Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HHU1

Protein Details
Accession A0A179HHU1    Localization Confidence Low Confidence Score 8.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-62ASFYTSKPKRTAKSSKGKTVSLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11, cyto 8.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007855  RNA-dep_RNA_pol_euk-typ  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003968  F:RNA-dependent RNA polymerase activity  
GO:0031047  P:RNA-mediated gene silencing  
KEGG plj:VFPFJ_05894  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05183  RdRP  
Amino Acid Sequences MPSPTEMKDLPDALKNVPEFSEQVIRWLTQDTHRLLDRDWASFYTSKPKRTAKSSKGKTVSLERIYLFAVGGDNFQTSHTRGSVPPGDEALLPGCRTNMKLSTLLEWAVGIQHNATDQAAKLFTRIALSLTKTRATVVVAHQDIRHRDKDLGESQHVMNDGAARMSRTLAKKIADHLELDATPAAYQGRFGCAKGMWIVDVRDDGLDGDEWIETYPSQRKWKCPFEDPQHRTFEVKDWSRELRTAVLNQQFIPVLEACAVDEDRMRNAIAAHLTNSLRMELEAGKTALTKPTEMRRWLTQFGQASETKSHKPFMGGLPSSDEDAVAYLLDAGFDQRQNCFVQDLCVALVRKKMETLKTKMHVRVPRSSYLFMVPDFWNILKENEVHVSFSNRFQVDGFSDTLLEGMDILVGRSPAHLASDIQRVRVISHTTLRRLKDVIVMSTKGTMSLAEKLSGGDYDGDKAWVCWDREIVDTFCNAPVPAGLKVASLVKKNYLERLDVTVKSLTTRPNVEEMCTRFVYTAFSFHMEASLLGTVTNYKEKLSYHRGSIMDERVVWLSNFLSHLVDQGKQGIKFTPDHWARVRREQLQTPLHLDDPDYALERRVSKPSKLRRLRDHILDHLKFSVGVPAISFALADFERTIKGNGGEWFDADLTKPANDFEQVCGSWADGRKVLRKLRHDIEEVVSAWGLAMGQLRESMKDYSGKVKLIYEMWMSIAPADDVQSSPRVSALTEPWVADPKAKRWTLLKASLTFKIYYRKLPKFVWRVAGRQLCELKCLANGAHSGSSYAFVNPEMYASLRPSKTFTTQLAIRENGAETAESIVASVNELFDGEEWADAYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.33
3 0.3
4 0.28
5 0.28
6 0.23
7 0.25
8 0.32
9 0.25
10 0.29
11 0.3
12 0.29
13 0.27
14 0.3
15 0.29
16 0.27
17 0.34
18 0.33
19 0.36
20 0.39
21 0.4
22 0.37
23 0.43
24 0.39
25 0.34
26 0.34
27 0.29
28 0.3
29 0.31
30 0.32
31 0.34
32 0.37
33 0.4
34 0.46
35 0.54
36 0.56
37 0.64
38 0.73
39 0.73
40 0.78
41 0.81
42 0.83
43 0.81
44 0.77
45 0.72
46 0.71
47 0.7
48 0.63
49 0.57
50 0.47
51 0.43
52 0.41
53 0.35
54 0.25
55 0.17
56 0.14
57 0.1
58 0.11
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.11
63 0.14
64 0.13
65 0.16
66 0.17
67 0.19
68 0.19
69 0.27
70 0.32
71 0.31
72 0.31
73 0.29
74 0.29
75 0.26
76 0.27
77 0.22
78 0.18
79 0.17
80 0.15
81 0.15
82 0.16
83 0.17
84 0.21
85 0.22
86 0.23
87 0.27
88 0.28
89 0.29
90 0.3
91 0.28
92 0.23
93 0.19
94 0.16
95 0.14
96 0.13
97 0.11
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.11
106 0.13
107 0.12
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.14
112 0.14
113 0.13
114 0.15
115 0.19
116 0.24
117 0.26
118 0.27
119 0.25
120 0.26
121 0.25
122 0.23
123 0.23
124 0.22
125 0.28
126 0.28
127 0.3
128 0.31
129 0.35
130 0.4
131 0.42
132 0.4
133 0.34
134 0.35
135 0.35
136 0.41
137 0.43
138 0.43
139 0.39
140 0.39
141 0.37
142 0.37
143 0.35
144 0.28
145 0.21
146 0.16
147 0.14
148 0.12
149 0.13
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.18
154 0.19
155 0.23
156 0.26
157 0.28
158 0.29
159 0.34
160 0.38
161 0.34
162 0.31
163 0.28
164 0.27
165 0.25
166 0.24
167 0.19
168 0.13
169 0.12
170 0.12
171 0.11
172 0.08
173 0.1
174 0.09
175 0.13
176 0.14
177 0.14
178 0.16
179 0.15
180 0.17
181 0.17
182 0.17
183 0.13
184 0.14
185 0.14
186 0.13
187 0.13
188 0.12
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.06
201 0.09
202 0.16
203 0.21
204 0.31
205 0.34
206 0.43
207 0.51
208 0.61
209 0.63
210 0.64
211 0.68
212 0.69
213 0.77
214 0.73
215 0.72
216 0.68
217 0.63
218 0.57
219 0.48
220 0.44
221 0.41
222 0.41
223 0.38
224 0.36
225 0.39
226 0.39
227 0.39
228 0.34
229 0.3
230 0.27
231 0.27
232 0.3
233 0.31
234 0.31
235 0.29
236 0.29
237 0.25
238 0.23
239 0.22
240 0.15
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.08
245 0.1
246 0.1
247 0.08
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.16
260 0.16
261 0.16
262 0.17
263 0.15
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.09
268 0.1
269 0.11
270 0.11
271 0.1
272 0.11
273 0.12
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.16
278 0.24
279 0.3
280 0.32
281 0.35
282 0.37
283 0.41
284 0.43
285 0.4
286 0.38
287 0.34
288 0.33
289 0.34
290 0.28
291 0.26
292 0.28
293 0.3
294 0.28
295 0.27
296 0.27
297 0.23
298 0.23
299 0.24
300 0.23
301 0.28
302 0.25
303 0.23
304 0.26
305 0.26
306 0.25
307 0.22
308 0.18
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.05
313 0.04
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.04
319 0.05
320 0.07
321 0.08
322 0.08
323 0.1
324 0.11
325 0.12
326 0.12
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.1
332 0.12
333 0.12
334 0.12
335 0.16
336 0.15
337 0.14
338 0.17
339 0.2
340 0.24
341 0.31
342 0.35
343 0.39
344 0.44
345 0.5
346 0.51
347 0.55
348 0.53
349 0.5
350 0.53
351 0.49
352 0.49
353 0.46
354 0.43
355 0.37
356 0.33
357 0.3
358 0.22
359 0.22
360 0.16
361 0.14
362 0.14
363 0.13
364 0.12
365 0.12
366 0.12
367 0.1
368 0.1
369 0.11
370 0.13
371 0.13
372 0.13
373 0.12
374 0.16
375 0.15
376 0.16
377 0.19
378 0.16
379 0.16
380 0.16
381 0.16
382 0.14
383 0.15
384 0.14
385 0.1
386 0.1
387 0.09
388 0.09
389 0.08
390 0.06
391 0.04
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.08
406 0.16
407 0.17
408 0.17
409 0.18
410 0.17
411 0.17
412 0.19
413 0.19
414 0.13
415 0.19
416 0.21
417 0.26
418 0.31
419 0.31
420 0.3
421 0.29
422 0.28
423 0.27
424 0.25
425 0.22
426 0.2
427 0.2
428 0.18
429 0.19
430 0.18
431 0.13
432 0.11
433 0.09
434 0.08
435 0.11
436 0.11
437 0.1
438 0.11
439 0.11
440 0.11
441 0.1
442 0.09
443 0.07
444 0.06
445 0.07
446 0.07
447 0.08
448 0.07
449 0.07
450 0.09
451 0.12
452 0.13
453 0.12
454 0.13
455 0.14
456 0.16
457 0.18
458 0.17
459 0.13
460 0.13
461 0.13
462 0.13
463 0.12
464 0.1
465 0.07
466 0.07
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.09
473 0.13
474 0.14
475 0.14
476 0.15
477 0.18
478 0.21
479 0.22
480 0.27
481 0.25
482 0.24
483 0.23
484 0.28
485 0.28
486 0.25
487 0.26
488 0.22
489 0.2
490 0.2
491 0.21
492 0.18
493 0.17
494 0.19
