Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HNC5

Protein Details
Accession A0A179HNC5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-31GEGSKRKRASTADKPTKRRRSSSSSEDNDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-22KRKRASTADKPTKRRR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 4, plas 4, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG plj:VFPFJ_05210  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MAGEGSKRKRASTADKPTKRRRSSSSSEDNDDPNAKILLMEQGILESRKNYNDITVLLSAAKEDSEEAMLATVALCRIFVRLLAQGSLTFKKSLSEKEGVVVGWLRDQLSQYKVLLLEQMADEDLAVTALTLCMRVLKAEGEFLSNKEEYSFPTAFIGDVVAAVLESTNEDVRTAYIEEFAEQYDDIRYFTFKSIKPAMEAIASKGDDSSALFDRVFSLISALDGVPESADELEDFYVTRPQKKSHPLRSVTQHKKQGQEAWVALLGVVETKDQRKRILDVISTIIAPWFTKPELLADFLTSCYNSGGSMSLLALSGVFYLIQERNLDYPSFYAKLYSLLDRNILHSKHRSRFFRLLDTFLASTHLPAALVASFLKRLARLSLNAPPSAIAFVVPWIYNQLKRHPTCTFMVHREIKDADMKKHITDHGFEDPFVAEESDPMETKAIDSSLWELVHLQSHYHPNVATIAKIVSEQFTKQSYNMEDFLDHSYATLLDAEMGKNVRKAPVVEFHIPKRVFLPQDDPTAAPDSLVVKLWDFGTAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.74
3 0.83
4 0.89
5 0.91
6 0.89
7 0.86
8 0.83
9 0.81
10 0.8
11 0.81
12 0.8
13 0.76
14 0.74
15 0.7
16 0.63
17 0.59
18 0.52
19 0.43
20 0.34
21 0.28
22 0.22
23 0.18
24 0.17
25 0.18
26 0.15
27 0.15
28 0.12
29 0.13
30 0.16
31 0.17
32 0.17
33 0.14
34 0.17
35 0.19
36 0.22
37 0.21
38 0.21
39 0.23
40 0.23
41 0.24
42 0.22
43 0.2
44 0.18
45 0.17
46 0.15
47 0.13
48 0.11
49 0.07
50 0.07
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.1
68 0.13
69 0.14
70 0.15
71 0.15
72 0.16
73 0.2
74 0.23
75 0.22
76 0.19
77 0.18
78 0.21
79 0.24
80 0.27
81 0.3
82 0.3
83 0.29
84 0.3
85 0.31
86 0.27
87 0.26
88 0.22
89 0.16
90 0.14
91 0.15
92 0.14
93 0.13
94 0.15
95 0.17
96 0.18
97 0.2
98 0.18
99 0.2
100 0.19
101 0.18
102 0.19
103 0.15
104 0.14
105 0.11
106 0.12
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.07
111 0.06
112 0.05
113 0.04
114 0.03
115 0.03
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.12
127 0.13
128 0.14
129 0.15
130 0.16
131 0.19
132 0.18
133 0.17
134 0.16
135 0.16
136 0.15
137 0.2
138 0.2
139 0.16
140 0.17
141 0.17
142 0.15
143 0.15
144 0.13
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.04
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.08
161 0.09
162 0.08
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.13
178 0.19
179 0.18
180 0.25
181 0.29
182 0.29
183 0.3
184 0.29
185 0.27
186 0.24
187 0.23
188 0.18
189 0.18
190 0.17
191 0.15
192 0.14
193 0.13
194 0.1
195 0.1
196 0.11
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.04
218 0.03
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.05
224 0.11
225 0.12
226 0.17
227 0.19
228 0.21
229 0.28
230 0.38
231 0.47
232 0.51
233 0.59
234 0.58
235 0.61
236 0.68
237 0.72
238 0.71
239 0.69
240 0.68
241 0.63
242 0.63
243 0.6
244 0.56
245 0.48
246 0.43
247 0.35
248 0.27
249 0.24
250 0.2
251 0.17
252 0.11
253 0.08
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.05
258 0.09
259 0.12
260 0.14
261 0.16
262 0.18
263 0.2
264 0.24
265 0.27
266 0.24
267 0.22
268 0.23
269 0.21
270 0.19
271 0.17
272 0.12
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.09
281 0.1
282 0.12
283 0.11
284 0.1
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.09
289 0.08
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.08
311 0.09
312 0.1
313 0.12
314 0.12
315 0.1
316 0.1
317 0.12
318 0.13
319 0.12
320 0.11
321 0.1
322 0.13
323 0.14
324 0.16
325 0.14
326 0.14
327 0.17
328 0.17
329 0.2
330 0.23
331 0.23
332 0.24
333 0.31
334 0.38
335 0.43
336 0.5
337 0.51
338 0.53
339 0.61
340 0.6
341 0.62
342 0.56
343 0.51
344 0.45
345 0.43
346 0.36
347 0.27
348 0.26
349 0.16
350 0.14
351 0.11
352 0.1
353 0.07
354 0.06
355 0.07
356 0.05
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.07
361 0.07
362 0.09
363 0.08
364 0.09
365 0.12
366 0.15
367 0.16
368 0.2
369 0.26
370 0.28
371 0.28
372 0.27
373 0.23
374 0.21
375 0.2
376 0.15
377 0.09
378 0.06
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.07
383 0.11
384 0.14
385 0.18
386 0.2
387 0.28
388 0.36
389 0.38
390 0.43
391 0.4
392 0.42
393 0.41
394 0.45
395 0.44
396 0.39
397 0.46
398 0.47
399 0.46
400 0.46
401 0.44
402 0.39
403 0.41
404 0.4
405 0.35
406 0.36
407 0.37
408 0.34
409 0.37
410 0.39
411 0.33
412 0.31
413 0.32
414 0.33
415 0.32
416 0.31
417 0.28
418 0.25
419 0.23
420 0.22
421 0.18
422 0.09
423 0.08
424 0.1
425 0.11
426 0.11
427 0.1
428 0.1
429 0.09
430 0.1
431 0.11
432 0.1
433 0.08
434 0.09
435 0.11
436 0.14
437 0.14
438 0.13
439 0.13
440 0.14
441 0.18
442 0.18
443 0.16
444 0.17
445 0.25
446 0.26
447 0.26
448 0.25
449 0.22
450 0.27
451 0.26
452 0.22
453 0.16
454 0.16
455 0.14
456 0.15
457 0.15
458 0.12
459 0.14
460 0.15
461 0.17
462 0.2
463 0.22
464 0.21
465 0.27
466 0.27
467 0.3
468 0.3
469 0.27
470 0.25
471 0.25
472 0.28
473 0.23
474 0.19
475 0.15
476 0.14
477 0.13
478 0.13
479 0.11
480 0.07
481 0.08
482 0.1
483 0.1
484 0.13
485 0.15
486 0.16
487 0.18
488 0.21
489 0.22
490 0.24
491 0.26
492 0.28
493 0.34
494 0.4
495 0.45
496 0.49
497 0.5
498 0.57
499 0.55
500 0.5
501 0.45
502 0.45
503 0.4
504 0.38
505 0.41
506 0.37
507 0.44
508 0.45
509 0.42
510 0.38
511 0.39
512 0.35
513 0.28
514 0.25
515 0.2
516 0.19
517 0.2
518 0.18
519 0.14
520 0.16
521 0.16