Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HR13

Protein Details
Accession A0A179HR13    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
397-423LSAAPAPGPPRKRKAPNVFMKPKKRVHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
403-423PGPPRKRKAPNVFMKPKKRVH
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG plj:VFPFJ_03523  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MSHVKSLMELATMAVIKNIRFLESVGDYLPYEAVRSILLRVENAHQLRRIELSSPQIQGHTGEIWIKIIENEFPMEYKATAYKPSSPEKWYKVWEKYKHEHDVALAESEAKLKRALAGLQEDKQRNTSQIVERKYLPRAGRVGPKQRHWSQRDTGSSTLSFAGGSRTKTNTGASVMKKVRREAREIASIKGQLSKPIRAPIRAPTLNKAPAAMVNDHRRAALPQYRVTGSSMEQYEQRATFLSDSDDDDLDNKPVLPTASARKTVSDAAKVSLLKKRPGTAPSTKPVVKQIPARAKSSSSPQKDGVSGSTSRSTASAVKPSGAANKSASAGGSGLAGKLNRSATINKAKPASDKPRARQDEDASDNDPPARLPTSTTVSSPPGEAGPSSPEEIVASLSAAPAPGPPRKRKAPNVFMKPKKRVH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.14
3 0.13
4 0.19
5 0.19
6 0.17
7 0.18
8 0.18
9 0.21
10 0.21
11 0.23
12 0.18
13 0.19
14 0.17
15 0.17
16 0.18
17 0.12
18 0.11
19 0.1
20 0.1
21 0.09
22 0.1
23 0.11
24 0.13
25 0.14
26 0.14
27 0.17
28 0.2
29 0.28
30 0.3
31 0.33
32 0.33
33 0.33
34 0.34
35 0.35
36 0.33
37 0.26
38 0.27
39 0.3
40 0.31
41 0.33
42 0.31
43 0.29
44 0.28
45 0.27
46 0.25
47 0.19
48 0.15
49 0.15
50 0.14
51 0.15
52 0.14
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.13
59 0.12
60 0.13
61 0.14
62 0.14
63 0.13
64 0.13
65 0.15
66 0.15
67 0.2
68 0.22
69 0.27
70 0.31
71 0.38
72 0.41
73 0.43
74 0.49
75 0.49
76 0.53
77 0.53
78 0.57
79 0.6
80 0.65
81 0.69
82 0.7
83 0.73
84 0.75
85 0.76
86 0.68
87 0.59
88 0.51
89 0.45
90 0.37
91 0.3
92 0.21
93 0.14
94 0.13
95 0.16
96 0.15
97 0.13
98 0.12
99 0.11
100 0.13
101 0.15
102 0.16
103 0.16
104 0.23
105 0.26
106 0.3
107 0.38
108 0.38
109 0.37
110 0.39
111 0.36
112 0.31
113 0.29
114 0.31
115 0.32
116 0.36
117 0.39
118 0.39
119 0.42
120 0.43
121 0.44
122 0.44
123 0.37
124 0.35
125 0.35
126 0.37
127 0.42
128 0.46
129 0.54
130 0.53
131 0.59
132 0.63
133 0.66
134 0.71
135 0.67
136 0.65
137 0.61
138 0.63
139 0.62
140 0.57
141 0.51
142 0.43
143 0.39
144 0.33
145 0.27
146 0.19
147 0.14
148 0.09
149 0.13
150 0.13
151 0.14
152 0.16
153 0.17
154 0.19
155 0.2
156 0.21
157 0.18
158 0.19
159 0.23
160 0.22
161 0.29
162 0.32
163 0.35
164 0.37
165 0.4
166 0.44
167 0.41
168 0.45
169 0.42
170 0.42
171 0.47
172 0.46
173 0.43
174 0.38
175 0.36
176 0.31
177 0.31
178 0.26
179 0.23
180 0.25
181 0.26
182 0.25
183 0.31
184 0.32
185 0.28
186 0.3
187 0.29
188 0.35
189 0.36
190 0.35
191 0.32
192 0.36
193 0.37
194 0.35
195 0.3
196 0.21
197 0.19
198 0.2
199 0.19
200 0.19
201 0.22
202 0.24
203 0.24
204 0.23
205 0.22
206 0.2
207 0.24
208 0.25
209 0.22
210 0.22
211 0.25
212 0.25
213 0.25
214 0.26
215 0.21
216 0.16
217 0.17
218 0.15
219 0.14
220 0.14
221 0.15
222 0.16
223 0.15
224 0.14
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.09
239 0.08
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.16
246 0.2
247 0.24
248 0.24
249 0.24
250 0.26
251 0.3
252 0.3
253 0.27
254 0.23
255 0.21
256 0.24
257 0.24
258 0.25
259 0.26
260 0.27
261 0.28
262 0.29
263 0.31
264 0.32
265 0.35
266 0.39
267 0.42
268 0.45
269 0.44
270 0.49
271 0.47
272 0.44
273 0.48
274 0.46
275 0.42
276 0.42
277 0.46
278 0.5
279 0.51
280 0.52
281 0.47
282 0.44
283 0.42
284 0.46
285 0.47
286 0.41
287 0.43
288 0.43
289 0.43
290 0.42
291 0.41
292 0.33
293 0.27
294 0.23
295 0.22
296 0.22
297 0.2
298 0.19
299 0.18
300 0.18
301 0.18
302 0.2
303 0.24
304 0.22
305 0.23
306 0.23
307 0.25
308 0.3
309 0.27
310 0.26
311 0.21
312 0.22
313 0.22
314 0.22
315 0.2
316 0.13
317 0.12
318 0.1
319 0.1
320 0.08
321 0.07
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.12
326 0.13
327 0.13
328 0.16
329 0.18
330 0.24
331 0.34
332 0.37
333 0.38
334 0.4
335 0.41
336 0.44
337 0.51
338 0.54
339 0.53
340 0.59
341 0.62
342 0.7
343 0.75
344 0.73
345 0.71
346 0.67
347 0.66
348 0.62
349 0.59
350 0.5
351 0.45
352 0.42
353 0.35
354 0.29
355 0.2
356 0.18
357 0.17
358 0.14
359 0.16
360 0.2
361 0.25
362 0.27
363 0.28
364 0.28
365 0.29
366 0.3
367 0.27
368 0.23
369 0.18
370 0.18
371 0.17
372 0.15
373 0.16
374 0.17
375 0.19
376 0.17
377 0.16
378 0.16
379 0.16
380 0.15
381 0.11
382 0.1
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.07
388 0.1
389 0.14
390 0.22
391 0.3
392 0.39
393 0.47
394 0.58
395 0.67
396 0.75
397 0.81
398 0.84
399 0.87
400 0.89
401 0.91
402 0.92
403 0.92