Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HE25

Protein Details
Accession A0A179HE25    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-134DTKSWLMGQKKRQKKIEKARKLEEELAHydrophilic
284-312LAPSEIKVKKPKKKKSKGTRQRQRDEDDFBasic
356-376ALQRKSALKKRKKMRPEDIAKBasic
611-630GKGKTEKKLKQIDDEKRREABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-87KKKREERAAAIRKAREKA
117-128KKRQKKIEKARK
290-305KVKKPKKKKSKGTRQR
359-370RKSALKKRKKMR
612-617KGKTEK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 12.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG plj:VFPFJ_06980  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MDAATIEEANRIRVSLGMKPLPVPGADTAQDRDSSDASDSDGEPPASTLETRQAQAYDNYASHMEAEAQKKKREERAAAIRKAREKAQRFAAIEGHGLGEADKAGELDTKSWLMGQKKRQKKIEKARKLEEELAAAEAAAAAAVQYTSKDLAGIKVAHDSSAFLEGNDQILTLKDTTIDENEEEGDELENVDLRDQEKLSARLDLKKQRPGYNPNDDDDGERGILSQYDEEIDGKKTKKFTLDSDGAIAELSDILGQPAPKSNKLQSVSLDDVLGDAPLSSDYLAPSEIKVKKPKKKKSKGTRQRQRDEDDFFPLEPVEADENSMEIDSKDTSSGAKRKATTDMFVDDDDLQASLALQRKSALKKRKKMRPEDIAKQLKEQTDEPLDQSQDGGLVIGQTSEFVAGLTKRDEEEEEERKPRRQKEDESRDSKADWLNPGDDEDHAMEEADNLDGHDGTATERRSEAPDGDDNPIDEEKAVGSGMGAALSLLRERGLLQSSQDGSHEKMLQRQEYLRKKQELEDELDEKARQQRERDRSSGKLDRMSRADREEYARQQNAWRDHQHSRRVAELITATYKPNVQLKYTDEHGRSLDQKEAFKHLSHQFHGKGSGKGKTEKKLKQIDDEKRREAQSLFDANQGSAMNAATAQQLKKRREAGVRLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.22
3 0.3
4 0.3
5 0.31
6 0.32
7 0.34
8 0.32
9 0.29
10 0.26
11 0.2
12 0.21
13 0.22
14 0.24
15 0.24
16 0.25
17 0.26
18 0.24
19 0.25
20 0.21
21 0.2
22 0.19
23 0.17
24 0.17
25 0.18
26 0.18
27 0.18
28 0.21
29 0.19
30 0.18
31 0.18
32 0.17
33 0.16
34 0.15
35 0.14
36 0.18
37 0.22
38 0.22
39 0.24
40 0.24
41 0.25
42 0.27
43 0.28
44 0.24
45 0.21
46 0.22
47 0.21
48 0.2
49 0.18
50 0.16
51 0.17
52 0.19
53 0.27
54 0.33
55 0.39
56 0.44
57 0.49
58 0.56
59 0.61
60 0.65
61 0.63
62 0.64
63 0.7
64 0.75
65 0.77
66 0.77
67 0.75
68 0.72
69 0.69
70 0.67
71 0.66
72 0.61
73 0.6
74 0.62
75 0.64
76 0.59
77 0.58
78 0.54
79 0.45
80 0.4
81 0.34
82 0.25
83 0.16
84 0.15
85 0.12
86 0.08
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.05
91 0.06
92 0.09
93 0.09
94 0.1
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.15
99 0.2
100 0.24
101 0.31
102 0.4
103 0.48
104 0.58
105 0.66
106 0.74
107 0.78
108 0.82
109 0.86
110 0.87
111 0.88
112 0.87
113 0.87
114 0.85
115 0.81
116 0.75
117 0.65
118 0.56
119 0.46
120 0.38
121 0.29
122 0.21
123 0.15
124 0.09
125 0.07
126 0.05
127 0.03
128 0.02
129 0.02
130 0.02
131 0.03
132 0.03
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.08
138 0.09
139 0.13
140 0.14
141 0.13
142 0.17
143 0.17
144 0.17
145 0.16
146 0.16
147 0.13
148 0.17
149 0.17
150 0.12
151 0.13
152 0.13
153 0.14
154 0.13
155 0.12
156 0.07
157 0.08
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.11
164 0.12
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.13
169 0.12
170 0.11
171 0.1
172 0.09
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.1
182 0.1
183 0.13
184 0.16
185 0.19
186 0.19
187 0.24
188 0.26
189 0.3
190 0.38
191 0.44
192 0.46
193 0.52
194 0.56
195 0.58
196 0.63
197 0.65
198 0.66
199 0.67
200 0.63
201 0.57
202 0.54
203 0.47
204 0.42
205 0.34
206 0.27
207 0.17
208 0.14
209 0.12
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.09
219 0.11
220 0.15
221 0.16
222 0.19
223 0.21
224 0.22
225 0.27
226 0.28
227 0.3
228 0.33
229 0.35
230 0.33
231 0.32
232 0.3
233 0.24
234 0.21
235 0.17
236 0.09
237 0.05
238 0.04
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.12
246 0.14
247 0.17
248 0.2
