Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HXH0

Protein Details
Accession A0A179HXH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-61LSPIGQHRRHHTKPSKGKRSGKTRADSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-56RRHHTKPSKGKRSGK
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 8.5, cyto_nucl 6.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013241  RNase_P_Pop3  
Gene Ontology GO:0006364  P:rRNA processing  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG plj:VFPFJ_01196  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08228  RNase_P_pop3  
Amino Acid Sequences MVLSTQPTGRKRLIHHLDTPDVSFDDQDAILEILLSPIGQHRRHHTKPSKGKRSGKTRADSAADASVANETHVQTAPQKPELSAHVDVGFNSITRKLEETSKETPKARGDTSAQATGDAKRPYSMIFVARGNQSSAFNCHFPRMVGAATRASPSEERTRLVGFSKPCSERLSAVLGVARVSSVAVMRDAPGAEALWAFVQKTVSPVDTSWLEESKASAYRPTQIGSTETIVGAKKAKITA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.59
3 0.6
4 0.62
5 0.58
6 0.54
7 0.45
8 0.37
9 0.32
10 0.24
11 0.18
12 0.14
13 0.12
14 0.11
15 0.1
16 0.09
17 0.08
18 0.08
19 0.07
20 0.05
21 0.05
22 0.05
23 0.04
24 0.1
25 0.17
26 0.2
27 0.24
28 0.33
29 0.43
30 0.48
31 0.59
32 0.63
33 0.67
34 0.75
35 0.83
36 0.85
37 0.85
38 0.89
39 0.88
40 0.89
41 0.88
42 0.86
43 0.8
44 0.73
45 0.68
46 0.62
47 0.53
48 0.45
49 0.36
50 0.28
51 0.22
52 0.18
53 0.14
54 0.11
55 0.1
56 0.1
57 0.08
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.14
62 0.19
63 0.22
64 0.24
65 0.24
66 0.22
67 0.24
68 0.26
69 0.27
70 0.23
71 0.21
72 0.19
73 0.18
74 0.18
75 0.18
76 0.15
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.09
81 0.09
82 0.11
83 0.11
84 0.16
85 0.19
86 0.24
87 0.29
88 0.34
89 0.38
90 0.37
91 0.4
92 0.38
93 0.39
94 0.33
95 0.3
96 0.27
97 0.28
98 0.3
99 0.29
100 0.25
101 0.22
102 0.22
103 0.21
104 0.23
105 0.19
106 0.16
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.14
111 0.14
112 0.1
113 0.12
114 0.12
115 0.14
116 0.15
117 0.15
118 0.14
119 0.14
120 0.14
121 0.13
122 0.15
123 0.15
124 0.16
125 0.16
126 0.17
127 0.16
128 0.15
129 0.15
130 0.13
131 0.12
132 0.11
133 0.12
134 0.13
135 0.13
136 0.13
137 0.12
138 0.13
139 0.13
140 0.15
141 0.21
142 0.21
143 0.22
144 0.23
145 0.24
146 0.23
147 0.24
148 0.25
149 0.2
150 0.23
151 0.29
152 0.29
153 0.3
154 0.31
155 0.31
156 0.28
157 0.28
158 0.28
159 0.21
160 0.2
161 0.19
162 0.16
163 0.15
164 0.13
165 0.11
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.11
189 0.13
190 0.13
191 0.14
192 0.14
193 0.17
194 0.17
195 0.2
196 0.21
197 0.2
198 0.19
199 0.18
200 0.19
201 0.19
202 0.21
203 0.19
204 0.21
205 0.21
206 0.26
207 0.28
208 0.28
209 0.26
210 0.25
211 0.26
212 0.25
213 0.26
214 0.21
215 0.19
216 0.21
217 0.2
218 0.2
219 0.21
220 0.19