Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HH49

Protein Details
Accession A0A179HH49    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
300-322AAPSSPKALRNPRKRPRRDDLDDHydrophilic
396-425LASWKTNRRGNYHRKRRRWARTRQIVDTARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
306-316KALRNPRKRPR
404-415RGNYHRKRRRWA
Subcellular Location(s) mito 12, cyto 8, nucl 5, cyto_pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
KEGG plj:VFPFJ_07264  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MQSNTVQPNGWVALRLPSDNVRVLQVTPNTTISLGKYGAFPSNLIIERPFHLTYEVQDKREGENFSRLRVVPGIELNADVLAETRAEEAAANGEDVIVPADGEELALVDESGTVIARSNREIIDDSARQTLTPAEIEELKRNGTAAGKELIAKLMLSHTALDQKTSYSLSKYKLLKERKFLRRFTVLPLDVPMLAYWMLEDKDASKIMELRQETMALVGCWADVHFGGSPVEGMKEPHGGRWLAIDDTGGLLVASMAERMGILYPQAEDDQGEHDDAQAAESTQGPAAQEDGNGDGEPAAAPSSPKALRNPRKRPRRDDLDDHYALTNNITLIHSNSQPNLSLLRYFDYDASDPNPPYPYHPLFTHLLPVSWLQLVKPEEDGAYSDKPADATPEELASWKTNRRGNYHRKRRRWARTRQIVDTARAGGFSGLAVASTMDPISILRHVLPLLAGGSPIAIFSPSIEPLTQLADCFSIARRAAWIQSPPAGTEGKSVTELDTWEGSVEYPINPTLVLGASVQTSRARRWQVLPGRTHPMMTARGGAEGYVFTGWRALPAEGRISARGKFQKKRTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.24
4 0.26
5 0.29
6 0.31
7 0.31
8 0.27
9 0.26
10 0.27
11 0.31
12 0.31
13 0.3
14 0.3
15 0.3
16 0.28
17 0.27
18 0.27
19 0.22
20 0.22
21 0.19
22 0.17
23 0.18
24 0.19
25 0.23
26 0.22
27 0.2
28 0.18
29 0.23
30 0.24
31 0.23
32 0.23
33 0.21
34 0.22
35 0.27
36 0.26
37 0.2
38 0.22
39 0.21
40 0.23
41 0.32
42 0.35
43 0.31
44 0.34
45 0.35
46 0.37
47 0.42
48 0.42
49 0.35
50 0.41
51 0.4
52 0.39
53 0.43
54 0.4
55 0.37
56 0.35
57 0.32
58 0.25
59 0.27
60 0.26
61 0.2
62 0.2
63 0.17
64 0.15
65 0.13
66 0.1
67 0.08
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.07
74 0.07
75 0.06
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.05
85 0.05
86 0.04
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.04
91 0.03
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.03
96 0.03
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.06
102 0.09
103 0.11
104 0.12
105 0.15
106 0.15
107 0.17
108 0.19
109 0.2
110 0.24
111 0.25
112 0.25
113 0.27
114 0.26
115 0.24
116 0.23
117 0.21
118 0.16
119 0.15
120 0.13
121 0.11
122 0.16
123 0.18
124 0.22
125 0.22
126 0.22
127 0.21
128 0.2
129 0.2
130 0.18
131 0.18
132 0.15
133 0.15
134 0.15
135 0.16
136 0.16
137 0.16
138 0.13
139 0.12
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.15
147 0.15
148 0.16
149 0.15
150 0.15
151 0.16
152 0.18
153 0.18
154 0.15
155 0.19
156 0.21
157 0.29
158 0.32
159 0.37
160 0.44
161 0.53
162 0.55
163 0.61
164 0.69
165 0.72
166 0.76
167 0.72
168 0.69
169 0.66
170 0.62
171 0.58
172 0.57
173 0.47
174 0.4
175 0.38
176 0.33
177 0.26
178 0.24
179 0.18
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.12
194 0.13
195 0.19
196 0.18
197 0.18
