Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179H2N4

Protein Details
Accession A0A179H2N4    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-84NNSSRRAPAPRRRRDSPGRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-33RNRRGGGDRRRD
69-81RRAPAPRRRRDSP
196-199PRRR
205-260AARKGIDRYIPGGGNRSRSPMPPRRGGRRPGGRRDGGAPKEQEGGRGGRGNPRPKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG plj:VFPFJ_05362  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12418  RRM_Aly_REF_like  
Amino Acid Sequences MADKMDRGLDEIIADTRSSGPRNRRGGGDRRRDRNDYPRDGVRKSTRNEPRAIDSEWVHDRYEENNSSRRAPAPRRRRDSPGRSEPTGSKLKVENIHYDLTEDDLDELFARIGPVVRLQLLYDRAGRSDGTAYVTYEHRDDALDAIRQYDGANANGQPIRLTLMPSRNPFDTAVMPGRPLAERISAPGGRSRSLSPRRRYDEGDAARKGIDRYIPGGGNRSRSPMPPRRGGRRPGGRRDGGAPKEQEGGRGGRGNPRPKKTQEELDAEMADYFGGGSGGAAAAGSEAPNGSAPAPAAHEDLDMIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.15
4 0.18
5 0.21
6 0.27
7 0.35
8 0.43
9 0.51
10 0.52
11 0.56
12 0.6
13 0.67
14 0.7
15 0.72
16 0.72
17 0.75
18 0.79
19 0.78
20 0.77
21 0.77
22 0.77
23 0.74
24 0.7
25 0.7
26 0.68
27 0.64
28 0.66
29 0.65
30 0.63
31 0.58
32 0.63
33 0.64
34 0.63
35 0.66
36 0.61
37 0.58
38 0.55
39 0.53
40 0.47
41 0.38
42 0.39
43 0.39
44 0.37
45 0.3
46 0.26
47 0.25
48 0.24
49 0.3
50 0.29
51 0.28
52 0.32
53 0.34
54 0.36
55 0.37
56 0.4
57 0.41
58 0.46
59 0.53
60 0.58
61 0.66
62 0.71
63 0.74
64 0.78
65 0.81
66 0.8
67 0.8
68 0.8
69 0.75
70 0.69
71 0.68
72 0.61
73 0.56
74 0.54
75 0.43
76 0.36
77 0.32
78 0.35
79 0.37
80 0.38
81 0.37
82 0.32
83 0.33
84 0.3
85 0.28
86 0.23
87 0.19
88 0.16
89 0.11
90 0.09
91 0.07
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.11
107 0.12
108 0.14
109 0.15
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.13
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.12
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.11
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.1
138 0.09
139 0.1
140 0.09
141 0.12
142 0.12
143 0.12
144 0.1
145 0.09
146 0.1
147 0.09
148 0.11
149 0.12
150 0.18
151 0.22
152 0.24
153 0.27
154 0.25
155 0.27
156 0.25
157 0.23
158 0.18
159 0.17
160 0.18
161 0.16
162 0.16
163 0.14
164 0.15
165 0.13
166 0.13
167 0.11
168 0.1
169 0.1
170 0.12
171 0.17
172 0.16
173 0.17
174 0.2
175 0.21
176 0.19
177 0.21
178 0.21
179 0.26
180 0.36
181 0.44
182 0.47
183 0.55
184 0.61
185 0.63
186 0.65
187 0.61
188 0.61
189 0.59
190 0.59
191 0.51
192 0.45
193 0.42
194 0.39
195 0.33
196 0.25
197 0.2
198 0.14
199 0.15
200 0.18
201 0.2
202 0.19
203 0.25
204 0.25
205 0.28
206 0.27
207 0.3
208 0.28
209 0.3
210 0.39
211 0.42
212 0.47
213 0.51
214 0.58
215 0.63
216 0.69
217 0.71
218 0.72
219 0.73
220 0.76
221 0.77
222 0.78
223 0.71
224 0.65
225 0.65
226 0.64
227 0.57
228 0.54
229 0.46
230 0.39
231 0.43
232 0.41
233 0.37
234 0.3
235 0.29
236 0.26
237 0.29
238 0.28
239 0.31
240 0.4
241 0.48
242 0.54
243 0.58
244 0.62
245 0.62
246 0.7
247 0.68
248 0.69
249 0.67
250 0.65
251 0.62
252 0.58
253 0.53
254 0.44
255 0.38
256 0.28
257 0.2
258 0.12
259 0.08
260 0.04
261 0.04
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.1
281 0.13
282 0.14
283 0.15
284 0.15
285 0.15