Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HQH2

Protein Details
Accession A0A179HQH2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
198-223RGPSGKWTPNRQKARRPSKLTRKAAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
189-224RAPASRPNGRGPSGKWTPNRQKARRPSKLTRKAAGP
Subcellular Location(s) nucl 11, pero 6, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG plj:VFPFJ_01846  -  
Amino Acid Sequences MNTNDFMMPQGNGDEWDNTVDLGLSSSQPWPQYQGAVTQYQDPATQYQGAPTQYQAAGAPYHSPAAQYQSAAILFQATQTRYQGFPTQYQTVAAQSQSPETQYPGAVPQHQGPAWHYQGAAALPTNYDMFLPNGAGYMDCQPANAYALGQTPPHQVAHAPAGLHPGVLATGAGPVLMSAAMQPATPYRRAPASRPNGRGPSGKWTPNRQKARRPSKLTRKAAGPTTKPPSRTQDDDAALDDGAAFDDGAALDDGAAFDDGAAFDDDAALDDGAALDKDGKPIPRLFDPSRSACSRPPVAIYNHEKSVLQLEAPIPEHPSPRVFSHLERESVVVCCGAAVQGKDRAAWSVFCGWGSKHNASGVLGPDSDVPLSEVGAQAYAVCKAVELARCIRQDDATLRHVYIVSSSQYVVASLTKDAHWFEESKDSGRLAANLIRDALRDIKAFGRSGRSKNARWMRMWEVPKEENKEAQSLAADALRGLPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.16
4 0.15
5 0.13
6 0.13
7 0.11
8 0.09
9 0.1
10 0.1
11 0.09
12 0.1
13 0.12
14 0.15
15 0.17
16 0.18
17 0.21
18 0.21
19 0.24
20 0.23
21 0.28
22 0.29
23 0.31
24 0.31
25 0.31
26 0.31
27 0.28
28 0.29
29 0.24
30 0.22
31 0.22
32 0.24
33 0.19
34 0.21
35 0.25
36 0.26
37 0.25
38 0.24
39 0.25
40 0.22
41 0.22
42 0.2
43 0.17
44 0.16
45 0.15
46 0.17
47 0.13
48 0.15
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.19
53 0.2
54 0.18
55 0.17
56 0.18
57 0.18
58 0.17
59 0.16
60 0.11
61 0.09
62 0.12
63 0.16
64 0.15
65 0.17
66 0.19
67 0.21
68 0.21
69 0.24
70 0.28
71 0.26
72 0.31
73 0.34
74 0.35
75 0.33
76 0.34
77 0.32
78 0.28
79 0.26
80 0.21
81 0.18
82 0.15
83 0.18
84 0.17
85 0.18
86 0.16
87 0.17
88 0.17
89 0.15
90 0.16
91 0.18
92 0.2
93 0.21
94 0.22
95 0.23
96 0.27
97 0.27
98 0.27
99 0.25
100 0.29
101 0.28
102 0.27
103 0.24
104 0.19
105 0.21
106 0.19
107 0.18
108 0.12
109 0.1
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.09
119 0.07
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.13
131 0.12
132 0.09
133 0.08
134 0.1
135 0.11
136 0.11
137 0.12
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.14
142 0.13
143 0.14
144 0.17
145 0.17
146 0.14
147 0.13
148 0.16
149 0.16
150 0.15
151 0.13
152 0.09
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.08
171 0.11
172 0.13
173 0.13
174 0.14
175 0.2
176 0.22
177 0.26
178 0.33
179 0.4
180 0.47
181 0.51
182 0.55
183 0.53
184 0.54
185 0.53
186 0.44
187 0.43
188 0.4
189 0.42
190 0.4
191 0.46
192 0.54
193 0.61
194 0.7
195 0.67
196 0.71
197 0.76
198 0.83
199 0.82
200 0.81
201 0.81
202 0.82
203 0.87
204 0.83
205 0.76
206 0.69
207 0.63
208 0.62
209 0.58
210 0.5
211 0.46
212 0.47
213 0.47
214 0.45
215 0.45
216 0.44
217 0.42
218 0.43
219 0.39
220 0.38
221 0.37
222 0.35
223 0.32
224 0.26
225 0.21
226 0.17
227 0.14
228 0.07
229 0.05
230 0.04
231 0.03
232 0.02
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.02
245 0.03
246 0.03
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.04
256 0.03
257 0.03
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.03
262 0.04
263 0.05
264 0.07
265 0.09
266 0.1
267 0.12
268 0.14
269 0.17
270 0.19
271 0.26
272 0.26
273 0.32
274 0.35
275 0.36
276 0.39
277 0.39
278 0.38
279 0.34
280 0.37
281 0.32
282 0.28
283 0.28
284 0.27
285 0.27
286 0.33
287 0.37
288 0.35
289 0.34
290 0.34
291 0.31
292 0.27
293 0.28
294 0.2
295 0.13
296 0.12
297 0.11
298 0.13
299 0.14
300 0.14
301 0.15
302 0.16
303 0.17
304 0.17
305 0.19
306 0.18
307 0.19
308 0.23
309 0.22
310 0.23
311 0.3
312 0.32
313 0.31
314 0.29
315 0.29
316 0.25
317 0.23
318 0.22
319 0.13
320 0.09
321 0.08
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.1
327 0.14
328 0.15
329 0.16
330 0.16
331 0.17
332 0.16
333 0.16
334 0.16
335 0.15
336 0.15
337 0.15
338 0.16
339 0.15
340 0.21
341 0.27
342 0.25
343 0.24
344 0.24
345 0.25
346 0.25
347 0.27
348 0.22
349 0.18
350 0.16
351 0.15
352 0.14
353 0.14
354 0.13
355 0.1
356 0.09
357 0.07
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.07
371 0.11
372 0.14
373 0.17
374 0.21
375 0.27
376 0.29
377 0.31
378 0.31
379 0.28
380 0.29
381 0.31
382 0.31
383 0.29
384 0.3
385 0.29
386 0.29
387 0.28
388 0.24
389 0.21
390 0.18
391 0.15
392 0.14
393 0.14
394 0.14
395 0.14
396 0.14
397 0.13
398 0.12
399 0.11
400 0.11
401 0.13
402 0.12
403 0.15
404 0.15
405 0.17
406 0.18
407 0.18
408 0.19
409 0.26
410 0.27
411 0.28
412 0.29
413 0.27
414 0.27
415 0.27
416 0.26
417 0.21
418 0.22
419 0.22
420 0.21
421 0.22
422 0.2
423 0.19
424 0.21
425 0.22
426 0.21
427 0.2
428 0.21
429 0.24
430 0.27
431 0.29
432 0.28
433 0.34
434 0.38
435 0.43
436 0.51
437 0.54
438 0.54
439 0.63
440 0.7
441 0.67
442 0.64
443 0.65
444 0.62
445 0.64
446 0.65
447 0.61
448 0.58
449 0.58
450 0.63
451 0.63
452 0.59
453 0.56
454 0.53
455 0.51
456 0.44
457 0.39
458 0.32
459 0.26
460 0.24
461 0.18
462 0.16
463 0.12