Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HM66

Protein Details
Accession A0A179HM66    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
300-330GTAPGKRPRGRPKGSKSSKARKDKGLKKSRPBasic
393-417ISTPGGRKRGRPKGSKNRPKSKPDABasic
543-567ETAGRRQKAPKAKRRRVTKDTNPGHBasic
696-722AQQQRQEQQRQEHRRQQQQQYQQQSPQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
303-330PGKRPRGRPKGSKSSKARKDKGLKKSRP
397-415GGRKRGRPKGSKNRPKSKP
547-558RRQKAPKAKRRR
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG plj:VFPFJ_03256  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MTRQHEIDEATEGEQTANGNGAAEDASPGPQTAETTTATVPAAQVDKSPSAQAPTLTQVIVPAPALARVMAPGPRRKSKTPIQDVSNSIRIHVDGRVKNPIPSRIQHIAKKDSGNFSVMHIGVSGTMSEDPDAAARRTSERTAAQARQASQGGWQPPKRSRAAWHTDGPDTPASRLASQPPAGTPRQHQQPPLAGPPPQEAKSEQARLLTLLRTLHPLLVVDQLCKALAYFGGIPGAPPPADGVFPQSATKNGPGSLLVGWLSEIFPHVENPGSIAPPLQLPPRSSAPDAPNWGNVVPSGTAPGKRPRGRPKGSKSSKARKDKGLKKSRPATLQSAGVSQPTAVGDRDEIGDATSNTPAAAAALEPLQPAATETEASAPDVPASNPNPDSSIISTPGGRKRGRPKGSKNRPKSKPDAPQETPDQQGSEPPAPAHQSPNTAPPTFNAGQSVAALPAGGLGSGSPPRNLALNNGASLPSQSSTRAAVPFVPSSQSPSQPHGQHTRPPVLSKAPHQNGRTTETKKRARAAESSDQVSTEEAAHQDETAGRRQKAPKAKRRRVTKDTNPGHVTGAAQSTEQDTRRSQAVSQSFVSETTTQPTSRSFDSQDSVHDSLSTRREGTVRGSPQQHRHQHQQQHQQTQQQQFGSQQPNASPTLTGVDRRAHPPMQATSSPQRRDATTTFYGLQAHSGMSPQMVFAQQQRQEQQRQEHRRQQQQQYQQQSPQPPQTTAPQRTNANMSHGVKPMDSHPQYRQNMAAQAPFGSAVARVSQQRNMGAGRGQRQGPPQQPVARQSQGGANQSRSQLQEQQLGEMNSFASSYGEQSFLNMDYGLTERDLQDAEAVMGRHGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.11
4 0.11
5 0.1
6 0.09
7 0.08
8 0.09
9 0.09
10 0.08
11 0.09
12 0.08
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.11
17 0.11
18 0.12
19 0.12
20 0.15
21 0.14
22 0.17
23 0.17
24 0.17
25 0.17
26 0.16
27 0.15
28 0.15
29 0.16
30 0.13
31 0.16
32 0.18
33 0.21
34 0.21
35 0.24
36 0.22
37 0.24
38 0.26
39 0.25
40 0.24
41 0.25
42 0.25
43 0.23
44 0.21
45 0.19
46 0.18
47 0.17
48 0.14
49 0.11
50 0.1
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.09
55 0.09
56 0.11
57 0.16
58 0.22
59 0.3
60 0.37
61 0.46
62 0.53
63 0.57
64 0.62
65 0.66
66 0.71
67 0.73
68 0.73
69 0.7
70 0.7
71 0.71
72 0.7
73 0.67
74 0.56
75 0.46
76 0.39
77 0.34
78 0.29
79 0.29
80 0.31
81 0.28
82 0.33
83 0.42
84 0.42
85 0.46
86 0.5
87 0.52
88 0.48
89 0.47
90 0.51
91 0.5
92 0.56
93 0.57
94 0.59
95 0.59
96 0.58
97 0.61
98 0.58
99 0.55
100 0.49
101 0.46
102 0.39
103 0.34
104 0.34
105 0.28
106 0.23
107 0.18
108 0.16
109 0.14
110 0.14
111 0.11
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.1
119 0.13
120 0.12
121 0.13
122 0.14
123 0.18
124 0.22
125 0.23
126 0.26
127 0.25
128 0.31
129 0.36
130 0.38
131 0.41
132 0.42
133 0.42
134 0.42
135 0.41
136 0.34
137 0.3
138 0.33
139 0.33
140 0.37
141 0.39
142 0.41
143 0.47
144 0.53
145 0.53
146 0.5
147 0.51
148 0.52
149 0.57
150 0.56
151 0.57
152 0.54
153 0.53
154 0.51
155 0.47
156 0.41
157 0.33
158 0.28
159 0.27
160 0.24
161 0.23
162 0.24
163 0.25
164 0.27
165 0.27
166 0.27
167 0.25
168 0.29
169 0.3
170 0.31
171 0.31
172 0.34
173 0.41
174 0.44
175 0.43
176 0.43
177 0.48
178 0.5
179 0.52
180 0.47
181 0.39
182 0.38
183 0.4
184 0.4
185 0.35
186 0.32
187 0.27
188 0.29
189 0.35
190 0.37
191 0.33
192 0.29
193 0.28
194 0.28
195 0.28
196 0.24
197 0.19
198 0.17
199 0.16
200 0.18
201 0.18
202 0.17
203 0.16
204 0.15
205 0.14
206 0.19
207 0.18
208 0.15
209 0.16
210 0.15
211 0.15
212 0.14
213 0.13
214 0.07
215 0.06
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.09
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.08
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.13
231 0.12
232 0.13
233 0.15
234 0.14
235 0.15
236 0.17
237 0.19
238 0.16
239 0.15
240 0.15
241 0.14
242 0.15
243 0.13
244 0.12
245 0.1
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.1
265 0.12
266 0.14
267 0.15
268 0.16
269 0.2
270 0.24
271 0.27
272 0.27
273 0.31
274 0.3
275 0.33
276 0.36
277 0.33
278 0.3
279 0.29
280 0.27
281 0.21
282 0.18
283 0.14
284 0.1
285 0.09
286 0.1
287 0.11
288 0.12
289 0.16
290 0.24
291 0.32
292 0.36
293 0.45
294 0.53
295 0.62
296 0.68
297 0.75
298 0.76
299 0.78
300 0.8
301 0.82
302 0.81
303 0.81
304 0.83
305 0.84
306 0.79
307 0.77
308 0.81
309 0.8
310 0.81
311 0.82
312 0.78
313 0.77
314 0.8
315 0.76
316 0.71
317 0.66
318 0.61
319 0.53
320 0.49
321 0.41
322 0.35
323 0.29
324 0.23
325 0.19
326 0.13
327 0.11
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.06
346 0.05
347 0.04
348 0.03
349 0.04
350 0.04
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.07
362 0.08
363 0.09
364 0.08
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.1
370 0.11
371 0.13
372 0.14
373 0.14
374 0.15
375 0.15
376 0.16
377 0.15
378 0.15
379 0.13
380 0.13
381 0.15
382 0.18
383 0.22
384 0.26
385 0.25
386 0.3
387 0.38
388 0.48
389 0.54
390 0.59
391 0.66
392 0.71
393 0.81
394 0.86
395 0.86
396 0.86
397 0.86
398 0.84
399 0.8
400 0.77
401 0.75
402 0.73
403 0.72
404 0.64
405 0.6
406 0.58
407 0.54
408 0.47
409 0.37
410 0.3
411 0.21
412 0.2
413 0.19
414 0.16
415 0.14
416 0.12
417 0.13
418 0.14
419 0.15
420 0.17
421 0.14
422 0.16
423 0.17
424 0.23
425 0.25
426 0.24
427 0.23
428 0.2
429 0.27
430 0.25
431 0.24
432 0.19
433 0.15
434 0.15
435 0.15
436 0.15
437 0.07
438 0.06
439 0.06
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.03
444 0.03
445 0.02
446 0.04
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.08
451 0.08
452 0.1
453 0.1
454 0.11
455 0.14
456 0.14
457 0.14
458 0.14
459 0.15
460 0.13
461 0.13
462 0.12
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.08
467 0.09
468 0.11
469 0.12
470 0.11
471 0.12
472 0.14
473 0.14
474 0.14
475 0.14
476 0.12
477 0.17
478 0.19
479 0.23
480 0.22
481 0.25
482 0.31
483 0.32
484 0.36
485 0.38
486 0.38
487 0.38
488 0.41
489 0.44
490 0.39
491 0.38
492 0.36
493 0.34
494 0.34
495 0.35
496 0.41
497 0.39
498 0.45
499 0.44
500 0.46
501 0.44
502 0.46
503 0.48
504 0.43
