Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179GQ05

Protein Details
Accession A0A179GQ05    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
453-473EWEEARLRKRQHRKDGGQDGTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
461-462KR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9.333, mito 8.5, cyto_mito 6.833, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG plj:VFPFJ_07045  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAQPQHQAPPPRAFSPPQHSPSPAAGTPSAYALPPNKRVRTDGPPSQPGSPYAASPFAASPGAAGTPPMTAASPTFSATPPLSATYATPYTNGAAAPGMNLPDGRSNSATPVQTPHGAPPQMVQPQYTNAMMAPIQQAVASPAPSANVMGPPQRPADRPTKDYEYDVTDSLAGTGIDLRAEEQYMSDLYSNALDSNTADARTGFAYNQAGSKSTFYGAGPANQPAEPTSTSNQDEVAAKAAERAWAESSMRLAVQRTQEINDPFLLVALLHQRADKIAREHGIGLNLEMKNPQPMGKMRLPEQFPQPQVTVRMAPGPDSTMVQTTGSYIPQESFLVDQLALMSIAAKHRLRGLVEEAGVIAIHRQKTSHGDVPAEWEPAAAPMNVEVLEPMDKPGEPMETDSAEDSGTNPLKRSADAAGLGDGATPPPVKKLPKIGGSNVTVPMRERARQDREWEEARLRKRQHRKDGGQDGTATPTRAGSAAPATPGSVAPEPEKAMTKKEMKKSQALKAAEANSHANQNLTSSMFAGLGGKGGLFGKKKTGKTYDWMNVGRTGSGASTPTRAAPGPKGASGAPGTPAGANHPLTTEGRNRLGTWREDKEKGKNIQLRDWVVVLERDGRETKALSAAHSQLDMSLPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.56
3 0.6
4 0.56
5 0.55
6 0.55
7 0.54
8 0.55
9 0.53
10 0.45
11 0.39
12 0.35
13 0.33
14 0.31
15 0.29
16 0.24
17 0.18
18 0.21
19 0.23
20 0.3
21 0.37
22 0.46
23 0.49
24 0.51
25 0.57
26 0.6
27 0.62
28 0.64
29 0.64
30 0.63
31 0.65
32 0.65
33 0.63
34 0.58
35 0.51
36 0.48
37 0.39
38 0.32
39 0.28
40 0.27
41 0.23
42 0.23
43 0.21
44 0.17
45 0.17
46 0.15
47 0.12
48 0.11
49 0.11
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.12
60 0.12
61 0.13
62 0.15
63 0.14
64 0.18
65 0.18
66 0.19
67 0.16
68 0.17
69 0.17
70 0.16
71 0.16
72 0.18
73 0.2
74 0.19
75 0.18
76 0.17
77 0.18
78 0.18
79 0.17
80 0.12
81 0.1
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.09
87 0.1
88 0.1
89 0.16
90 0.17
91 0.2
92 0.21
93 0.21
94 0.24
95 0.29
96 0.29
97 0.24
98 0.27
99 0.27
100 0.28
101 0.28
102 0.29
103 0.31
104 0.31
105 0.3
106 0.27
107 0.31
108 0.33
109 0.33
110 0.3
111 0.24
112 0.26
113 0.29
114 0.27
115 0.2
116 0.15
117 0.16
118 0.14
119 0.15
120 0.13
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.12
127 0.11
128 0.1
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.11
133 0.09
134 0.1
135 0.11
136 0.16
137 0.17
138 0.18
139 0.22
140 0.25
141 0.26
142 0.28
143 0.36
144 0.37
145 0.4
146 0.44
147 0.47
148 0.46
149 0.46
150 0.44
151 0.39
152 0.35
153 0.32
154 0.26
155 0.2
156 0.18
157 0.16
158 0.14
159 0.08
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.09
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.11
189 0.12
190 0.09
191 0.1
192 0.12
193 0.12
194 0.14
195 0.13
196 0.13
197 0.13
198 0.14
199 0.13
200 0.12
201 0.12
202 0.1
203 0.15
204 0.14
205 0.16
206 0.17
207 0.17
208 0.18
209 0.17
210 0.17
211 0.14
212 0.16
213 0.14
214 0.15
215 0.16
216 0.19
217 0.2
218 0.2
219 0.2
220 0.18
221 0.18
222 0.15
223 0.16
224 0.12
225 0.1
226 0.11
227 0.11
228 0.12
229 0.11
230 0.12
231 0.11
232 0.13
233 0.13
234 0.13
235 0.13
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.1
240 0.12
241 0.15
242 0.18
243 0.18
244 0.18
245 0.23
246 0.23
247 0.24
248 0.2
249 0.18
250 0.14
251 0.13
252 0.11
253 0.06
254 0.06
