Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179GBQ0

Protein Details
Accession A0A179GBQ0    Localization Confidence Low Confidence Score 7.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-132WEWVDERMDRRKRQREEREQAEREEAcidic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 8cyto_mito 8, mito 7.5, cyto 7.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG plj:VFPFJ_08490  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSGRRDFLSQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPARDGPSEDQIKEALAKRAAQLGIAQDGKDGKKGKDDQGDDANDEARYQDPDNEVGLFAGGVYDKDDEEADRIWEWVDERMDRRKRQREEREQAEREEFERNNPKIQQQFSDLKRALGTVTDDEWASLPEVGDLTGKNRRSKQALRQRFYAVPDSVLAAARDSTEMGTTVTDDGTATGREGGDGTMTNFADIGAARDKVLKSRLEQASQSAGTESSVAGSASTIDPQGYITNLNKMQMNGQAQVGDITRVRELLQSVVKTNPNNALGWIAAARLEELAGKIVAARKTIDKGCVQCPKSEDAWLENIRLNHESPNAKIIARKAIESNPKSVRLWVEAMNLENIPSNKKRVIRQALDNVPKSEALWKEAVSLEDDPSDARLMLAKATELIPLSVDLWLALARLETPENAQKVLNKARKAVPTSHEIWIAAARLQEQLGQADKVNVMKRAVQVLAKESAMPTREEWIGEAEKCEEEGATATCQNIIFETLGWKLDEDDDRKDIWMEDARASINRGKYATARAIYAYALRVFVHSKTMWTAAADLERNHGTRDALWQLLEKAVEACPRSEDLWMMLAKEKWQAGAVDGARLVLKRAFQQNPDNEDIWLAAVKLESDSGNVDQARKLLQIAREQASTDRVWMKSVAFERVHGNPEAALDMVLTALQRFPASPKLWMQKGQIYEDQDKIGQARDAYATGVKAVPRSVPLWLLYSRLEERAGLTVKARSVLDRARLAVPKSAELWCESVRLERRAGNLPQAKSMMARAQQEVPKSGLLWVEQIWHLEPRTQRKPRSLEAIKKIDNDPLLFVGVARIFWADRKLDKAQNWFEKALVLDPDCGDSWAWYYRFLCQHGTDEKREEVVSKCVQNEPKHGEAWQAVAKDPANALKTTEEVLKLVAAGLEQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.3
3 0.26
4 0.23
5 0.18
6 0.15
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.28
37 0.3
38 0.3
39 0.36
40 0.35
41 0.29
42 0.27
43 0.24
44 0.27
45 0.27
46 0.25
47 0.21
48 0.26
49 0.26
50 0.3
51 0.32
52 0.27
53 0.35
54 0.41
55 0.46
56 0.51
57 0.53
58 0.53
59 0.57
60 0.58
61 0.5
62 0.46
63 0.4
64 0.3
65 0.27
66 0.22
67 0.16
68 0.16
69 0.16
70 0.19
71 0.19
72 0.21
73 0.22
74 0.22
75 0.2
76 0.17
77 0.16
78 0.11
79 0.08
80 0.07
81 0.06
82 0.05
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.12
90 0.12
91 0.13
92 0.12
93 0.13
94 0.12
95 0.13
96 0.13
97 0.16
98 0.18
99 0.21
100 0.25
101 0.36
102 0.44
103 0.52
104 0.62
105 0.67
106 0.73
107 0.8
108 0.86
109 0.87
110 0.89
111 0.9
112 0.9
113 0.84
114 0.79
115 0.73
116 0.64
117 0.54
118 0.51
119 0.42
120 0.4
121 0.46
122 0.43
123 0.45
124 0.46
125 0.51
126 0.5
127 0.53
128 0.48
129 0.45
130 0.52
131 0.48
132 0.55
133 0.49
134 0.43
135 0.4
136 0.37
137 0.3
138 0.23
139 0.23
140 0.16
141 0.16
142 0.16
143 0.15
144 0.15
145 0.15
146 0.14
147 0.12
148 0.1
149 0.09
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.12
156 0.19
157 0.23
158 0.3
159 0.35
160 0.4
161 0.47
162 0.55
163 0.62
164 0.66
165 0.72
166 0.71
167 0.7
168 0.69
169 0.65
170 0.61
171 0.57
172 0.46
173 0.36
174 0.32
175 0.29
176 0.24
177 0.22
178 0.18
179 0.11
180 0.11
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.08
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.12
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.11
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.15
218 0.15
219 0.18
220 0.23
221 0.23
222 0.23
223 0.32
224 0.36
225 0.36
