Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HQ01

Protein Details
Accession A0A179HQ01    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-66AKKVVKEKEEPSKKKKKVVEPESSSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-58QNPKSKSKDVAKAAAKKVVKEKEEPSKKKKK
221-223KKR
431-482PPREGGGFGGGRGGGRGGGRGGFGGRGGGRGGGGGFGGRGGGGRGGRGGFNR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR006509  RBM39_SF  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG plj:VFPFJ_03672  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAKSKTKESKKPAEALAVKDAGVTKASQNPKSKSKDVAKAAAKKVVKEKEEPSKKKKKVVEPESSSESESESEEDSDSDSDSSESEEEKPVKKAAVNGKAKAKAEPESSDSDSDSESESEDEKPAKKAAVNGKAKKAESSDSDSDSESDSEEESKNGAKVEAESDSDSSDSDEESEDEKPAAKKAESDDSEDDSEDSDDSEEDSDEAVPDAEATEPARAAKKRKAETEIDEAPKKAKTDAATTLFAGSLSWGVDDNTLYEAFKEFEGLVNARVVTDKMSGRSRGFGYVDFNDSDACTKAYEAMQGKEIDGRAINLDYANAKPADANPQARAADRAKRHGDSVSPESDTLFVGNLPFDVDQDSVSEFFNAVRAVTSVRLPTDPDSGNLKGFGYVSFGSIEDAKAVFQELNGAPIGNGRMSRSVRLDFASARPPREGGGFGGGRGGGRGGGRGGFGGRGGGRGGGGGFGGRGGGGRGGRGGFNRGGGGGGYSGTKVTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.64
3 0.61
4 0.51
5 0.43
6 0.38
7 0.36
8 0.26
9 0.23
10 0.19
11 0.16
12 0.23
13 0.31
14 0.37
15 0.45
16 0.51
17 0.59
18 0.66
19 0.66
20 0.68
21 0.69
22 0.71
23 0.69
24 0.72
25 0.72
26 0.73
27 0.73
28 0.71
29 0.64
30 0.59
31 0.62
32 0.61
33 0.56
34 0.53
35 0.56
36 0.59
37 0.68
38 0.73
39 0.74
40 0.76
41 0.79
42 0.82
43 0.83
44 0.82
45 0.82
46 0.83
47 0.84
48 0.8
49 0.8
50 0.77
51 0.7
52 0.6
53 0.49
54 0.4
55 0.3
56 0.24
57 0.19
58 0.14
59 0.13
60 0.13
61 0.12
62 0.13
63 0.12
64 0.12
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.1
70 0.09
71 0.1
72 0.11
73 0.18
74 0.21
75 0.24
76 0.26
77 0.26
78 0.28
79 0.28
80 0.33
81 0.37
82 0.43
83 0.47
84 0.5
85 0.56
86 0.6
87 0.59
88 0.55
89 0.49
90 0.43
91 0.41
92 0.39
93 0.35
94 0.34
95 0.36
96 0.33
97 0.31
98 0.26
99 0.23
100 0.2
101 0.18
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.14
108 0.17
109 0.17
110 0.19
111 0.2
112 0.2
113 0.21
114 0.26
115 0.33
116 0.4
117 0.48
118 0.52
119 0.58
120 0.62
121 0.61
122 0.56
123 0.49
124 0.43
125 0.37
126 0.39
127 0.34
128 0.32
129 0.32
130 0.31
131 0.29
132 0.26
133 0.22
134 0.15
135 0.12
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.11
144 0.11
145 0.09
146 0.1
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.13
153 0.12
154 0.11
155 0.1
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.12
166 0.12
167 0.14
168 0.15
169 0.14
170 0.16
171 0.18
172 0.27
173 0.26
174 0.3
175 0.3
176 0.3
177 0.31
178 0.29
179 0.26
180 0.17
181 0.16
182 0.11
183 0.09
184 0.06
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.11
205 0.14
206 0.18
207 0.23
208 0.31
209 0.35
210 0.4
211 0.44
212 0.43
213 0.45
214 0.48
215 0.49
216 0.45
217 0.42
218 0.37
219 0.34
220 0.31
221 0.27
222 0.2
223 0.17
224 0.14
225 0.16
226 0.22
227 0.24
228 0.23
229 0.23
230 0.23
231 0.2
232 0.18
233 0.14
234 0.09
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.07
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.1
263 0.1
264 0.13
265 0.16
266 0.19
267 0.19
268 0.22
269 0.21
270 0.21
271 0.21
272 0.19
273 0.19
274 0.18
275 0.2
276 0.17
277 0.17
278 0.14
279 0.13
280 0.13
281 0.1
282 0.09
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.14
288 0.15
289 0.15
290 0.18
291 0.18
292 0.18
293 0.19
294 0.19
295 0.14
296 0.12
297 0.12
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.1
310 0.17
311 0.2
312 0.22
313 0.21
314 0.26
315 0.26
316 0.26
317 0.3
318 0.26
319 0.29
320 0.3
321 0.36
322 0.37
323 0.37
324 0.38
325 0.35
326 0.35
327 0.33
328 0.34
329 0.3
330 0.26
331 0.25
332 0.24
333 0.23
334 0.2
335 0.14
336 0.1
337 0.07
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.1
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.07
358 0.07
359 0.09
360 0.1
361 0.12
362 0.11
363 0.13
364 0.13
365 0.15
366 0.17
367 0.21
368 0.21
369 0.21
370 0.25
371 0.25
372 0.25
373 0.24
374 0.21
375 0.17
376 0.17
377 0.14
378 0.13
379 0.12
380 0.12
381 0.12
382 0.12
383 0.12
384 0.12
385 0.12
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.09
391 0.08
392 0.07
393 0.13
394 0.12
395 0.14
396 0.14
397 0.14
398 0.12
399 0.14
400 0.16
401 0.11
402 0.12
403 0.12
404 0.19
405 0.21
406 0.25
407 0.28
408 0.29
409 0.29
410 0.3
411 0.31
412 0.27
413 0.28
414 0.34
415 0.33
416 0.34
417 0.33
418 0.32
419 0.3
420 0.3
421 0.28
422 0.2
423 0.24
424 0.22
425 0.21
426 0.22
427 0.21
428 0.18
429 0.17
430 0.15
431 0.09
432 0.09
433 0.1
434 0.1
435 0.1
436 0.11
437 0.11
438 0.12
439 0.11
440 0.1
441 0.13
442 0.12
443 0.12
444 0.12
445 0.12
446 0.11
447 0.11
448 0.11
449 0.08
450 0.08
451 0.07
452 0.06
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.06
458 0.09
459 0.1
460 0.1
461 0.13
462 0.14
463 0.17
464 0.19
465 0.23
466 0.21
467 0.22
468 0.22
469 0.2
470 0.19
471 0.17
472 0.16
473 0.11
474 0.1
475 0.09
476 0.09
477 0.1