Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179GCC8

Protein Details
Accession A0A179GCC8    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
335-355PATPRPSHKPPSPRAPSPKSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
339-363RPSHKPPSPRAPSPKSTIATSRRHS
Subcellular Location(s) plas 15, E.R. 5, mito 2, extr 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG plj:VFPFJ_09528  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
Amino Acid Sequences MAGDCGISCPVDGGYFSYSPSIAGNAILLALFSLLLPITLYMGYLFRTPFFSAVLATGLAFDVVGFAGRVLLHGDRASQTYFTLSMLGTVLGPTFTAAAIFVVLPHVLAVYGDHLSPCRPSFVEAGLCSLTCAALVIELVGVLFVVYSFRDVPRSESAGIVAGGLAVQSAALFGASVLYFWFTLKLNSGRRVPDESHVSVYLSNRFGRFLRGLETATALLLVYSVYRVIEMAGGVDGDLFQSEKAFMVMNGAIPLAVCILLSVFHPGIAYGSSWDQTSPRRAKQPIQLPLQQQPLTHRTHYAYEPNIRHQFPARSRRPNRALDPPQAGSGSAGLPATPRPSHKPPSPRAPSPKSTIATSRRHSGRSERKSHVQPDLVDSDMLW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.15
4 0.15
5 0.15
6 0.15
7 0.15
8 0.14
9 0.1
10 0.1
11 0.09
12 0.08
13 0.08
14 0.07
15 0.06
16 0.05
17 0.04
18 0.04
19 0.04
20 0.04
21 0.04
22 0.04
23 0.04
24 0.04
25 0.06
26 0.05
27 0.06
28 0.06
29 0.07
30 0.08
31 0.1
32 0.11
33 0.11
34 0.14
35 0.15
36 0.15
37 0.16
38 0.15
39 0.14
40 0.14
41 0.14
42 0.1
43 0.09
44 0.09
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.05
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.04
53 0.04
54 0.05
55 0.05
56 0.06
57 0.08
58 0.08
59 0.1
60 0.1
61 0.12
62 0.12
63 0.14
64 0.15
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.14
69 0.12
70 0.12
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.05
87 0.04
88 0.04
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.11
104 0.11
105 0.12
106 0.11
107 0.13
108 0.15
109 0.17
110 0.21
111 0.18
112 0.2
113 0.18
114 0.18
115 0.16
116 0.14
117 0.11
118 0.06
119 0.06
120 0.04
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.02
128 0.02
129 0.02
130 0.02
131 0.02
132 0.02
133 0.02
134 0.04
135 0.05
136 0.06
137 0.09
138 0.09
139 0.14
140 0.17
141 0.2
142 0.19
143 0.18
144 0.18
145 0.17
146 0.16
147 0.12
148 0.08
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.03
153 0.02
154 0.02
155 0.02
156 0.02
157 0.02
158 0.02
159 0.02
160 0.02
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.06
169 0.05
170 0.06
171 0.09
172 0.15
173 0.18
174 0.22
175 0.25
176 0.25
177 0.27
178 0.3
179 0.29
180 0.27
181 0.29
182 0.26
183 0.25
184 0.24
185 0.22
186 0.2
187 0.19
188 0.19
189 0.16
190 0.16
191 0.14
192 0.15
193 0.15
194 0.17
195 0.17
196 0.15
197 0.16
198 0.16
199 0.17
200 0.15
201 0.16
202 0.13
203 0.11
204 0.1
205 0.07
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.04
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.04
248 0.04
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.06
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.11
263 0.14
264 0.24
265 0.29
266 0.34
267 0.41
268 0.45
269 0.51
270 0.58
271 0.63
272 0.62
273 0.62
274 0.62
275 0.58
276 0.61
277 0.62
278 0.54
279 0.46
280 0.44
281 0.43
282 0.41
283 0.39
284 0.36
285 0.31
286 0.33
287 0.36
288 0.36
289 0.37
290 0.41
291 0.43
292 0.49
293 0.53
294 0.5
295 0.49
296 0.48
297 0.51
298 0.52
299 0.59
300 0.59
301 0.64
302 0.68
303 0.77
304 0.79
305 0.78
306 0.75
307 0.75
308 0.73
309 0.7
310 0.71
311 0.62
312 0.56
313 0.48
314 0.42
315 0.32
316 0.26
317 0.18
318 0.12
319 0.11
320 0.08
321 0.09
322 0.11
323 0.15
324 0.17
325 0.21
326 0.28
327 0.36
328 0.44
329 0.52
330 0.6
331 0.64
332 0.72
333 0.76
334 0.78
335 0.81
336 0.81
337 0.79
338 0.75
339 0.75
340 0.67
341 0.62
342 0.62
343 0.6
344 0.61
345 0.59
346 0.62
347 0.59
348 0.59
349 0.59
350 0.61
351 0.64
352 0.65
353 0.69
354 0.67
355 0.71
356 0.77
357 0.8
358 0.77
359 0.72
360 0.64
361 0.62
362 0.58
363 0.5