Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179GN71

Protein Details
Accession A0A179GN71    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
118-142QQPVEEKKERKKRTHDPNAPKRPLTBasic
282-308MEPKATPASPDKKRRRTSTKAVDDKEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
124-132KKERKKRTH
261-272PKKAAGGRKRKT
288-320PASPDKKRRRTSTKAVDDKEEPKKSGRKKTKSS
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.333, cyto 10, nucl 9.5, cyto_mito 9.333, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG plj:VFPFJ_09842  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MPRPSKKADDKAKVPVVPAPTMVHPPVGMMPVPPVPVGLAAGVPTRLVDPDSFLRVRDSAVGRLNTIIELIKSFTTDYVRQTNLLLGEATADGGADLLSAFENTAAQLIMPGVAPELQQPVEEKKERKKRTHDPNAPKRPLTPYFLYMQHARSIIANDLGAEAPKGAVQEEGQRRWAHMSPTEKKGWNAAYQYNLRLYNARVHSYKQGNPLAKNMNDDEALKYAEDFQIPMPEIKDTPAEAPSNDHDAIAEQLQADDAKTPKKAAGGRKRKTATPAADTSIMEPKATPASPDKKRRRTSTKAVDDKEEPKKSGRKKTKSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.56
3 0.5
4 0.42
5 0.38
6 0.31
7 0.26
8 0.3
9 0.29
10 0.25
11 0.2
12 0.2
13 0.2
14 0.19
15 0.16
16 0.12
17 0.14
18 0.15
19 0.16
20 0.15
21 0.13
22 0.12
23 0.12
24 0.12
25 0.09
26 0.07
27 0.07
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.09
35 0.09
36 0.12
37 0.15
38 0.21
39 0.21
40 0.21
41 0.23
42 0.22
43 0.23
44 0.25
45 0.24
46 0.23
47 0.29
48 0.29
49 0.27
50 0.28
51 0.27
52 0.21
53 0.2
54 0.15
55 0.09
56 0.09
57 0.1
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.14
63 0.16
64 0.19
65 0.23
66 0.24
67 0.24
68 0.24
69 0.25
70 0.21
71 0.2
72 0.15
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.06
78 0.05
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.03
83 0.02
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.03
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.09
107 0.12
108 0.18
109 0.23
110 0.27
111 0.35
112 0.45
113 0.53
114 0.59
115 0.65
116 0.69
117 0.76
118 0.83
119 0.83
120 0.84
121 0.88
122 0.9
123 0.85
124 0.75
125 0.66
126 0.61
127 0.54
128 0.48
129 0.39
130 0.3
131 0.3
132 0.31
133 0.31
134 0.26
135 0.24
136 0.21
137 0.19
138 0.17
139 0.15
140 0.14
141 0.12
142 0.11
143 0.09
144 0.07
145 0.08
146 0.07
147 0.06
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.13
157 0.18
158 0.19
159 0.22
160 0.22
161 0.22
162 0.26
163 0.27
164 0.22
165 0.22
166 0.3
167 0.31
168 0.36
169 0.41
170 0.38
171 0.37
172 0.39
173 0.36
174 0.31
175 0.29
176 0.26
177 0.27
178 0.27
179 0.28
180 0.28
181 0.26
182 0.23
183 0.21
184 0.21
185 0.23
186 0.24
187 0.26
188 0.23
189 0.25
190 0.32
191 0.36
192 0.38
193 0.38
194 0.42
195 0.42
196 0.42
197 0.46
198 0.44
199 0.4
200 0.39
201 0.33
202 0.29
203 0.25
204 0.25
205 0.21
206 0.17
207 0.16
208 0.13
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.11
213 0.1
214 0.09
215 0.13
216 0.14
217 0.15
218 0.14
219 0.14
220 0.14
221 0.15
222 0.15
223 0.12
224 0.13
225 0.15
226 0.16
227 0.15
228 0.18
229 0.19
230 0.23
231 0.22
232 0.2
233 0.17
234 0.17
235 0.18
236 0.15
237 0.13
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.1
244 0.12
245 0.15
246 0.16
247 0.17
248 0.18
249 0.24
250 0.29
251 0.36
252 0.46
253 0.53
254 0.58
255 0.67
256 0.69
257 0.67
258 0.68
259 0.67
260 0.62
261 0.58
262 0.56
263 0.49
264 0.49
265 0.45
266 0.41
267 0.4
268 0.33
269 0.26
270 0.22
271 0.21
272 0.23
273 0.23
274 0.23
275 0.24
276 0.34
277 0.44
278 0.55
279 0.63
280 0.69
281 0.78
282 0.85
283 0.86
284 0.86
285 0.87
286 0.88
287 0.88
288 0.87
289 0.82
290 0.78
291 0.75
292 0.74
293 0.73
294 0.68
295 0.6
296 0.58
297 0.63
298 0.67
299 0.72
300 0.74