226 0.36
227 0.35
228 0.36
229 0.34
230 0.32
231 0.22
232 0.18
233 0.15
234 0.15
235 0.12
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.08
249 0.07
250 0.1
251 0.1
252 0.16
253 0.17
254 0.18
255 0.19
256 0.19
257 0.21
258 0.23
259 0.25
260 0.2
261 0.19
262 0.18
263 0.17
264 0.18
265 0.16
266 0.12
267 0.1
268 0.11
269 0.1
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.12
274 0.14
275 0.17
276 0.17
277 0.18
278 0.22
279 0.25
280 0.24
281 0.26
282 0.27
283 0.24
284 0.23
285 0.22
286 0.19
287 0.15
288 0.15
289 0.13
290 0.08
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.11
303 0.12
304 0.12
305 0.13
306 0.14
307 0.19
308 0.21
309 0.23
310 0.23
311 0.25
312 0.32
313 0.39
314 0.38
315 0.37
316 0.38
317 0.38
318 0.35
319 0.35
320 0.29
321 0.22
322 0.28
323 0.26
324 0.26
325 0.24
326 0.23
327 0.22
328 0.23
329 0.21
330 0.17
331 0.21
332 0.21
333 0.19
334 0.22
335 0.2
336 0.19
337 0.21
338 0.2
339 0.23
340 0.22
341 0.23
342 0.22
343 0.27
344 0.36
345 0.35
346 0.4
347 0.36
348 0.38
349 0.38
350 0.37
351 0.33
352 0.26
353 0.27
354 0.22
355 0.21
356 0.19
357 0.19
358 0.19
359 0.17
360 0.14
361 0.14
362 0.12
363 0.14
364 0.15
365 0.17
366 0.2
367 0.25
368 0.29
369 0.36
370 0.45
371 0.45
372 0.5
373 0.55
374 0.59
375 0.62
376 0.59
377 0.51
378 0.43
379 0.38
380 0.32
381 0.29
382 0.21
383 0.17
384 0.16
385 0.15
386 0.16
387 0.17
388 0.17
389 0.14
390 0.14
391 0.12
392 0.11
393 0.11
394 0.09
395 0.09
396 0.08
397 0.06
398 0.05
399 0.06
400 0.06
401 0.07
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.08
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.05
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.03
420 0.03
421 0.04
422 0.05
423 0.05
424 0.07
425 0.11
426 0.11
427 0.12
428 0.13
429 0.14
430 0.19
431 0.28
432 0.31
433 0.28
434 0.31
435 0.35
436 0.39
437 0.4
438 0.39
439 0.33
440 0.32
441 0.34
442 0.33
443 0.28
444 0.24
445 0.21
446 0.18
447 0.16
448 0.12
449 0.09
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.09
454 0.08
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.08
459 0.09
460 0.09
461 0.11
462 0.13
463 0.13
464 0.13
465 0.15
466 0.15
467 0.17
468 0.17
469 0.15
470 0.14
471 0.15
472 0.16
473 0.14
474 0.13
475 0.11
476 0.12
477 0.12
478 0.12
479 0.1
480 0.11
481 0.12
482 0.12
483 0.12
484 0.13
485 0.14
486 0.13
487 0.13
488 0.12
489 0.11
490 0.11
491 0.11
492 0.07
493 0.05
494 0.06
495 0.07
496 0.06
497 0.07
498 0.07
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.07
503 0.07
504 0.06
505 0.06
506 0.08
507 0.07
508 0.08
509 0.08
510 0.08
511 0.07
512 0.1
513 0.14
514 0.14
515 0.16
516 0.17
517 0.17
518 0.18
519 0.18
520 0.15
521 0.14
522 0.15
523 0.14
524 0.14
525 0.14
526 0.15
527 0.15
528 0.17
529 0.18
530 0.16
531 0.16
532 0.15
533 0.16
534 0.17
535 0.2
536 0.22
537 0.19
538 0.18
539 0.17
540 0.17
541 0.16
542 0.15
543 0.13
544 0.09
545 0.09
546 0.09
547 0.09
548 0.1
549 0.1
550 0.13
551 0.12
552 0.12
553 0.13
554 0.14
555 0.13
556 0.12
557 0.13
558 0.1
559 0.12
560 0.13
561 0.12
562 0.14
563 0.15
564 0.15
565 0.15
566 0.15
567 0.13
568 0.12
569 0.16
570 0.15
