335 0.16
336 0.15
337 0.17
338 0.19
339 0.16
340 0.14
341 0.15
342 0.17
343 0.19
344 0.21
345 0.23
346 0.29
347 0.36
348 0.44
349 0.46
350 0.48
351 0.45
352 0.45
353 0.43
354 0.37
355 0.32
356 0.27
357 0.26
358 0.24
359 0.22
360 0.21
361 0.2
362 0.19
363 0.19
364 0.16
365 0.16
366 0.15
367 0.16
368 0.16
369 0.17
370 0.23
371 0.28
372 0.36
373 0.43
374 0.51
375 0.56
376 0.62
377 0.71
378 0.75
379 0.77
380 0.77
381 0.78
382 0.79
383 0.84
384 0.84
385 0.82
386 0.78
387 0.75
388 0.72
389 0.69
390 0.62
391 0.57
392 0.52
393 0.47
394 0.41
395 0.34
396 0.32
397 0.24
398 0.22
399 0.2
400 0.19
401 0.16
402 0.18
403 0.18
404 0.17
405 0.19
406 0.18
407 0.17
408 0.16
409 0.15
410 0.16
411 0.17
412 0.18
413 0.24
414 0.25
415 0.24
416 0.27
417 0.29
418 0.28
419 0.33
420 0.35
421 0.37
422 0.47
423 0.57
424 0.64
425 0.72
426 0.79
427 0.8
428 0.85
429 0.86
430 0.83
431 0.83
432 0.78
433 0.72
434 0.69
435 0.64
436 0.56
437 0.49
438 0.49
439 0.42
440 0.41
441 0.38
442 0.32
443 0.28