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.12
262 0.14
263 0.13
264 0.16
265 0.16
266 0.17
267 0.18
268 0.19
269 0.19
270 0.16
271 0.14
272 0.17
273 0.15
274 0.15
275 0.14
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.14
280 0.11
281 0.14
282 0.2
283 0.22
284 0.24
285 0.26
286 0.31
287 0.33
288 0.32
289 0.36
290 0.35
291 0.33
292 0.34
293 0.31
294 0.26
295 0.25
296 0.24
297 0.19
298 0.15
299 0.16
300 0.14
301 0.14
302 0.13
303 0.12
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.08
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.06
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.12
336 0.14
337 0.14
338 0.15
339 0.18
340 0.16
341 0.16
342 0.15
343 0.13
344 0.12
345 0.11
346 0.09
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.09
352 0.1
353 0.15
354 0.21
355 0.24
356 0.23
357 0.23
358 0.23
359 0.29
360 0.29
361 0.25
362 0.2
363 0.14
364 0.13
365 0.13
366 0.14
367 0.08
368 0.06
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.05
374 0.05
375 0.06
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.09
382 0.09
383 0.08
384 0.1
385 0.11
386 0.11
387 0.12
388 0.12
389 0.11
390 0.1
391 0.09
392 0.08
393 0.12
394 0.14
395 0.15
396 0.15
397 0.18
398 0.18
399 0.19
400 0.2
401 0.16
402 0.15
403 0.15
404 0.15
405 0.12
406 0.12
407 0.12
408 0.1
409 0.08
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.09
415 0.13
416 0.16
417 0.19
418 0.27
419 0.32
420 0.4
421 0.44
422 0.45
423 0.46
424 0.47
425 0.46
426 0.42
427 0.36
428 0.29
429 0.26
430 0.27
431 0.24
432 0.25
433 0.28
434 0.33
435 0.39
436 0.43
437 0.48
438 0.47
439 0.5
440 0.5
441 0.48
442 0.46
443 0.46
444 0.47
445 0.49
446 0.51
447 0.55
448 0.63
449 0.7
450 0.74
451 0.78
452 0.8
453 0.82
454 0.86
455 0.8
456 0.71
457 0.63
458 0.53
459 0.47
460 0.41
461 0.31
462 0.21
463 0.17
464 0.15
465 0.13
466 0.12
467 0.09
468 0.11
469 0.11
470 0.12
471 0.12
472 0.11
473 0.12
474 0.12
475 0.14
476 0.13
477 0.13
478 0.14
479 0.16
480 0.17
481 0.18
482 0.23
483 0.21
484 0.24
485 0.3
486 0.38
487 0.43
488 0.52
489 0.59
490 0.58
491 0.66
492 0.69
493 0.7
494 0.69
495 0.63
496 0.56
497 0.54
498 0.53
499 0.45
500 0.4
501 0.36
502 0.29
503 0.3
504 0.27
505 0.22
506 0.18
507 0.18
508 0.17
509 0.14
510 0.13
511 0.11
512 0.11
513 0.11
514 0.11
515 0.11
516 0.09
517 0.08
518 0.08
519 0.06
520 0.07
521 0.08
522 0.12
523 0.14
524 0.15
525 0.24
526 0.31
527 0.35
528 0.42
529 0.47
530 0.46
531 0.5
532 0.58
533 0.56
534 0.56
535 0.55
536 0.5
537 0.48
538 0.45
539 0.39
540 0.3
541 0.24
542 0.16
543 0.15
544 0.15
545 0.12
546 0.14
547 0.14
548 0.15
549 0.17
550 0.18
551 0.2
552 0.22
553 0.29
554 0.3
555 0.3
556 0.31
557 0.29
558 0.31
559 0.29
560 0.26
561 0.2
562 0.17
563 0.17
564 0.16
565 0.16
566 0.17
567 0.2
568 0.2
569 0.18
570 0.19
571 0.21
572 0.22
573 0.26
574 0.29
575 0.3
576 0.34
577 0.35
578 0.36
579 0.4
580 0.44
581 0.47
582 0.48
583 0.5
584 0.52
585 0.58
586 0.63
587 0.65
588 0.69
589 0.68
590 0.7
591 0.68
592 0.66
593 0.67
594 0.68
595 0.63
596 0.55
597 0.5
598 0.4
599 0.37
600 0.34
601 0.27
602 0.27
603 0.23
604 0.25
605 0.27
606 0.27
607 0.27
608 0.27
609 0.27
610 0.26
611 0.26
612 0.25
613 0.29
614 0.3
615 0.29
616 0.28
617 0.26
618 0.21