Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HY58

Protein Details
Accession A0A179HY58    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MERPAKRKRVDEPKDRITPRSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-9KRKR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito_nucl 12.333, mito 10.5, cyto_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG plj:VFPFJ_00931  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
Amino Acid Sequences MERPAKRKRVDEPKDRITPRSLSRPITPPRALQSRGPRVLPSPWQLTWIRDLPEELNRDAVSLKDLLGDPLISECWEFNFLHDIDFLMSAFDADTKHLVKVHVVHGFWKREDTNRLILAQEASKFSNVQLHVAPMPEMFGTHHSKMMILFRHDDTAQVIIHTANMIAKDWTNMTNGVWKSPPLPKLGGPPNASRGSRSAPLGTGEKFKWDLLSYLTSYDRRIPTCKPLVEALVEYDFSQIRAALVASVPGTHNVHDQSETAWGWAALKKCLRLIPCAEGDSNIVIQVSSIATLGGKDDWLQRTLFDPLSGAKGQQISKRPKFSVIYPTADEIRRSLDGYASGGSIHTKIQSQQQVKQLQYLRPILHHWANDCERGRSLPPELKLSDGGRNRAAPHIKTYIRYNSRGSLDWAILTSANLSKQAWGEAAKSGGEMRIASWEIGVLTWPELYGESSVMVSSFKTDTPTIGDDEHREKGPVVGLRVPYSLPLQPYGSEEEPWVPTMAHMTPDRFGRTWDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.81
3 0.75
4 0.69
5 0.67
6 0.63
7 0.64
8 0.61
9 0.55
10 0.59
11 0.64
12 0.66
13 0.67
14 0.63
15 0.58
16 0.59
17 0.63
18 0.59
19 0.58
20 0.62
21 0.63
22 0.65
23 0.62
24 0.56
25 0.51
26 0.54
27 0.53
28 0.49
29 0.45
30 0.39
31 0.43
32 0.43
33 0.42
34 0.42
35 0.4
36 0.35
37 0.3
38 0.32
39 0.3
40 0.35
41 0.36
42 0.3
43 0.3
44 0.27
45 0.27
46 0.25
47 0.22
48 0.17
49 0.14
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.14
55 0.13
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.09
63 0.12
64 0.12
65 0.12
66 0.18
67 0.17
68 0.18
69 0.18
70 0.16
71 0.14
72 0.15
73 0.13
74 0.08
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.06
80 0.07
81 0.11
82 0.12
83 0.13
84 0.15
85 0.16
86 0.17
87 0.21
88 0.26
89 0.27
90 0.26
91 0.31
92 0.36
93 0.4
94 0.38
95 0.39
96 0.36
97 0.37
98 0.42
99 0.41
100 0.4
101 0.38
102 0.38
103 0.33
104 0.32
105 0.29
106 0.25
107 0.23
108 0.18
109 0.17
110 0.17
111 0.17
112 0.16
113 0.21
114 0.18
115 0.18
116 0.17
117 0.18
118 0.19
119 0.19
120 0.19
121 0.12
122 0.13
123 0.1
124 0.1
125 0.08
126 0.12
127 0.17
128 0.18
129 0.2
130 0.19
131 0.2
132 0.21
133 0.25
134 0.25
135 0.21
136 0.24
137 0.23
138 0.26
139 0.25
140 0.24
141 0.2
142 0.18
143 0.15
144 0.12
145 0.11
146 0.08
147 0.09
148 0.08
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.17
162 0.17
163 0.18
164 0.18
165 0.17
166 0.19
167 0.24
168 0.27
169 0.23
170 0.25
171 0.24
172 0.31
173 0.38
174 0.41
175 0.39
176 0.38
177 0.41
178 0.43
179 0.42
180 0.35
181 0.31
182 0.28
183 0.27
184 0.26
185 0.21
186 0.18
187 0.2
188 0.21
189 0.2
190 0.2
191 0.18
192 0.19
193 0.19
194 0.18
195 0.17
196 0.15
197 0.15
198 0.13
199 0.15
200 0.13
201 0.14
202 0.16
203 0.16
204 0.16
205 0.21
206 0.22
207 0.21
208 0.24
209 0.24
210 0.3
211 0.36
212 0.35
213 0.31
214 0.29
215 0.29
216 0.27
217 0.24
218 0.18
219 0.12
220 0.12
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.09
245 0.11
246 0.11
247 0.09
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.11
252 0.11
253 0.12
254 0.13
255 0.14
256 0.15
257 0.18
258 0.19
259 0.2
260 0.21
261 0.22
262 0.22
263 0.23
264 0.21
265 0.19
266 0.18
267 0.15
268 0.13
269 0.09
270 0.07
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.09
285 0.11
286 0.12
287 0.12
288 0.12
289 0.14
290 0.17
291 0.16
292 0.12
293 0.11
294 0.1
295 0.14
296 0.14
297 0.12
298 0.11
299 0.15
300 0.17
301 0.22
302 0.3
303 0.36
304 0.42
305 0.48
306 0.47
307 0.48
308 0.48
309 0.47
310 0.49
311 0.44
312 0.41
313 0.36
314 0.37
315 0.36
316 0.35
317 0.31
318 0.22
319 0.2
320 0.17
321 0.17
322 0.15
323 0.12
324 0.12
325 0.12
326 0.12
327 0.09
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.1
336 0.17
337 0.26
338 0.29
339 0.34
340 0.41
341 0.46
342 0.45
343 0.51
344 0.49
345 0.44
346 0.46
347 0.45
348 0.38
349 0.34
350 0.36
351 0.34
352 0.33
353 0.32
354 0.28
355 0.3
356 0.32
357 0.37
358 0.36
359 0.33
360 0.3
361 0.3
362 0.31
363 0.27
364 0.3
365 0.28
366 0.29
367 0.32
368 0.32
369 0.31
370 0.33
371 0.32
372 0.34
373 0.33
374 0.34
375 0.31
376 0.33
377 0.32
378 0.36
379 0.39
380 0.33
381 0.34
382 0.39
383 0.38
384 0.39
385 0.44
386 0.46
387 0.47
388 0.49
389 0.47
390 0.45
391 0.46
392 0.45
393 0.43
394 0.36
395 0.3
396 0.27
397 0.24
398 0.19
399 0.16
400 0.15
401 0.12
402 0.11
403 0.11
404 0.12
405 0.12
406 0.13
407 0.13
408 0.15
409 0.14
410 0.14
411 0.15
412 0.15
413 0.16
414 0.14
415 0.14
416 0.13
417 0.13
418 0.12
419 0.11
420 0.09
421 0.13
422 0.14
423 0.13
424 0.12
425 0.12
426 0.11
427 0.11
428 0.11
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.09
436 0.09
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.07
444 0.09
445 0.1
446 0.1
447 0.13
448 0.14
449 0.15
450 0.19
451 0.21
452 0.21
453 0.22
454 0.24
455 0.26
456 0.31
457 0.33
458 0.3
459 0.29
460 0.27
461 0.27
462 0.3
463 0.29
464 0.28
465 0.29
466 0.31
467 0.32
468 0.33
469 0.31
470 0.27
471 0.26
472 0.25
473 0.22
474 0.23
475 0.22
476 0.22
477 0.25
478 0.29
479 0.28
480 0.25
481 0.25
482 0.26
483 0.26
484 0.26
485 0.24
486 0.17
487 0.16
488 0.19
489 0.19
490 0.2
491 0.22
492 0.23
493 0.26
494 0.3
495 0.36
496 0.32