FuNGI

G0W8C5

Protein Details

Accession

G0W8C5

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
327-354	NITAKNAKKGGKKRKDRRKKGAMSDISG	Basic
444-463	EVSKGKLSQRRNREREEQEA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
331-347	KNAKKGGKKRKDRRKKG

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
KEGG	ndi:NDAI_0C03760 -
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MSKRFSKKNAQKYVVVHRPHDDPHFYDEDASAHVLVSVSNPNDGHKQQQQLQQQQGQYIPKLTTTKTKEDLKLENKNVGEAALYGINFDDSKYDYTQHLKPIGTDPNAVFVPAKSSTVDKNEKKKDIEDLFVEPEYKDTKNAPVTSVFQRGVAKPDYLLHQQEVTEDIAGFKPDMNPALREVLEALEDEAYVVNDDVEVVKSKKNKKVVEPEEELEEDDVFAQLLGSGEVKDDEEFEDGFDEWDMDEIDNYEDEHYRKEMSQFDNIENLEDLQDIDYQADVIRFQKEKSKYNEYDSDEGLANESVAPSDFQDEEEEEENDVLGDLPNITAKNAKKGGKKRKDRRKKGAMSDISGFSMSSSAIARTETMTVLDDQFDNVIGSYENYEDEIEEDEENYKPFDMKAERSDFESMLDDFLDNYELESGGRKLAKKDEEIDRLKKAADEVSKGKLSQRRNREREEQEAQKAKNTSLHKVTNSLSSLHF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.76
2	0.71
3	0.64
4	0.57
5	0.56
6	0.54
7	0.54
8	0.48
9	0.42
10	0.43
11	0.43
12	0.4
13	0.37
14	0.33
15	0.28
16	0.24
17	0.22
18	0.16
19	0.12
20	0.12
21	0.1
22	0.1
23	0.11
24	0.14
25	0.14
26	0.17
27	0.17
28	0.2
29	0.26
30	0.28
31	0.33
32	0.34
33	0.4
34	0.44
35	0.53
36	0.59
37	0.62
38	0.68
39	0.67
40	0.62
41	0.59
42	0.57
43	0.52
44	0.45
45	0.39
46	0.32
47	0.3
48	0.31
49	0.3
50	0.35
51	0.36
52	0.42
53	0.45
54	0.53
55	0.53
56	0.57
57	0.64
58	0.63
59	0.68
60	0.64
61	0.63
62	0.55
63	0.51
64	0.45
65	0.35
66	0.27
67	0.17
68	0.15
69	0.11
70	0.1
71	0.09
72	0.09
73	0.1
74	0.09
75	0.09
76	0.09
77	0.09
78	0.12
79	0.13
80	0.15
81	0.17
82	0.23
83	0.26
84	0.3
85	0.33
86	0.3
87	0.31
88	0.35
89	0.39
90	0.36
91	0.36
92	0.3
93	0.3
94	0.29
95	0.28
96	0.23
97	0.15
98	0.18
99	0.15
100	0.16
101	0.12
102	0.15
103	0.18
104	0.26
105	0.36
106	0.39
107	0.48
108	0.56
109	0.6
110	0.61
111	0.59
112	0.6
113	0.54
114	0.5
115	0.43
116	0.38
117	0.35
118	0.33
119	0.31
120	0.22
121	0.21
122	0.2
123	0.18
124	0.16
125	0.15
126	0.2
127	0.26
128	0.27
129	0.26
130	0.26
131	0.3
132	0.32
133	0.36
134	0.3
135	0.27
136	0.29
137	0.28
138	0.29
139	0.27
140	0.23
141	0.18
142	0.2
143	0.22
144	0.23
145	0.24
146	0.2
147	0.19
148	0.19
149	0.19
150	0.19
151	0.15
152	0.12
153	0.1
154	0.1
155	0.09
156	0.09
157	0.09
158	0.08
159	0.08
160	0.09
161	0.12
162	0.12
163	0.12
164	0.13
165	0.16
166	0.15
167	0.14
168	0.14
169	0.11
170	0.11
171	0.1
172	0.09
173	0.06
174	0.05
175	0.06
176	0.05
177	0.05
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.03
182	0.04
183	0.04
184	0.05
185	0.07
186	0.08
187	0.11
188	0.18
189	0.25
190	0.31
191	0.39
192	0.42
193	0.47
194	0.57
195	0.61