571 0.14
572 0.14
573 0.14
574 0.14
575 0.15
576 0.14
577 0.1
578 0.09
579 0.1
580 0.13
581 0.12
582 0.12
583 0.12
584 0.14
585 0.14
586 0.14
587 0.13
588 0.1
589 0.13
590 0.13
591 0.13
592 0.14
593 0.14
594 0.14
595 0.17
596 0.16
597 0.13
598 0.14
599 0.13
600 0.11
601 0.17
602 0.16
603 0.14
604 0.14
605 0.14
606 0.13
607 0.13
608 0.13
609 0.09
610 0.1
611 0.14
612 0.22
613 0.24
614 0.28
615 0.36
616 0.42
617 0.46
618 0.48
619 0.44
620 0.36
621 0.34
622 0.29
623 0.22
624 0.15
625 0.1
626 0.06
627 0.05
628 0.05
629 0.05
630 0.06
631 0.06
632 0.06
633 0.08
634 0.08
635 0.12
636 0.12
637 0.13
638 0.13
639 0.14
640 0.15
641 0.13
642 0.14
643 0.14
644 0.17
645 0.22
646 0.27
647 0.28
648 0.27
649 0.28
650 0.28
651 0.28
652 0.24
653 0.22
654 0.21
655 0.19
656 0.2
657 0.2
658 0.19
659 0.21
660 0.23
661 0.27
662 0.22
663 0.24
664 0.26
665 0.28
666 0.31
667 0.25
668 0.23
669 0.17
670 0.17
671 0.16
672 0.12
673 0.09
674 0.06
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.04
679 0.04
680 0.04
681 0.05
682 0.05
683 0.06
684 0.08
685 0.16
686 0.17
687 0.2
688 0.27
689 0.34
690 0.37
691 0.41
692 0.42
693 0.4
694 0.42
695 0.43
696 0.4
697 0.39
698 0.4
699 0.37
700 0.35
701 0.3
702 0.28
703 0.24
704 0.21
705 0.17
706 0.14
707 0.14
708 0.13
709 0.13
710 0.14
711 0.14
712 0.12
713 0.12
714 0.14
715 0.13
716 0.13
717 0.13
718 0.13
719 0.14
720 0.15
721 0.15
722 0.15
723 0.16
724 0.18
725 0.18
726 0.19
727 0.18
728 0.21
729 0.22
730 0.21
731 0.2
732 0.17
733 0.18
734 0.22
735 0.23
736 0.19
737 0.19
738 0.2
739 0.2
740 0.23
741 0.22
742 0.17
743 0.2
744 0.24
745 0.28
746 0.28
747 0.3
748 0.33
749 0.37
750 0.37
751 0.37
752 0.34
753 0.3
754 0.3
755 0.29
756 0.24
757 0.22
758 0.25
759 0.2
760 0.2
761 0.19
762 0.24
763 0.29
764 0.3
765 0.31
766 0.3
767 0.34
768 0.4
769 0.41
770 0.44
771 0.45
772 0.43
773 0.44
774 0.42
775 0.38
776 0.32
777 0.33
778 0.29
779 0.27
780 0.28
781 0.27
782 0.33
783 0.36
784 0.38
785 0.37
786 0.33
787 0.29
788 0.27
789 0.25
790 0.2
791 0.18
792 0.17
793 0.15
794 0.16
795 0.16
796 0.17
797 0.17
798 0.19
799 0.19
800 0.22
801 0.28
802 0.34
803 0.44
804 0.51
805 0.56
806 0.62
807 0.68
808 0.69
809 0.73
810 0.73
811 0.73
812 0.74
813 0.76
814 0.71
815 0.69
816 0.65
817 0.59
818 0.53
819 0.44
820 0.36
821 0.28
822 0.25
823 0.2
824 0.19
825 0.17
826 0.14
827 0.13
828 0.11
829 0.11
830 0.1
831 0.13
832 0.17
833 0.17
834 0.19
835 0.26
836 0.32
837 0.38
838 0.43
839 0.5
840 0.56
841 0.61
842 0.64
843 0.58
844 0.52
845 0.47
846 0.43
847 0.37
848 0.32
849 0.24
850 0.22
851 0.21
852 0.24
853 0.22
854 0.22
855 0.18
856 0.14
857 0.16
858 0.2
859 0.2
860 0.22
861 0.23
862 0.29
863 0.34
864 0.36
865 0.37
866 0.33
867 0.4
868 0.45
869 0.5
870 0.49
871 0.49
872 0.48
873 0.45
874 0.43
875 0.4
876 0.34
877 0.35
878 0.36
879 0.36
880 0.37
881 0.42
882 0.49
883 0.51
884 0.56
885 0.56
886 0.53
887 0.5
888 0.48
889 0.46
890 0.39
891 0.39
892 0.35
893 0.29
894 0.26
895 0.28
896 0.28
897 0.25
898 0.26
899 0.26
900 0.24
901 0.24
902 0.25
903 0.23
904 0.23
905 0.24
906 0.26
907 0.21
908 0.19
909 0.19
910 0.18
911 0.16
912 0.15