Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179H5K9

Protein Details
Accession A0A179H5K9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-76AVLMGPKPKKPPPKPKTPRMSHPNPFKDRBasic
297-316RDLVCWRCGRNYKNHFKELKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-66PKPKKPPPKPKTPR
Subcellular Location(s) cyto 13, cyto_nucl 11.5, nucl 8, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011146  HIT-like  
IPR036265  HIT-like_sf  
IPR032566  Znf-C2HE  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006139  P:nucleobase-containing compound metabolic process  
KEGG plj:VFPFJ_07836  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01230  HIT  
PF16278  zf-C2HE  
Amino Acid Sequences MADMDTDSEEAMTKEELQAEEPPPPPPPPAGNAASSSASAPAQQNAFAVLMGPKPKKPPPKPKTPRMSHPNPFKDRMALGAYLSDPASFPASSPVIYHNADFVALRDKFPKATVHALLLPRSPAVNLLHPFDALADPTFLREVQEEVARLRKLVAGELRRRLGRFSRADKAREAVLNGEVDVTPAAGGGGAGGGDGGDGGGGGGGGGGRAAGGGGGAETELPQGRDWEAEVLVGVHAVPSMRHLHIHVLSRDMHSPALKHRKHYNSFNTPFLVDVADLPLAEGDPRRDPKEAAFLRRDLVCWRCGRNYKNHFKELKEHLEEEFEAWKKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.15
3 0.15
4 0.17
5 0.22
6 0.22
7 0.27
8 0.27
9 0.27
10 0.28
11 0.29
12 0.28
13 0.27
14 0.29
15 0.26
16 0.31
17 0.32
18 0.31
19 0.32
20 0.32
21 0.3
22 0.27
23 0.24
24 0.19
25 0.16
26 0.16
27 0.16
28 0.16
29 0.16
30 0.16
31 0.15
32 0.15
33 0.15
34 0.12
35 0.12
36 0.1
37 0.13
38 0.19
39 0.22
40 0.24
41 0.3
42 0.38
43 0.48
44 0.57
45 0.65
46 0.66
47 0.75
48 0.82
49 0.86
50 0.89
51 0.86
52 0.86
53 0.84
54 0.86
55 0.84
56 0.85
57 0.84
58 0.8
59 0.77
60 0.67
61 0.61
62 0.51
63 0.45
64 0.38
65 0.28
66 0.22
67 0.19
68 0.17
69 0.15
70 0.15
71 0.11
72 0.08
73 0.09
74 0.11
75 0.09
76 0.09
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.13
81 0.15
82 0.17
83 0.18
84 0.17
85 0.14
86 0.14
87 0.14
88 0.13
89 0.11
90 0.15
91 0.15
92 0.16
93 0.18
94 0.18
95 0.19
96 0.21
97 0.23
98 0.18
99 0.23
100 0.23
101 0.23
102 0.26
103 0.27
104 0.27
105 0.25
106 0.22
107 0.16
108 0.15
109 0.13
110 0.12
111 0.12
112 0.16
113 0.17
114 0.19
115 0.18
116 0.18
117 0.18
118 0.16
119 0.14
120 0.09
121 0.08
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.15
135 0.15
136 0.14
137 0.14
138 0.14
139 0.13
140 0.15
141 0.2
142 0.22
143 0.27
144 0.31
145 0.33
146 0.33
147 0.33
148 0.32
149 0.31
150 0.32
151 0.33
152 0.34
153 0.4
154 0.43
155 0.45
156 0.43
157 0.41
158 0.35
159 0.3
160 0.25
161 0.17
162 0.14
163 0.13
164 0.11
165 0.11
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.05
170 0.04
171 0.03
172 0.03
173 0.02
174 0.02
175 0.02
176 0.02
177 0.02
178 0.02
179 0.02
180 0.02
181 0.02
182 0.02
183 0.02
184 0.01
185 0.01
186 0.01
187 0.01
188 0.01
189 0.01
190 0.02
191 0.02
192 0.02
193 0.02
194 0.02
195 0.02
196 0.02
197 0.02
198 0.02
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.02
206 0.04
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.03
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.06
227 0.1
228 0.11
229 0.12
230 0.13
231 0.18
232 0.22
233 0.29
234 0.27
235 0.26
236 0.27
237 0.29
238 0.3
239 0.26
240 0.24
241 0.19
242 0.2
243 0.27
244 0.36
245 0.36
246 0.4
247 0.48
248 0.56
249 0.62
250 0.7
251 0.7
252 0.7
253 0.72
254 0.7
255 0.62
256 0.52
257 0.46
258 0.37
259 0.28
260 0.17
261 0.13
262 0.12
263 0.1
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.08
269 0.1
270 0.11
271 0.19
272 0.24
273 0.27
274 0.29
275 0.3
276 0.33
277 0.42
278 0.45
279 0.45
280 0.45
281 0.43
282 0.45
283 0.45
284 0.43
285 0.38
286 0.36
287 0.34
288 0.35
289 0.39
290 0.44
291 0.52
292 0.56
293 0.61
294 0.68
295 0.72
296 0.76
297 0.8
298 0.76
299 0.72
300 0.76
301 0.74
302 0.73
303 0.68
304 0.61
305 0.52
306 0.51
307 0.48
308 0.4
309 0.39