Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179GTM2

Protein Details
Accession A0A179GTM2    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-61FGDFNPRKRRRVGGNNKEKAAHydrophilic
71-93DDGPGHRWKRKTLRNKGMNFVSSHydrophilic
305-326DSDEEEKKKRRAKKKALGTAGSBasic
610-631ALSDWNPKKKRQTHHLPHTWLFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-52RKRRRV
311-338KKKRRAKKKALGTAGSSAGSTPRRQKKK
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 8.5, cyto 6.5, pero 6, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR022783  GCFC_dom  
IPR022159  STIP/TFIP11_N  
IPR045211  TFP11/STIP/Ntr1  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000390  P:spliceosomal complex disassembly  
KEGG plj:VFPFJ_09261  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF07842  GCFC  
PF12457  TIP_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MDGSSFDPSRLTKASAAEFSSSASEDDDDYALPGGAEDNDFGDFNPRKRRRVGGNNKEKAALGIFGSDSEDDGPGHRWKRKTLRNKGMNFVSSTAQSAQGTDANGDDDQDDEDSDDYKPVLGNGHAAPAQDDEDDEDDEDDEDDEAGGGVGLGFAGAAHGLGWSARETQPDQGNTSQPTRPPSKPKTKFDGTNVLGRGFVPSSASVPVLNEPADGGTPPPQNKPAPSAFGAKGKINPKSFGARMMAKMGYVEGKGLGKEGQGRNIVIEANLRPQGVGLGAVKEKSEQERQEEKRQARLRGEEVVDSDEEEKKKRRAKKKALGTAGSSAGSTPRRQKKKYLTAEEFKAAAPGLNIPEAFAPILDMTGPEGKMLTSTSGVMTPTSGVPESAEVIEARKLVKRAQADLLAFSEEWKSLEERKKWLDLELKEREQEMDDLRSDFERLQGFSTLVSEQLAQNSDWAQVIGCLQKAVELGSINTETADIAVAAIHPFLRGTDWDPLANPTRFASDLKQLSGLFMKSGLNNDGRPVSKWDASAAHTDGVYRRHHKATTPYESMMYKCWLPQVLAAIREWDPLTPGSMLEVVESWNDLLPPFVRAQLMDNIARKLEAALSDWNPKKKRQTHHLPHTWLFPWLQYLPPYHLNPKGTGLVADVRRKFRHLIDAWEFERGVVPGLRQWEDVMGDQWRPLIMSHVLPSMGRYLRINFRVDPADQEPYLPILTGVLKWQRLLGGAVIGEVLAQGVLPMWYAKLREWLALDDADLGEVAEWYAWWRGSLLQDLAEVEGVSTELDKGLQIMNLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.34
3 0.35
4 0.32
5 0.3
6 0.28
7 0.27
8 0.23
9 0.18
10 0.16
11 0.14
12 0.13
13 0.14
14 0.13
15 0.11
16 0.11
17 0.12
18 0.1
19 0.09
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.08
26 0.1
27 0.1
28 0.1
29 0.18
30 0.22
31 0.28
32 0.39
33 0.44
34 0.48
35 0.54
36 0.62
37 0.63
38 0.7
39 0.75
40 0.76
41 0.8
42 0.83
43 0.79
44 0.73
45 0.62
46 0.53
47 0.43
48 0.33
49 0.22
50 0.17
51 0.15
52 0.13
53 0.15
54 0.13
55 0.12
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.11
60 0.15
61 0.21
62 0.28
63 0.34
64 0.37
65 0.45
66 0.56
67 0.65
68 0.72
69 0.75
70 0.8
71 0.83
72 0.85
73 0.84
74 0.81
75 0.74
76 0.65
77 0.56
78 0.47
79 0.38
80 0.35
81 0.28
82 0.23
83 0.2
84 0.18
85 0.18
86 0.17
87 0.17
88 0.15
89 0.14
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.11
94 0.09
95 0.1
96 0.1
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.11
108 0.1
109 0.14
110 0.13
111 0.17
112 0.17
113 0.17
114 0.17
115 0.16
116 0.17
117 0.13
118 0.13
119 0.12
120 0.13
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.09
128 0.07
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.02
139 0.02
140 0.02
141 0.02
142 0.02