198 0.18
199 0.19
200 0.17
201 0.16
202 0.15
203 0.09
204 0.09
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.13
223 0.13
224 0.14
225 0.17
226 0.16
227 0.16
228 0.17
229 0.17
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.05
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.04
287 0.03
288 0.04
289 0.04
290 0.09
291 0.1
292 0.12
293 0.18
294 0.28
295 0.38
296 0.49
297 0.6
298 0.65
299 0.75
300 0.81
301 0.84
302 0.83
303 0.83
304 0.79
305 0.76
306 0.74
307 0.72
308 0.64
309 0.57
310 0.48
311 0.38
312 0.31
313 0.23
314 0.16
315 0.07
316 0.08
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.1
321 0.13
322 0.13
323 0.14
324 0.14
325 0.14
326 0.14
327 0.14
328 0.13
329 0.11
330 0.11
331 0.12
332 0.12
333 0.13
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.13
338 0.15
339 0.16
340 0.15
341 0.16
342 0.17
343 0.15
344 0.18
345 0.24
346 0.25
347 0.24
348 0.24
349 0.27
350 0.27
351 0.27
352 0.29
353 0.22
354 0.19
355 0.18
356 0.18
357 0.15
358 0.14
359 0.14
360 0.08
361 0.14
362 0.15
363 0.14
364 0.15
365 0.14
366 0.13
367 0.13
368 0.15
369 0.13
370 0.13
371 0.13
372 0.12
373 0.12
374 0.12
375 0.12
376 0.14
377 0.11
378 0.11
379 0.11
380 0.12
381 0.12
382 0.12
383 0.14
384 0.14
385 0.16
386 0.19
387 0.25
388 0.28
389 0.32
390 0.38
391 0.47
392 0.55
393 0.64
394 0.7
395 0.75
396 0.81
397 0.88
398 0.91
399 0.92
400 0.91
401 0.91
402 0.91
403 0.91
404 0.88
405 0.82
406 0.81
407 0.73
408 0.65
409 0.57
410 0.48
411 0.37
412 0.3
413 0.26
414 0.16
415 0.12
416 0.09
417 0.07
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.04
426 0.04
427 0.05
428 0.07
429 0.07
430 0.08
431 0.08
432 0.09
433 0.1
434 0.1
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.08
439 0.07
440 0.06
441 0.06
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.04
446 0.04
447 0.06
448 0.09
449 0.1
450 0.11
451 0.11
452 0.12
453 0.12
454 0.16
455 0.14
456 0.12
457 0.12
458 0.11
459 0.11
460 0.11
461 0.12
462 0.14
463 0.15
464 0.15
465 0.17
466 0.18
467 0.2
468 0.24
469 0.26
470 0.23
471 0.28
472 0.28
473 0.26
474 0.27
475 0.25
476 0.21
477 0.22
478 0.2
479 0.18
480 0.18
481 0.18
482 0.17
483 0.17
484 0.18
485 0.16
486 0.15
487 0.14
488 0.13
489 0.12
490 0.11
491 0.11
492 0.12
493 0.1
494 0.11
495 0.11
496 0.11
497 0.11
498 0.1
499 0.1
500 0.09
501 0.09
502 0.08
503 0.08
504 0.09
505 0.1
506 0.12
507 0.16
508 0.18
509 0.21
510 0.28
511 0.33
512 0.36
513 0.41
514 0.49
515 0.54
516 0.6
517 0.63
518 0.61
519 0.64
520 0.6
521 0.56
522 0.48
523 0.43
524 0.39
525 0.33
526 0.32
527 0.24
528 0.25
529 0.24
530 0.22
531 0.18
532 0.14
533 0.14
534 0.1
535 0.09
536 0.08
537 0.1
538 0.1
539 0.12
540 0.14
541 0.14
542 0.16
543 0.19
544 0.23
545 0.24
546 0.27
547 0.29
548 0.3
549 0.3
550 0.36
551 0.43
552 0.49
553 0.55