Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HTL6

Protein Details
Accession A0A179HTL6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-52ASSAAAQPPRKKQKTTKEAPLNAVPHydrophilic
70-92GLGPKVTASKRPKPNPHLDAKDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-41RSRPTPKSTPAAPKAAAGSRRKHASSAAAQPPRKKQK
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 9, cyto_mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009091  RCC1/BLIP-II  
IPR000408  Reg_chr_condens  
KEGG plj:VFPFJ_02879  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00415  RCC1  
PF13540  RCC1_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00625  RCC1_1  
PS00626  RCC1_2  
PS50012  RCC1_3  
Amino Acid Sequences MSSRRSRPTPKSTPAAPKAAAGSRRKHASSAAAQPPRKKQKTTKEAPLNAVPETVLAVFMFGSGENGELGLGPKVTASKRPKPNPHLDAKDSSALHIVRLACGGMHTVALTADNRLITWGVNDNDALGRPTNWEGKLRDADAGSDNDDAELNPRESTPTEVSTENIPGATKFVDVAAGDSCSFAVTDTGLVYGWGTFRNSEGKESFGYTAGGALIKRQPVPMLIPGLLRVTQLVCGANHALALDAAGTVWAWGCGQQNQFGRRLFGRHQESLRPRPVPVCRSGARLIASGEYHCFAVGQRRDDVWGWGLNSFGQTGDATSAGGDSALLPYPVKIPALCGQGVAVIAGGAHHSVAITADGQVYTWGRMDGGHLGIKFTDQQLGDDTVVRRDERDKPRICLQPTPVPQIGEAVHAACGTDHTIFVAKDGRAWATGFGSEGQLGLGSDDDVDVAQLIQGKAVKDRKLTWAGAGGQFSSVAGPAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.75
3 0.65
4 0.58
5 0.55
6 0.54
7 0.54
8 0.5
9 0.5
10 0.51
11 0.57
12 0.56
13 0.52
14 0.49
15 0.49
16 0.49
17 0.53
18 0.55
19 0.57
20 0.6
21 0.66
22 0.73
23 0.76
24 0.75
25 0.74
26 0.74
27 0.76
28 0.82
29 0.84
30 0.84
31 0.84
32 0.83
33 0.81
34 0.78
35 0.69
36 0.58
37 0.49
38 0.38
39 0.27
40 0.23
41 0.16
42 0.1
43 0.07
44 0.07
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.05
49 0.06
50 0.05
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.06
60 0.07
61 0.11
62 0.13
63 0.22
64 0.3
65 0.39
66 0.49
67 0.59
68 0.69
69 0.74
70 0.83
71 0.82
72 0.84
73 0.81
74 0.76
75 0.71
76 0.64
77 0.61
78 0.51
79 0.44
80 0.39
81 0.31
82 0.26
83 0.25
84 0.22
85 0.16
86 0.16
87 0.15
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.1
106 0.14
107 0.13
108 0.14
109 0.14
110 0.14
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.1
115 0.1
116 0.11
117 0.15
118 0.19
119 0.2
120 0.25
121 0.25
122 0.3
123 0.33
124 0.32
125 0.31
126 0.26
127 0.26
128 0.24
129 0.23
130 0.19
131 0.16
132 0.15
133 0.12
134 0.12
135 0.1
136 0.11
137 0.12
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.13
142 0.13
143 0.18
144 0.18
145 0.17
146 0.18
147 0.18
148 0.19
149 0.19
150 0.2
151 0.15
152 0.13
153 0.11
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.13
186 0.13
187 0.16
188 0.16
189 0.17
190 0.18
191 0.19
192 0.19
193 0.14
194 0.14
195 0.1
196 0.1
197 0.08
198 0.09
199 0.07
200 0.08
201 0.09
202 0.1
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.13
208 0.13
209 0.13
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.13
214 0.12
215 0.1
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.04
229 0.04
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.02
234 0.02
235 0.02
236 0.02
237 0.03
238 0.02
239 0.04
240 0.06
241 0.09
242 0.1
243 0.16
244 0.2
245 0.23
246 0.27
247 0.26
248 0.27
249 0.25
250 0.28
251 0.25
252 0.29
253 0.33
254 0.33
255 0.34
256 0.4
257 0.47
258 0.5
259 0.53
260 0.45
261 0.41
262 0.42
263 0.46
264 0.42
265 0.39
266 0.38
267 0.33
268 0.36
269 0.37
270 0.34
271 0.3
272 0.27
273 0.23
274 0.18
275 0.18
276 0.14
277 0.13
278 0.11
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.15
284 0.18
285 0.2
286 0.21
287 0.21
288 0.23
289 0.24
290 0.25
291 0.18
292 0.17
293 0.15
294 0.14
295 0.14
296 0.12
297 0.12
298 0.1
299 0.08
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.05
307 0.05
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.03
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.08
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.11
322 0.15
323 0.19
324 0.18
325 0.17
326 0.16
327 0.16
328 0.16
329 0.13
330 0.08
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.04
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.09
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.1
355 0.11
356 0.12
357 0.15
358 0.14
359 0.15
360 0.15
361 0.16
362 0.15
363 0.13
364 0.16
365 0.13
366 0.14
367 0.16
368 0.19
369 0.19
370 0.22
371 0.22
372 0.21
373 0.23
374 0.22
375 0.21
376 0.24
377 0.33
378 0.39
379 0.48
380 0.49
381 0.52
382 0.61
383 0.67
384 0.66
385 0.63
386 0.6
387 0.6
388 0.6
389 0.62
390 0.56
391 0.49
392 0.45
393 0.41
394 0.35
395 0.27
396 0.22
397 0.15
398 0.13
399 0.12
400 0.12
401 0.09
402 0.1
403 0.09
404 0.09
405 0.08
406 0.09
407 0.13
408 0.12
409 0.14
410 0.19
411 0.17
412 0.19
413 0.21
414 0.21
415 0.19
416 0.2
417 0.2
418 0.16
419 0.16
420 0.15
421 0.14
422 0.14
423 0.12
424 0.11
425 0.1
426 0.08
427 0.08
428 0.07
429 0.07
430 0.05
431 0.06
432 0.05
433 0.06
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.06
439 0.1
440 0.1
441 0.12
442 0.15
443 0.16
444 0.24
445 0.31
446 0.35
447 0.36
448 0.39
449 0.45
450 0.49
451 0.49
452 0.44
453 0.44
454 0.44
455 0.44
456 0.42
457 0.34
458 0.27
459 0.26
460 0.23
461 0.17