249 0.23
250 0.29
251 0.31
252 0.33
253 0.29
254 0.32
255 0.32
256 0.29
257 0.26
258 0.18
259 0.17
260 0.15
261 0.12
262 0.06
263 0.04
264 0.03
265 0.03
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.14
275 0.17
276 0.21
277 0.31
278 0.4
279 0.48
280 0.58
281 0.68
282 0.72
283 0.8
284 0.86
285 0.87
286 0.9
287 0.92
288 0.93
289 0.93
290 0.92
291 0.9
292 0.86
293 0.8
294 0.73
295 0.68
296 0.58
297 0.53
298 0.43
299 0.35
300 0.28
301 0.22
302 0.17
303 0.12
304 0.11
305 0.07
306 0.06
307 0.07
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.04
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.11
321 0.16
322 0.19
323 0.22
324 0.23
325 0.25
326 0.3
327 0.31
328 0.28
329 0.25
330 0.23
331 0.2
332 0.19
333 0.19
334 0.13
335 0.12
336 0.1
337 0.08
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.11
343 0.11
344 0.11
345 0.12
346 0.17
347 0.23
348 0.31
349 0.39
350 0.44
351 0.53
352 0.62
353 0.7
354 0.75
355 0.79
356 0.8
357 0.8
358 0.79
359 0.78
360 0.79
361 0.78
362 0.69
363 0.62
364 0.57
365 0.48
366 0.42
367 0.35
368 0.28
369 0.24
370 0.24
371 0.23
372 0.22
373 0.2
374 0.18
375 0.17
376 0.13
377 0.09
378 0.09
379 0.07
380 0.04
381 0.04
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.05
391 0.05
392 0.07
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.09
397 0.1
398 0.14
399 0.2
400 0.24
401 0.27
402 0.34
403 0.36
404 0.41
405 0.48
406 0.5
407 0.53
408 0.55
409 0.61
410 0.65
411 0.74
412 0.78
413 0.77
414 0.73
415 0.65
416 0.58
417 0.51
418 0.43
419 0.35
420 0.28
421 0.24
422 0.22
423 0.2
424 0.21
425 0.18
426 0.16
427 0.14
428 0.12
429 0.1
430 0.09
431 0.09
432 0.08
433 0.07
434 0.07
435 0.06
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.06
444 0.11
445 0.12
446 0.12
447 0.13
448 0.14
449 0.17
450 0.19
451 0.18
452 0.18
453 0.21
454 0.23
455 0.26
456 0.25
457 0.22
458 0.23
459 0.22
460 0.18
461 0.13
462 0.11
463 0.08
464 0.08
465 0.07
466 0.04
467 0.04
468 0.04
469 0.05
470 0.04
471 0.04
472 0.03
473 0.03
474 0.04
475 0.04
476 0.04
477 0.04
478 0.05
479 0.05
480 0.08
481 0.11
482 0.11
483 0.12
484 0.17
485 0.18
486 0.19
487 0.2
488 0.19
489 0.19
490 0.23
491 0.26
492 0.22
493 0.27
494 0.32
495 0.32
496 0.34
497 0.38
498 0.43
499 0.49
500 0.58
501 0.6
502 0.6
503 0.6
504 0.62
505 0.65
506 0.59
507 0.55
508 0.52
509 0.45
510 0.41
511 0.41
512 0.36
513 0.3
514 0.32
515 0.32
516 0.29
517 0.35
518 0.43
519 0.51
520 0.58
521 0.63
522 0.62
523 0.62
524 0.67
525 0.68
526 0.62
527 0.6
528 0.57
529 0.56
530 0.56
531 0.56
532 0.51
533 0.48
534 0.47
535 0.42
536 0.45
537 0.46
538 0.47
539 0.51
540 0.49
541 0.46
542 0.48
543 0.53
544 0.54
545 0.54
546 0.52
547 0.5
548 0.57
549 0.64
550 0.67
551 0.66
552 0.61
553 0.58
554 0.54
555 0.47
556 0.42
557 0.35
558 0.3
559 0.27
560 0.26
561 0.23
562 0.22
563 0.24
564 0.23
565 0.28
566 0.27
567 0.25
568 0.28
569 0.31
570 0.34
571 0.38
572 0.42
573 0.37
574 0.38
575 0.37
576 0.38
577 0.39
578 0.36
579 0.38
580 0.34
581 0.37
582 0.37
583 0.42
584 0.4
585 0.37
586 0.42
587 0.43
588 0.46
589 0.46
590 0.51
591 0.46
592 0.47
593 0.54
594 0.5
595 0.49
596 0.47
597 0.5
598 0.47
599 0.53
600 0.57
601 0.58
602 0.65
603 0.65
604 0.69
605 0.73
606 0.72
607 0.74
608 0.77
609 0.79
610 0.8
611 0.81
612 0.77
613 0.74
614 0.72
615 0.65
616 0.55
617 0.5
618 0.47
619 0.47
620 0.42
621 0.4
622 0.39
623 0.35
624 0.37
625 0.31
626 0.23
627 0.16
628 0.14
629 0.1
630 0.09
631 0.1
632 0.11
633 0.16
634 0.18
635 0.25
636 0.33
637 0.38
638 0.45
639 0.51
640 0.55
641 0.59