143 0.02
144 0.02
145 0.02
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.04
150 0.06
151 0.09
152 0.11
153 0.14
154 0.16
155 0.22
156 0.28
157 0.3
158 0.32
159 0.32
160 0.35
161 0.35
162 0.38
163 0.35
164 0.32
165 0.36
166 0.39
167 0.42
168 0.48
169 0.55
170 0.62
171 0.68
172 0.73
173 0.75
174 0.76
175 0.76
176 0.72
177 0.72
178 0.63
179 0.61
180 0.55
181 0.46
182 0.39
183 0.32
184 0.29
185 0.18
186 0.16
187 0.11
188 0.1
189 0.11
190 0.12
191 0.12
192 0.1
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.12
204 0.17
205 0.19
206 0.22
207 0.26
208 0.28
209 0.3
210 0.34
211 0.32
212 0.31
213 0.32
214 0.34
215 0.32
216 0.35
217 0.35
218 0.31
219 0.35
220 0.36
221 0.41
222 0.38
223 0.37
224 0.35
225 0.39
226 0.38
227 0.35
228 0.34
229 0.3
230 0.29
231 0.3
232 0.27
233 0.21
234 0.2
235 0.17
236 0.14
237 0.11
238 0.1
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.17
246 0.17
247 0.21
248 0.22
249 0.22
250 0.22
251 0.22
252 0.21
253 0.14
254 0.16
255 0.12
256 0.14
257 0.15
258 0.15
259 0.14
260 0.13
261 0.13
262 0.1
263 0.11
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.1
268 0.1
269 0.11
270 0.12
271 0.15
272 0.21
273 0.21
274 0.28
275 0.37
276 0.43
277 0.51
278 0.58
279 0.55
280 0.59
281 0.63
282 0.61
283 0.56
284 0.54
285 0.47
286 0.44
287 0.43
288 0.35
289 0.3
290 0.26
291 0.21
292 0.17
293 0.17
294 0.15
295 0.15
296 0.18
297 0.22
298 0.27
299 0.35
300 0.43
301 0.52
302 0.59
303 0.69
304 0.75
305 0.81
306 0.83
307 0.83
308 0.76
309 0.68
310 0.59
311 0.5
312 0.4
313 0.29
314 0.2
315 0.17
316 0.16
317 0.16
318 0.23
319 0.31
320 0.39
321 0.42
322 0.5
323 0.57
324 0.66
325 0.73
326 0.74
327 0.72
328 0.69
329 0.7
330 0.63
331 0.53
332 0.42
333 0.33
334 0.23
335 0.16
336 0.1
337 0.09
338 0.08
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.05
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.05
352 0.06
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.05
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.06
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.08
382 0.09
383 0.1
384 0.12
385 0.16
386 0.17
387 0.18
388 0.2
389 0.23
390 0.21
391 0.21
392 0.2
393 0.16
394 0.14
395 0.13
396 0.11
397 0.07
398 0.08
399 0.07
400 0.08
401 0.14
402 0.22
403 0.24
404 0.27
405 0.3
406 0.33
407 0.33
408 0.36
409 0.36
410 0.32
411 0.38
412 0.4
413 0.38
414 0.35
415 0.35
416 0.31
417 0.25
418 0.24
419 0.18
420 0.14
421 0.13
422 0.13
423 0.13
424 0.13
425 0.13
426 0.11
427 0.12
428 0.11
429 0.11
430 0.12
431 0.12
432 0.12
433 0.11
434 0.13
435 0.09
436 0.08
437 0.08
438 0.07
439 0.07
440 0.08
441 0.09
442 0.08
443 0.08
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.08
448 0.07
449 0.06
450 0.07
451 0.08
452 0.07
453 0.07
454 0.06
455 0.07
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.07
460 0.07
461 0.09
462 0.09
463 0.08
464 0.08
465 0.07