505 0.45
506 0.48
507 0.54
508 0.54
509 0.57
510 0.56
511 0.52
512 0.52
513 0.52
514 0.51
515 0.47
516 0.45
517 0.39
518 0.35
519 0.32
520 0.27
521 0.2
522 0.12
523 0.09
524 0.08
525 0.09
526 0.08
527 0.08
528 0.08
529 0.1
530 0.11
531 0.18
532 0.23
533 0.23
534 0.29
535 0.34
536 0.41
537 0.49
538 0.58
539 0.61
540 0.66
541 0.75
542 0.78
543 0.84
544 0.86
545 0.85
546 0.85
547 0.85
548 0.84
549 0.8
550 0.79
551 0.7
552 0.62
553 0.54
554 0.44
555 0.34
556 0.25
557 0.21
558 0.13
559 0.11
560 0.11
561 0.12
562 0.15
563 0.16
564 0.17
565 0.16
566 0.18
567 0.2
568 0.21
569 0.19
570 0.23
571 0.25
572 0.26
573 0.26
574 0.26
575 0.24
576 0.23
577 0.25
578 0.19
579 0.16
580 0.15
581 0.17
582 0.15
583 0.16
584 0.18
585 0.19
586 0.19
587 0.22
588 0.21
589 0.22
590 0.24
591 0.24
592 0.24
593 0.28
594 0.27
595 0.23
596 0.22
597 0.2
598 0.22
599 0.25
600 0.24
601 0.18
602 0.19
603 0.2
604 0.21
605 0.25
606 0.28
607 0.29
608 0.34
609 0.4
610 0.45
611 0.53
612 0.61
613 0.65
614 0.62
615 0.68
616 0.71
617 0.73
618 0.77
619 0.79
620 0.77
621 0.78
622 0.77
623 0.75
624 0.73
625 0.7
626 0.66
627 0.56
628 0.49
629 0.42
630 0.46
631 0.43
632 0.37
633 0.33
634 0.29
635 0.31
636 0.31
637 0.27
638 0.2
639 0.15
640 0.17
641 0.17
642 0.18
643 0.18
644 0.21
645 0.23
646 0.27
647 0.31
648 0.29
649 0.29
650 0.32
651 0.33
652 0.34
653 0.33
654 0.35
655 0.4
656 0.48
657 0.49
658 0.49
659 0.46
660 0.42
661 0.47
662 0.43
663 0.41
664 0.35
665 0.36
666 0.31
667 0.31
668 0.3
669 0.24
670 0.23
671 0.16
672 0.14
673 0.11
674 0.11
675 0.1
676 0.09
677 0.09
678 0.07
679 0.09
680 0.09
681 0.1
682 0.14
683 0.22
684 0.26
685 0.32
686 0.37
687 0.43
688 0.49
689 0.54
690 0.6
691 0.63
692 0.68
693 0.73
694 0.77
695 0.79
696 0.83
697 0.86
698 0.86
699 0.85
700 0.86
701 0.85
702 0.84
703 0.81
704 0.76
705 0.73
706 0.7
707 0.67
708 0.65
709 0.6
710 0.53
711 0.49
712 0.52
713 0.56
714 0.56
715 0.56
716 0.53
717 0.52
718 0.54
719 0.56
720 0.49
721 0.45
722 0.46
723 0.43
724 0.42
725 0.43
726 0.41
727 0.35
728 0.35
729 0.32
730 0.34
731 0.34
732 0.33
733 0.37
734 0.46
735 0.49
736 0.5
737 0.51
738 0.44
739 0.46
740 0.44
741 0.39
742 0.3
743 0.28
744 0.25
745 0.22
746 0.18
747 0.13
748 0.11
749 0.09
750 0.1
751 0.12
752 0.18
753 0.21
754 0.25
755 0.28
756 0.3
757 0.32
758 0.31
759 0.3
760 0.3
761 0.33
762 0.34
763 0.37
764 0.37
765 0.38
766 0.43
767 0.5
768 0.52
769 0.52
770 0.54
771 0.56
772 0.59
773 0.6
774 0.61
775 0.55
776 0.49
777 0.45
778 0.44
779 0.43
780 0.44
781 0.44
782 0.4
783 0.42
784 0.43
785 0.46
786 0.42
787 0.41
788 0.41
789 0.41
790 0.44
791 0.4
792 0.41
793 0.43
794 0.4
795 0.36
796 0.28
797 0.24
798 0.17
799 0.16
800 0.12
801 0.09
802 0.09
803 0.11
804 0.12
805 0.13
806 0.13
807 0.14
808 0.16
809 0.15
810 0.16
811 0.13
812 0.11
813 0.11
814 0.13
815 0.14
816 0.13
817 0.14
818 0.13
819 0.15
820 0.16
821 0.15
822 0.14
823 0.14
824 0.13
825 0.15
826 0.15