196	0.62
197	0.59
198	0.54
199	0.49
200	0.45
201	0.37
202	0.27
203	0.2
204	0.12
205	0.08
206	0.07
207	0.04
208	0.04
209	0.03
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.04
214	0.04
215	0.04
216	0.04
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.07
225	0.07
226	0.07
227	0.06
228	0.05
229	0.04
230	0.05
231	0.05
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.06
239	0.07
240	0.08
241	0.09
242	0.09
243	0.1
244	0.11
245	0.13
246	0.18
247	0.19
248	0.24
249	0.25
250	0.25
251	0.28
252	0.27
253	0.25
254	0.19
255	0.17
256	0.11
257	0.09
258	0.08
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.05
264	0.05
265	0.06
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.1
270	0.11
271	0.12
272	0.19
273	0.24
274	0.31
275	0.37
276	0.45
277	0.44
278	0.49
279	0.56
280	0.53
281	0.51
282	0.44
283	0.39
284	0.3
285	0.27
286	0.22
287	0.15
288	0.1
289	0.08
290	0.07
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.07
296	0.07
297	0.08
298	0.09
299	0.09
300	0.12
301	0.13
302	0.13
303	0.11
304	0.11
305	0.1
306	0.09
307	0.08
308	0.06
309	0.05
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.06
314	0.06
315	0.07
316	0.12
317	0.13
318	0.2
319	0.27
320	0.33
321	0.4
322	0.5
323	0.61
324	0.66
325	0.77
326	0.8
327	0.85
328	0.91
329	0.93
330	0.94
331	0.93
332	0.92
333	0.9
334	0.9
335	0.84
336	0.76
337	0.69
338	0.59
339	0.49
340	0.4
341	0.3
342	0.19
343	0.15
344	0.1
345	0.08
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.08
350	0.08
351	0.09
352	0.1
353	0.09
354	0.09
355	0.1
356	0.11
357	0.11
358	0.12
359	0.11
360	0.1
361	0.1
362	0.09
363	0.08
364	0.07
365	0.07
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.08
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.09
375	0.11
376	0.11
377	0.1
378	0.11
379	0.12
380	0.12
381	0.13
382	0.13
383	0.11
384	0.1
385	0.1
386	0.16
387	0.19
388	0.23
389	0.31
390	0.36
391	0.37
392	0.4
393	0.42
394	0.35
395	0.32
396	0.3
397	0.23
398	0.17
399	0.17
400	0.13
401	0.11
402	0.11
403	0.11
404	0.08
405	0.08
406	0.08
407	0.08
408	0.08
409	0.11
410	0.11
411	0.14
412	0.18
413	0.2
414	0.23
415	0.31
416	0.36
417	0.38
418	0.44
419	0.48
420	0.54
421	0.6
422	0.62
423	0.58
424	0.54
425	0.51
426	0.45
427	0.38
428	0.36
429	0.33
430	0.34
431	0.33
432	0.38
433	0.4
434	0.4
435	0.45
436	0.44
437	0.49
438	0.52
439	0.6
440	0.65
441	0.69
442	0.77
443	0.8
444	0.8
445	0.8
446	0.79
447	0.77
448	0.75
449	0.76
450	0.7
451	0.66
452	0.62
453	0.55
454	0.53
455	0.48
456	0.47
457	0.47
458	0.53
459	0.48
460	0.51
461	0.51
462	0.51
463	0.48

G0W8C5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer