Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R0H7

Protein Details
Accession C4R0H7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
157-184LSQNKLKGKKPQLTQKKKARRWDTQGNPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
163-177KGKKPQLTQKKKARR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.5, cyto 12, nucl 9, vacu 2, mito 1, extr 1, pero 1, E.R. 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR007222  Sig_recog_particle_rcpt_asu_N  
IPR013822  Signal_recog_particl_SRP54_hlx  
IPR036225  SRP/SRP_N  
IPR000897  SRP54_GTPase_dom  
IPR042101  SRP54_N_sf  
Gene Ontology GO:0005785  C:signal recognition particle receptor complex  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0005047  F:signal recognition particle binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
KEGG ppa:PAS_chr2-1_0379  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04086  SRP-alpha_N  
PF00448  SRP54  
PF02881  SRP54_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00300  SRP54  
Amino Acid Sequences MSEQFLIFTPKGTVLFKDEDRKVPDRVVNGLISDIFISQRKTLTGSVNNEEEFEDDDVGSYSLDGYTIKYVSSSQPTCYFTSCHSSLVNVPNEGQFLKDIQTLWEELITADLDSGAFPDEQELRKFTSFYNLKKQELFKNVGVETAKSTSTSEPHSLSQNKLKGKKPQLTQKKKARRWDTQGNPIEDDGLEESDLDFSSTTSEVGNQDVGHLVGDNYGKTKDGKFLVSDMKEINDILSKQRDKSVSDESTGAFSFLSGLFSGKTVTEDNLTKTSKSLSEHLINKNVAPEIAKKLVERINKSLVGTKVTTSIPKAARNALEKELLKLLTPETSINLLKEIQSKKAARKPYVISVVGVNGVGKSTNLSKLAFWLLSNKYRVLITACDTFRSGAVEQLRVHVNNLKKLTEDESHVELFQGGYGGADLVSKIAKGAIQYAEENKFDIVLLDTAGRRHNDAQLMAPLQGFVKAAKPDKIIMVGEALVGTDSVQQAKNFNGAFGPGRTLDFFIISKCDTVGDLIGSMVNMVYATGIPILFVGTGQTYTDLRTLSVDWAVDTLMS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.28
3 0.32
4 0.4
5 0.42
6 0.47
7 0.53
8 0.54
9 0.52
10 0.53
11 0.52
12 0.46
13 0.45
14 0.42
15 0.36
16 0.33
17 0.31
18 0.24
19 0.2
20 0.17
21 0.14
22 0.12
23 0.14
24 0.16
25 0.16
26 0.18
27 0.18
28 0.21
29 0.24
30 0.29
31 0.34
32 0.38
33 0.41
34 0.43
35 0.43
36 0.4
37 0.37
38 0.3
39 0.25
40 0.2
41 0.16
42 0.12
43 0.12
44 0.13
45 0.12
46 0.11
47 0.08
48 0.07
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.12
58 0.17
59 0.25
60 0.25
61 0.26
62 0.32
63 0.36
64 0.37
65 0.37
66 0.34
67 0.28
68 0.35
69 0.32
70 0.28
71 0.25
72 0.25
73 0.3
74 0.36
75 0.36
76 0.29
77 0.29
78 0.28
79 0.29
80 0.27
81 0.22
82 0.15
83 0.13
84 0.14
85 0.15
86 0.14
87 0.14
88 0.16
89 0.15
90 0.15
91 0.14
92 0.12
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.08
106 0.12
107 0.15
108 0.17
109 0.18
110 0.21
111 0.22
112 0.23
113 0.21
114 0.28
115 0.32
116 0.35
117 0.44
118 0.45
119 0.47
120 0.51
121 0.56
122 0.53
123 0.54
124 0.54
125 0.45
126 0.45
127 0.42
128 0.41
129 0.37
130 0.3
131 0.26
132 0.22
133 0.2
134 0.15
135 0.17
136 0.15
137 0.16
138 0.2
139 0.2
140 0.21
141 0.22
142 0.29
143 0.3
144 0.33
145 0.38
146 0.4
147 0.45
148 0.5
149 0.54
150 0.57
151 0.63
152 0.66
153 0.66
154 0.71
155 0.75
156 0.78
157 0.83
158 0.84
159 0.85
160 0.85
161 0.88
162 0.86
163 0.84
164 0.82
165 0.82
166 0.79
167 0.78
168 0.78
169 0.7
170 0.62
171 0.53
172 0.45
173 0.34
174 0.27
175 0.17
176 0.11
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.1
