Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179GSF5

Protein Details
Accession A0A179GSF5    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-102TLDAVPKAKRAPKKKKPAIHTPEARRVEHydrophilic
481-507GKDTGEPQSRRDRKKGWRRVQDDLDDNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-92PKAKRAPKKKKPA
490-497RRDRKKGW
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG plj:VFPFJ_09318  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSLAQLSQLLPLPEEDLRQVLDYAATLSKPEAAEHFNNLLGDSPLAVDFIASFNSHRKEPAPPPPAANNSRPAETLDAVPKAKRAPKKKKPAIHTPEARRVEDYAGPASVAYSKKDQILDYIPQRASAPSSSHASRSATPPAPAPVQQPPKQHASSAGFLISDIPSKSKAKSNPSSRSSTPKPSNTNSTKVSIAGGTPMAGQSTALADLDAAIRALEITTNPSLDNGKRRKCNCVATRHPLQSAAPNCLSCGKVICMKEGLGPCSFCGSPLLNPDDVQAMIRELKDERGRERMAVNASANRRAEVSKKPAPFMQPRVGDADDGSSLADAAAKAREHRDKLLNFQAQNARRTTVRDEAADFDVSGAVTGLGSMWASPEERAKELKRQQKLMREMEWNAQPDYEKRRQVLSIDLVGGKVVRKMAAIERPVTPESDEDEGVLGETSGNAASNGSRTGGGTFSANPLLGALLKPVYEIKEGNGKGKDTGEPQSRRDRKKGWRRVQDDLDDNEDVILDGGIHGHVGAAGDEPECG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.16
4 0.16
5 0.17
6 0.17
7 0.14
8 0.13
9 0.12
10 0.13
11 0.13
12 0.12
13 0.11
14 0.12
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.17
19 0.21
20 0.24
21 0.28
22 0.29
23 0.27
24 0.27
25 0.26
26 0.24
27 0.19
28 0.16
29 0.12
30 0.11
31 0.09
32 0.09
33 0.08
34 0.07
35 0.06
36 0.07
37 0.08
38 0.08
39 0.09
40 0.16
41 0.19
42 0.2
43 0.22
44 0.24
45 0.31
46 0.38
47 0.48
48 0.47
49 0.46
50 0.5
51 0.55
52 0.62
53 0.59
54 0.56
55 0.54
56 0.51
57 0.5
58 0.46
59 0.41
60 0.36
61 0.31
62 0.31
63 0.28
64 0.29
65 0.29
66 0.29
67 0.3
68 0.32
69 0.38
70 0.43
71 0.49
72 0.56
73 0.65
74 0.76
75 0.83
76 0.85
77 0.86
78 0.88
79 0.86
80 0.85
81 0.84
82 0.81
83 0.82
84 0.78
85 0.71
86 0.61
87 0.54
88 0.47
89 0.4
90 0.34
91 0.26
92 0.21
93 0.19
94 0.17
95 0.16
96 0.17
97 0.16
98 0.15
99 0.17
100 0.19
101 0.22
102 0.24
103 0.24
104 0.23
105 0.27
106 0.31
107 0.32
108 0.37
109 0.34
110 0.33
111 0.33
112 0.3
113 0.28
114 0.23
115 0.22
116 0.18
117 0.22
118 0.23
119 0.24
120 0.26
121 0.26
122 0.26
123 0.27
124 0.32
125 0.29
126 0.29
127 0.29
128 0.29
129 0.29
130 0.28
131 0.28
132 0.3
133 0.36
134 0.4
135 0.43
136 0.44
137 0.49
138 0.48
139 0.45
140 0.42
141 0.38
142 0.35
143 0.31
144 0.28
145 0.2
146 0.2
147 0.2
148 0.14
149 0.12
150 0.1
151 0.1
152 0.13
153 0.15
154 0.17
155 0.23
156 0.28
157 0.35
158 0.44
159 0.53
160 0.58
161 0.62
162 0.66
163 0.62
164 0.64
165 0.6
166 0.61
167 0.59
168 0.57
169 0.58
170 0.56
171 0.64
172 0.59
173 0.6
174 0.53
175 0.47
176 0.41
177 0.35
178 0.32
179 0.22
180 0.18
181 0.13
182 0.1
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.04
203 0.03
204 0.03
205 0.06
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.11
