Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179FJH4

Protein Details
Accession A0A179FJH4    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-108EGEAARKPREGRREKKRRDRDDDVAMDBasic
117-137APQRRSRRAAEGERRRPKRDKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
74-100KASKRKRAEGEAARKPREGRREKKRRD
120-137RRSRRAAEGERRRPKRDK
167-177KKPAATKRKRK
420-423KKKR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG plj:VFPFJ_11227  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDAESPAGSPANEPVDDGQEREFEEEVAAADSDRDSDLLSEVDEDQFEDYDPETANIEDRPVDIDEDAARTLKASKRKRAEGEAARKPREGRREKKRRDRDDDVAMDNEADADGEAPQRRSRRAAEGERRRPKRDKSPDEGPNEEDLSPEQRRALAIERALDAAIKKPAATKRKRKDEIDLEDEIDETLAELKTRMDKACVDDNAARGAGQPALHKLKLLPEVVGLLNRNNVQHAVLDPDTNFLQHVKFFLEPLNDGSLPAYNIQRDIFMALTKLSIEKEALMSSGIGKVVLFYTRSKKPEPSIKRMAERLLGEWSRPILKRTDDYKKRHIETREFDYHAAKVAQRQKSGSQFSLTQRPAQSARDAFLAPARADNQARMGHLPQSYTIAPKSTFDGTRGQDHRPLGASGMEAFRRMTQKKKRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.24
4 0.25
5 0.25
6 0.23
7 0.21
8 0.22
9 0.23
10 0.22
11 0.15
12 0.15
13 0.14
14 0.13
15 0.12
16 0.11
17 0.08
18 0.09
19 0.08
20 0.09
21 0.09
22 0.08
23 0.07
24 0.08
25 0.09
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.1
37 0.09
38 0.1
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.13
44 0.12
45 0.13
46 0.11
47 0.11
48 0.13
49 0.13
50 0.14
51 0.12
52 0.13
53 0.13
54 0.14
55 0.15
56 0.13
57 0.11
58 0.11
59 0.16
60 0.2
61 0.28
62 0.36
63 0.45
64 0.53
65 0.62
66 0.67
67 0.7
68 0.75
69 0.75
70 0.77
71 0.77
72 0.77
73 0.72
74 0.69
75 0.66
76 0.62
77 0.63
78 0.63
79 0.63
80 0.65
81 0.73
82 0.81
83 0.88
84 0.92
85 0.92
86 0.91
87 0.89
88 0.85
89 0.83
90 0.76
91 0.68
92 0.58
93 0.48
94 0.38
95 0.3
96 0.23
97 0.13
98 0.08
99 0.05
100 0.04
101 0.05
102 0.08
103 0.11
104 0.13
105 0.17
106 0.21
107 0.24
108 0.28
109 0.3
110 0.36
111 0.42
112 0.51
113 0.58
114 0.65
115 0.74
116 0.8
117 0.83
118 0.81
119 0.8
120 0.77
121 0.77
122 0.77
123 0.75
124 0.73
125 0.76
126 0.77
127 0.75
128 0.7
129 0.61
130 0.53
131 0.46
132 0.38
133 0.29
134 0.22
135 0.22
136 0.2
137 0.18
138 0.15
139 0.14
140 0.14
141 0.16
142 0.19
143 0.17
144 0.17
145 0.18
146 0.18
147 0.18
148 0.18
149 0.17
150 0.13
151 0.11
152 0.12
153 0.1
154 0.1
155 0.15
156 0.22
157 0.31
158 0.4
159 0.49
160 0.57
161 0.68
162 0.74
163 0.72
164 0.74
165 0.74
166 0.71
167 0.66
168 0.57
169 0.47
170 0.4
171 0.38
172 0.28
173 0.18
174 0.11
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.09
182 0.11
183 0.12
184 0.12
185 0.13
186 0.17
187 0.22
188 0.22
189 0.22
190 0.22
191 0.22
192 0.21
193 0.2
194 0.16
195 0.11
196 0.11
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.12
201 0.15
202 0.15
203 0.15
204 0.14
205 0.18
206 0.2
207 0.2
208 0.16
209 0.13
210 0.15
211 0.15
212 0.16
213 0.12
214 0.09
215 0.11
216 0.12
217 0.11
218 0.1
219 0.11
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.11
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.14
242 0.16
243 0.14
244 0.14
245 0.14
246 0.12
247 0.12
248 0.13
249 0.12
250 0.09
251 0.1
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.08
280 0.09
281 0.11
282 0.17
283 0.24
284 0.28
285 0.31
286 0.35
287 0.4
288 0.49
289 0.55
290 0.57
291 0.61
292 0.63
293 0.66
294 0.64
295 0.6
296 0.54
297 0.47
298 0.4
299 0.37
300 0.32
301 0.27
302 0.25
303 0.25
304 0.26
305 0.25
306 0.26
307 0.22
308 0.25
309 0.31
310 0.38
311 0.47
312 0.51
313 0.57
314 0.65
315 0.7
316 0.7
317 0.71
318 0.71
319 0.69
320 0.66
321 0.67
322 0.65
323 0.58
324 0.56
325 0.5
326 0.43
327 0.38
328 0.33
329 0.26
330 0.26
331 0.33
332 0.37
333 0.38
334 0.41
335 0.43
336 0.5
337 0.54
338 0.49
339 0.43
340 0.43
341 0.45
342 0.52
343 0.48
344 0.45
345 0.4
346 0.43
347 0.42
348 0.39
349 0.41
350 0.33
351 0.33
352 0.3
353 0.29
354 0.25
355 0.26
356 0.27
357 0.2
358 0.22
359 0.22
360 0.24
361 0.25
362 0.26
363 0.27
364 0.26
365 0.28
366 0.28
367 0.28
368 0.28
369 0.28
370 0.28
371 0.24
372 0.26
373 0.25
374 0.25
375 0.25
376 0.24
377 0.23
378 0.23
379 0.26
380 0.27
381 0.28
382 0.26
383 0.32
384 0.32
385 0.41
386 0.43
387 0.43
388 0.43
389 0.43
390 0.44
391 0.39
392 0.37
393 0.28
394 0.26
395 0.23
396 0.2
397 0.24
398 0.21
399 0.2
400 0.2
401 0.24
402 0.31
403 0.35
404 0.42