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.03
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.04
475 0.04
476 0.04
477 0.04
478 0.04
479 0.05
480 0.06
481 0.08
482 0.13
483 0.14
484 0.14
485 0.15
486 0.18
487 0.23
488 0.23
489 0.21
490 0.16
491 0.17
492 0.18
493 0.19
494 0.19
495 0.2
496 0.22
497 0.22
498 0.23
499 0.22
500 0.22
501 0.22
502 0.2
503 0.12
504 0.12
505 0.12
506 0.1
507 0.12
508 0.14
509 0.14
510 0.14
511 0.16
512 0.18
513 0.18
514 0.19
515 0.23
516 0.23
517 0.23
518 0.24
519 0.24
520 0.23
521 0.24
522 0.26
523 0.21
524 0.18
525 0.16
526 0.17
527 0.17
528 0.19
529 0.23
530 0.24
531 0.27
532 0.3
533 0.31
534 0.34
535 0.41
536 0.46
537 0.49
538 0.48
539 0.45
540 0.43
541 0.43
542 0.4
543 0.33
544 0.27
545 0.19
546 0.16
547 0.18
548 0.16
549 0.15
550 0.16
551 0.2
552 0.2
553 0.21
554 0.2
555 0.21
556 0.2
557 0.22
558 0.2
559 0.14
560 0.12
561 0.12
562 0.13
563 0.1
564 0.1
565 0.09
566 0.1
567 0.1
568 0.08
569 0.08
570 0.07
571 0.07
572 0.08
573 0.07
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.07
578 0.07
579 0.09
580 0.09
581 0.11
582 0.11
583 0.11
584 0.14
585 0.17
586 0.21
587 0.23
588 0.25
589 0.24
590 0.24
591 0.24
592 0.21
593 0.17
594 0.15
595 0.11
596 0.11
597 0.15
598 0.17
599 0.27
600 0.31
601 0.39
602 0.4
603 0.45
604 0.53
605 0.57
606 0.63
607 0.65
608 0.72
609 0.75
610 0.83
611 0.86
612 0.83
613 0.77
614 0.73
615 0.63
616 0.54
617 0.43
618 0.33
619 0.28
620 0.22
621 0.22
622 0.2
623 0.21
624 0.23
625 0.29
626 0.32
627 0.33
628 0.37
629 0.37
630 0.36
631 0.37
632 0.34
633 0.29
634 0.26
635 0.23
636 0.24
637 0.28
638 0.34
639 0.36
640 0.4
641 0.41
642 0.44
643 0.45
644 0.41
645 0.45
646 0.4
647 0.44
648 0.45
649 0.5
650 0.48
651 0.48
652 0.44
653 0.34
654 0.33
655 0.24
656 0.2
657 0.14
658 0.14
659 0.13
660 0.18
661 0.2
662 0.18
663 0.19
664 0.18
665 0.19
666 0.19
667 0.19
668 0.17
669 0.16
670 0.16
671 0.16
672 0.14
673 0.13
674 0.12
675 0.14
676 0.13
677 0.15
678 0.17
679 0.18
680 0.18
681 0.18
682 0.19
683 0.21
684 0.2
685 0.19
686 0.2
687 0.23
688 0.31
689 0.36
690 0.39
691 0.33
692 0.37
693 0.39
694 0.38
695 0.39
696 0.34
697 0.35
698 0.31
699 0.31
700 0.27
701 0.25
702 0.24
703 0.18
704 0.14
705 0.1
706 0.11
707 0.11
708 0.16
709 0.2
710 0.21
711 0.22
712 0.23
713 0.22
714 0.22
715 0.23
716 0.17
717 0.14
718 0.13
719 0.13
720 0.11
721 0.1
722 0.08
723 0.07
724 0.06
725 0.03
726 0.03
727 0.03
728 0.03
729 0.03
730 0.04
731 0.05
732 0.06
733 0.09
734 0.1
735 0.12
736 0.2
737 0.21
738 0.24
739 0.25
740 0.27
741 0.27
742 0.26
743 0.25
744 0.19
745 0.18
746 0.15
747 0.12
748 0.1
749 0.07
750 0.07
751 0.06
752 0.04
753 0.04
754 0.06
755 0.09
756 0.1
757 0.1
758 0.11
759 0.14
760 0.17
761 0.22
762 0.21
763 0.19
764 0.2
765 0.21
766 0.21
767 0.18
768 0.15
769 0.1
770 0.09
771 0.08
772 0.07
773 0.07
774 0.06
775 0.06
776 0.06
777 0.06
778 0.07
779 0.09