Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179GXA0

Protein Details
Accession A0A179GXA0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
97-120ARSRSAPPAKKSKNKLPPKNTAVYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-112RSAPPAKKSKNKL
Subcellular Location(s) cyto 15.5, cyto_nucl 14, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
IPR034392  TatSF1-like_RRM1  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG plj:VFPFJ_03658  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12281  RRM1_TatSF1_like  
Amino Acid Sequences MDPPFPKNPEEFDGDDRISFSKLDGKFIAVHDDGTEFEFDPELKEWIPTGDDDDEEPLEAEDYGGVTAPAAAAAHSNGGGAQKRKMDTAEEASEGTARSRSAPPAKKSKNKLPPKNTAVYVTGLPLDATVTEIHDLFSRKCGIIAEEIDSGAPRIKLYTDDAGQFKGDALVVFFKPPSVQMALTLLDDSDFRVLPSGKGEGRIRVQEADSSYKKVKYNPESGTSTPASQPSAKRPPQSDRQKVIKKTQKLDAKLADWSDEEDERFTAPAEVVPSKGHKKVILRQMFRIFELEEDPANVLEIKEDVRDECSKLGTVTSVVLYDQEPEGIVTVKFKEPEAALRCIELMDGRNFAGRIVVAEIATGKEKFRKSDGGKDDDDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.37
3 0.33
4 0.3
5 0.25
6 0.22
7 0.18
8 0.2
9 0.19
10 0.24
11 0.23
12 0.24
13 0.26
14 0.27
15 0.32
16 0.25
17 0.24
18 0.2
19 0.2
20 0.18
21 0.17
22 0.17
23 0.11
24 0.12
25 0.12
26 0.11
27 0.14
28 0.14
29 0.15
30 0.14
31 0.14
32 0.14
33 0.14
34 0.15
35 0.13
36 0.15
37 0.15
38 0.15
39 0.15
40 0.17
41 0.16
42 0.15
43 0.15
44 0.11
45 0.1
46 0.09
47 0.08
48 0.06
49 0.06
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.04
54 0.04
55 0.04
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.05
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.1
66 0.15
67 0.16
68 0.2
69 0.24
70 0.25
71 0.27
72 0.27
73 0.27
74 0.27
75 0.32
76 0.3
77 0.26
78 0.26
79 0.24
80 0.24
81 0.21
82 0.17
83 0.12
84 0.1
85 0.12
86 0.14
87 0.21
88 0.29
89 0.37
90 0.43
91 0.52
92 0.61
93 0.67
94 0.73
95 0.77
96 0.78
97 0.8
98 0.85
99 0.82
100 0.83
101 0.81
102 0.78
103 0.69
104 0.62
105 0.53
106 0.44
107 0.36
108 0.26
109 0.2
110 0.14
111 0.13
112 0.09
113 0.07
114 0.05
115 0.06
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.09
122 0.11
123 0.11
124 0.14
125 0.15
126 0.14
127 0.15
128 0.15
129 0.14
130 0.15
131 0.16
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.13
136 0.12
137 0.11
138 0.1
139 0.09
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.08
144 0.11
145 0.14
146 0.14
147 0.17
148 0.18
149 0.18
150 0.17
151 0.16
152 0.13
153 0.1
154 0.09
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.1
172 0.08
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.09
183 0.11
184 0.1
185 0.15
186 0.16
187 0.17
188 0.19
189 0.2
190 0.2
191 0.19
192 0.19
193 0.16
194 0.18
195 0.22
196 0.2
197 0.23
198 0.24
199 0.27
200 0.28
201 0.3
202 0.37
203 0.36
204 0.43
205 0.43
206 0.46
207 0.46
208 0.45
209 0.45
210 0.38
211 0.33
212 0.26
213 0.24
214 0.21
215 0.2
216 0.22
217 0.25
218 0.34
219 0.37
220 0.4
221 0.44
222 0.48
223 0.55
224 0.64
225 0.64
226 0.62
227 0.68
228 0.72
229 0.73
230 0.77
231 0.76
232 0.72
233 0.67
234 0.68
235 0.65
236 0.61
237 0.62
238 0.55
239 0.48
240 0.44
241 0.4
242 0.33
243 0.25
244 0.23
245 0.19
246 0.16
247 0.15
248 0.12
249 0.12
250 0.11
251 0.11
252 0.1
253 0.09
254 0.08
255 0.09
256 0.11
257 0.11
258 0.12
259 0.13
260 0.18
261 0.22
262 0.25
263 0.26
264 0.26
265 0.32
266 0.39
267 0.48
268 0.53
269 0.52
270 0.55
271 0.61
272 0.58
273 0.53
274 0.47
275 0.37
276 0.28
277 0.27
278 0.22
279 0.14
280 0.14
281 0.13
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.08
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.14
293 0.16
294 0.17
295 0.18
296 0.19
297 0.18
298 0.18
299 0.18
300 0.14
301 0.13
302 0.12
303 0.11
304 0.1
305 0.09
306 0.1
307 0.09
308 0.1
309 0.1
310 0.09
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.1
317 0.13
318 0.16
319 0.17
320 0.17
321 0.2
322 0.2
323 0.29
324 0.31
325 0.33
326 0.3
327 0.3
328 0.3
329 0.26
330 0.25
331 0.19
332 0.18
333 0.17
334 0.18
335 0.17
336 0.2
337 0.2
338 0.19
339 0.18
340 0.14
341 0.13
342 0.13
343 0.14
344 0.11
345 0.12
346 0.13
347 0.13
348 0.16
349 0.15
350 0.16
351 0.22
352 0.25
353 0.29
354 0.33
355 0.41
356 0.44
357 0.54
358 0.6
359 0.6
360 0.59