211 0.13
212 0.23
213 0.28
214 0.34
215 0.42
216 0.43
217 0.5
218 0.53
219 0.61
220 0.59
221 0.61
222 0.61
223 0.61
224 0.66
225 0.61
226 0.56
227 0.47
228 0.41
229 0.38
230 0.32
231 0.29
232 0.23
233 0.2
234 0.2
235 0.21
236 0.21
237 0.14
238 0.14
239 0.11
240 0.14
241 0.15
242 0.16
243 0.14
244 0.14
245 0.18
246 0.18
247 0.19
248 0.15
249 0.15
250 0.14
251 0.15
252 0.15
253 0.11
254 0.12
255 0.1
256 0.11
257 0.14
258 0.17
259 0.14
260 0.15
261 0.15
262 0.14
263 0.13
264 0.12
265 0.08
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.13
272 0.17
273 0.18
274 0.2
275 0.24
276 0.25
277 0.25
278 0.26
279 0.25
280 0.23
281 0.23
282 0.22
283 0.21
284 0.22
285 0.26
286 0.25
287 0.22
288 0.21
289 0.2
290 0.22
291 0.24
292 0.3
293 0.32
294 0.33
295 0.35
296 0.36
297 0.41
298 0.44
299 0.43
300 0.43
301 0.37
302 0.37
303 0.39
304 0.37
305 0.31
306 0.25
307 0.2
308 0.13
309 0.11
310 0.1
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.04
316 0.05
317 0.07
318 0.07
319 0.09
320 0.15
321 0.2
322 0.22
323 0.27
324 0.33
325 0.33
326 0.39
327 0.47
328 0.46
329 0.41
330 0.45
331 0.48
332 0.45
333 0.47
334 0.42
335 0.35
336 0.3
337 0.33
338 0.32
339 0.31
340 0.28
341 0.26
342 0.26
343 0.28
344 0.29
345 0.26
346 0.21
347 0.15
348 0.13
349 0.11
350 0.1
351 0.07
352 0.04
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.04
361 0.05
362 0.06
363 0.11
364 0.13
365 0.15
366 0.2
367 0.23
368 0.32
369 0.4
370 0.48
371 0.5
372 0.56
373 0.61
374 0.65
375 0.71
376 0.67
377 0.64
378 0.6
379 0.57
380 0.54
381 0.53
382 0.46
383 0.38
384 0.33
385 0.29
386 0.29
387 0.35
388 0.36
389 0.36
390 0.35
391 0.37
392 0.38
393 0.38
394 0.4
395 0.36
396 0.3
397 0.28
398 0.27
399 0.24
400 0.22
401 0.21
402 0.15
403 0.13
404 0.11
405 0.09
406 0.09
407 0.12
408 0.17
409 0.24
410 0.26
411 0.27
412 0.28
413 0.32
414 0.33
415 0.31
416 0.27
417 0.21
418 0.21
419 0.22
420 0.19
421 0.15
422 0.15
423 0.14
424 0.13
425 0.11
426 0.08
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.06
435 0.07
436 0.08
437 0.09
438 0.09
439 0.1
440 0.11
441 0.11
442 0.11
443 0.12
444 0.12
445 0.13
446 0.15
447 0.14
448 0.12
449 0.12
450 0.12
451 0.11
452 0.1
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.1
457 0.12
458 0.14
459 0.15
460 0.16
461 0.17
462 0.25
463 0.27
464 0.33
465 0.34
466 0.33
467 0.33
468 0.35
469 0.36
470 0.31
471 0.39
472 0.42
473 0.43
474 0.47
475 0.56
476 0.63
477 0.67
478 0.72
479 0.72
480 0.74
481 0.8
482 0.86
483 0.85
484 0.87
485 0.85
486 0.86
487 0.85
488 0.83
489 0.79
490 0.72
491 0.66
492 0.56
493 0.5
494 0.4
495 0.31
496 0.22
497 0.16
498 0.11
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.04
506 0.05
507 0.05
508 0.06
509 0.06
510 0.07