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.06
199 0.05
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.11
207 0.12
208 0.14
209 0.15
210 0.16
211 0.16
212 0.19
213 0.24
214 0.24
215 0.24
216 0.2
217 0.19
218 0.18
219 0.17
220 0.14
221 0.1
222 0.1
223 0.12
224 0.19
225 0.2
226 0.2
227 0.25
228 0.26
229 0.25
230 0.28
231 0.33
232 0.27
233 0.27
234 0.28
235 0.24
236 0.24
237 0.22
238 0.18
239 0.1
240 0.08
241 0.07
242 0.06
243 0.07
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.09
254 0.1
255 0.12
256 0.17
257 0.18
258 0.16
259 0.16
260 0.17
261 0.17
262 0.17
263 0.18
264 0.17
265 0.22
266 0.28
267 0.3
268 0.34
269 0.32
270 0.3
271 0.29
272 0.25
273 0.19
274 0.14
275 0.14
276 0.13
277 0.16
278 0.16
279 0.15
280 0.19
281 0.23
282 0.27
283 0.28
284 0.28
285 0.3
286 0.3
287 0.31
288 0.32
289 0.28
290 0.26
291 0.23
292 0.2
293 0.19
294 0.18
295 0.19
296 0.15
297 0.2
298 0.2
299 0.22
300 0.24
301 0.24
302 0.27
303 0.3
304 0.32
305 0.27
306 0.3
307 0.27
308 0.27
309 0.26
310 0.23
311 0.19
312 0.17
313 0.15
314 0.1
315 0.11
316 0.1
317 0.09
318 0.11
319 0.12
320 0.11
321 0.12
322 0.11
323 0.12
324 0.19
325 0.19
326 0.2
327 0.27
328 0.3
329 0.36
330 0.42
331 0.48
332 0.44
333 0.48
334 0.48
335 0.48
336 0.51
337 0.44
338 0.39
339 0.32
340 0.29
341 0.23
342 0.2
343 0.13
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.05
348 0.06
349 0.07
350 0.1
351 0.11
352 0.12
353 0.12
354 0.14
355 0.17
356 0.16
357 0.14
358 0.17
359 0.2
360 0.24
361 0.26
362 0.24
363 0.23
364 0.23
365 0.23
366 0.2
367 0.18
368 0.16
369 0.21
370 0.21
371 0.21
372 0.22
373 0.21
374 0.19
375 0.21
376 0.18
377 0.15
378 0.17
379 0.2
380 0.19
381 0.22
382 0.25
383 0.22
384 0.23
385 0.24
386 0.25
387 0.28
388 0.31
389 0.28
390 0.26
391 0.27
392 0.3
393 0.27
394 0.27
395 0.24
396 0.25
397 0.26
398 0.25
399 0.23
400 0.18
401 0.16
402 0.12
403 0.09
404 0.05
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.05
413 0.04
414 0.04
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.1
419 0.11
420 0.13
421 0.16
422 0.2
423 0.23
424 0.23
425 0.23
426 0.2
427 0.18
428 0.16
429 0.14
430 0.11
431 0.08
432 0.08
433 0.1
434 0.11
435 0.12
436 0.16
437 0.16
438 0.18
439 0.2
440 0.24
441 0.25
442 0.25
443 0.27
444 0.28
445 0.28
446 0.26
447 0.24
448 0.19
449 0.16
450 0.16
451 0.14
452 0.09
453 0.13
454 0.18
455 0.22
456 0.25
457 0.27
458 0.28
459 0.29
460 0.32
461 0.27
462 0.22
463 0.2
464 0.16
465 0.14
466 0.13
467 0.11
468 0.07
469 0.07
470 0.06
471 0.07
472 0.08
473 0.11
474 0.13
475 0.14
476 0.16
477 0.17
478 0.23
479 0.2
480 0.2
481 0.18
482 0.18
483 0.2
484 0.19
485 0.21
486 0.17
487 0.18
488 0.19
489 0.2
490 0.18
491 0.18
492 0.17
493 0.15
494 0.18
495 0.17
496 0.16
497 0.15
498 0.15
499 0.13
500 0.13
501 0.13
502 0.1
503 0.1
504 0.09
505 0.1
506 0.09
507 0.08
508 0.07
509 0.05
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.05
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.07
520 0.06
521 0.06
522 0.07
523 0.07
524 0.08
525 0.08
526 0.11
527 0.1
528 0.13
529 0.15
530 0.14
531 0.14
532 0.15
533 0.17
534 0.17
535 0.19
536 0.17
537 0.15
538 0.15