495 0.18
496 0.23
497 0.23
498 0.23
499 0.26
500 0.26
501 0.28
502 0.26
503 0.25
504 0.19
505 0.19
506 0.21
507 0.16
508 0.16
509 0.13
510 0.14
511 0.14
512 0.14
513 0.14
514 0.11
515 0.1
516 0.09
517 0.08
518 0.06
519 0.05
520 0.06
521 0.06
522 0.07
523 0.1
524 0.09
525 0.09
526 0.11
527 0.12
528 0.19
529 0.27
530 0.28
531 0.27
532 0.33
533 0.33
534 0.35
535 0.38
536 0.34
537 0.27
538 0.24
539 0.23
540 0.18
541 0.18
542 0.15
543 0.12
544 0.09
545 0.09
546 0.09
547 0.09
548 0.09
549 0.08
550 0.11
551 0.12
552 0.13
553 0.12
554 0.17
555 0.2
556 0.19
557 0.2
558 0.19
559 0.2
560 0.21
561 0.21
562 0.26
563 0.25
564 0.29
565 0.34
566 0.41
567 0.43
568 0.5
569 0.56
570 0.52
571 0.56
572 0.57
573 0.59
574 0.55
575 0.54
576 0.49
577 0.44
578 0.38
579 0.32
580 0.28
581 0.21
582 0.17
583 0.16
584 0.15
585 0.13
586 0.14
587 0.16
588 0.19
589 0.2
590 0.27
591 0.29
592 0.33
593 0.43
594 0.51
595 0.6
596 0.66
597 0.72
598 0.73
599 0.79
600 0.79
601 0.78
602 0.73
603 0.71
604 0.71
605 0.64
606 0.56
607 0.47
608 0.41
609 0.33
610 0.28
611 0.23
612 0.14
613 0.13
614 0.11
615 0.12
616 0.12
617 0.11
618 0.11
619 0.06
620 0.08
621 0.08
622 0.09
623 0.08
624 0.08
625 0.1
626 0.11
627 0.12
628 0.11
629 0.12
630 0.15
631 0.18
632 0.21
633 0.2
634 0.19
635 0.2
636 0.18
637 0.17
638 0.14
639 0.14
640 0.11
641 0.11
642 0.11
643 0.1
644 0.11
645 0.13
646 0.14
647 0.14
648 0.18
649 0.17
650 0.18
651 0.18
652 0.17
653 0.2
654 0.22
655 0.21
656 0.2
657 0.23
658 0.29
659 0.36
660 0.43
661 0.46
662 0.5
663 0.56
664 0.6
665 0.62
666 0.59
667 0.54
668 0.51
669 0.47
670 0.41
671 0.34
672 0.26
673 0.2
674 0.16
675 0.13
676 0.09
677 0.06
678 0.08
679 0.07
680 0.07
681 0.11
682 0.11
683 0.12
684 0.15
685 0.16
686 0.16
687 0.2
688 0.21
689 0.27
690 0.3
691 0.31
692 0.29
693 0.29
694 0.29
695 0.27
696 0.28
697 0.21
698 0.18
699 0.18
700 0.17
701 0.16
702 0.13
703 0.13
704 0.1
705 0.09
706 0.09
707 0.09
708 0.08
709 0.1
710 0.13
711 0.13
712 0.13
713 0.14
714 0.13
715 0.12
716 0.16
717 0.17
718 0.2
719 0.21
720 0.22
721 0.23
722 0.28
723 0.27
724 0.3
725 0.31
726 0.32
727 0.39
728 0.39
729 0.4
730 0.39
731 0.48
732 0.5
733 0.55
734 0.55
735 0.52
736 0.55
737 0.57
738 0.56
739 0.48
740 0.43
741 0.43
742 0.4
743 0.44
744 0.5
745 0.52
746 0.56
747 0.6
748 0.67
749 0.67
750 0.69
751 0.69
752 0.64
753 0.61
754 0.65
755 0.66
756 0.57
757 0.56
758 0.58
759 0.49
760 0.47
761 0.43
762 0.35
763 0.29
764 0.29
765 0.22
766 0.18
767 0.19
768 0.2
769 0.21
770 0.19
771 0.19
772 0.17
773 0.19
774 0.16
775 0.15
776 0.13
777 0.11
778 0.13
779 0.11
780 0.12
781 0.11
782 0.12
783 0.13
784 0.17
785 0.25
786 0.25
787 0.26
788 0.29
789 0.33
790 0.36
791 0.4
792 0.38
793 0.37
794 0.39
795 0.44
796 0.47
797 0.44
798 0.4
799 0.36
800 0.35
801 0.28
802 0.25
803 0.19
804 0.13
805 0.15
806 0.14
807 0.11
808 0.1
809 0.1
810 0.09
811 0.1
812 0.1
813 0.08
814 0.07
815 0.08
816 0.08
817 0.07
818 0.1
819 0.09
820 0.09