Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HHD7

Protein Details
Accession A0A179HHD7    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-28AAEQPPPRPCKRCKATPAPYILRNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 11.5, cyto 9, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019407  CTU2  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016779  F:nucleotidyltransferase activity  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0032447  P:protein urmylation  
GO:0034227  P:tRNA thio-modification  
GO:0002098  P:tRNA wobble uridine modification  
KEGG plj:VFPFJ_06250  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10288  CTU2  
Amino Acid Sequences MVDGAAEQPPPRPCKRCKATPAPYILRNDPTCRDCYVDYVEAKAGRRLGAVARETRTSAAPAPRRYIAGLSFGASSAVMTRVLDGSAKYHSSAKKGSAAAAFEALVVHVDTDLRFNPPPPQLPSPPHSSSPPTTSSSSSSSSPRCCSPAAARLLDRYRARFPNVSFACVHLSRALRLRTVDWAALLPPGAQKPEETLEQANDANGKNGNGENSDDSERLRRFLDRLPSATARADVTRLLVRHVLLDMALAGSYSALLLGHSTTALAALTLAEVANGRGYSVPWQVNDGLYPVRTYGDDSNSNGPSGGDGAAEEEGQQQQQQQQQQRNAAEEVQQEGTRGKKEKETTLAHVPVFYPMREVFGAEITQYLDLAPELGELVAAAAAVTSSSLSSSGTGTGSIVSHKDLSIAEVMSRYFASVEGPYEGIVANVVRTTGKLDRTAPSSSSSAPGAGLCGLCGMALDEQGDSRWAGELGDEEEEEEDDGDCIPGRSPRARLCYGCKRSVNG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.7
3 0.75
4 0.78
5 0.82
6 0.84
7 0.84
8 0.86
9 0.82
10 0.79
11 0.75
12 0.7
13 0.67
14 0.61
15 0.58
16 0.55
17 0.52
18 0.49
19 0.44
20 0.43
21 0.35
22 0.36
23 0.37
24 0.36
25 0.33
26 0.33
27 0.35
28 0.35
29 0.36
30 0.35
31 0.3
32 0.24
33 0.24
34 0.23
35 0.23
36 0.27
37 0.3
38 0.32
39 0.33
40 0.35
41 0.35
42 0.35
43 0.32
44 0.28
45 0.29
46 0.32
47 0.37
48 0.4
49 0.44
50 0.44
51 0.44
52 0.43
53 0.4
54 0.32
55 0.29
56 0.25
57 0.21
58 0.2
59 0.18
60 0.17
61 0.14
62 0.12
63 0.08
64 0.09
65 0.08
66 0.07
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.1
71 0.09
72 0.1
73 0.13
74 0.14
75 0.15
76 0.2
77 0.23
78 0.27
79 0.3
80 0.31
81 0.34
82 0.34
83 0.36
84 0.33
85 0.32
86 0.28
87 0.25
88 0.22
89 0.15
90 0.14
91 0.11
92 0.08
93 0.07
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.08
99 0.09
100 0.12
101 0.13
102 0.14
103 0.2
104 0.24
105 0.3
106 0.34
107 0.39
108 0.41
109 0.46
110 0.49
111 0.5
112 0.49
113 0.46
114 0.43
115 0.42
116 0.4
117 0.39
118 0.38
119 0.34
120 0.33
121 0.32
122 0.32
123 0.3
124 0.29
125 0.27
126 0.29
127 0.3
128 0.32
129 0.33
130 0.32
131 0.31
132 0.3
133 0.31
134 0.31
135 0.34
136 0.35
137 0.35
138 0.34
139 0.38
140 0.4
141 0.43
142 0.41
143 0.37
144 0.38
145 0.39
146 0.42
147 0.41
148 0.39
149 0.43
150 0.41
151 0.4
152 0.33
153 0.31
154 0.32
155 0.27
156 0.26
157 0.2
158 0.2
159 0.2
160 0.25
161 0.25
162 0.22
163 0.23
164 0.23
165 0.23
166 0.24
167 0.22
168 0.16
169 0.15
170 0.14
171 0.13
172 0.12
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.11
180 0.13
181 0.14
182 0.14
183 0.14
184 0.14
185 0.16
186 0.16
187 0.13
188 0.14
189 0.13
190 0.12
191 0.12
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.12
196 0.1
197 0.11
198 0.11
199 0.13
200 0.15
201 0.14
202 0.14
203 0.19
204 0.19
205 0.19
206 0.19
207 0.17
208 0.17
209 0.22
210 0.3
211 0.26
212 0.28
213 0.31
214 0.31
215 0.31
216 0.29
217 0.26
218 0.18
219 0.16
220 0.14
221 0.1
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.12
226 0.12
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.09
231 0.07
232 0.06
233 0.05
234 0.04
235 0.03
236 0.03
237 0.02
238 0.02
239 0.02
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.02
255 0.02
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.08
267 0.12
268 0.13
269 0.13
270 0.15
271 0.15
272 0.15
273 0.15
274 0.14
275 0.1
276 0.09
277 0.09
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.1
282 0.11
283 0.15
284 0.17
285 0.19
286 0.23
287 0.23
288 0.23
289 0.2
290 0.18
291 0.13
292 0.12
293 0.1
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.12
306 0.17
307 0.23
308 0.29
309 0.35
310 0.4
311 0.46
312 0.46
313 0.45
314 0.41
315 0.36
316 0.33
317 0.27
318 0.25
319 0.2
320 0.19
321 0.17
322 0.17
323 0.18
324 0.19
325 0.22
326 0.21
327 0.25
328 0.29
329 0.33
330 0.4
331 0.42
332 0.42
333 0.47
334 0.49
335 0.42
336 0.39
337 0.34
338 0.32
339 0.29
340 0.23
341 0.18
342 0.15
343 0.18
344 0.17
345 0.17
346 0.12
347 0.13
348 0.13
349 0.1
350 0.1
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.07
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.03
364 0.04
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.02
369 0.02
370 0.02
371 0.03
372 0.03
373 0.03
374 0.03
375 0.04
376 0.04
377 0.05
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.11
389 0.1
390 0.12
391 0.11
392 0.12
393 0.13
394 0.13
395 0.12
396 0.12
397 0.12
398 0.12
399 0.12
400 0.1
401 0.08
402 0.08
403 0.09
404 0.09
405 0.11
406 0.11
407 0.11
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.09
412 0.09
413 0.07
414 0.06
415 0.06
416 0.07
417 0.06
418 0.07
419 0.12
420 0.16
421 0.19
422 0.22
423 0.25
424 0.29
425 0.33
426 0.35
427 0.32
428 0.31
429 0.3
430 0.27
431 0.27
432 0.23
433 0.2
434 0.18
435 0.16
436 0.13
437 0.13
438 0.12
439 0.09
440 0.09
441 0.08
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.06
446 0.07
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.09
451 0.1
452 0.09
453 0.08
454 0.09
455 0.09
456 0.08
457 0.09
458 0.1
459 0.11
460 0.13
461 0.12
462 0.11
463 0.12
464 0.12
465 0.12
466 0.11
467 0.09
468 0.07
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.1
474 0.13
475 0.19
476 0.24
477 0.3
478 0.38
479 0.45
480 0.51
481 0.55
482 0.6
483 0.66
484 0.69
485 0.71