Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HYW0

Protein Details
Accession A0A179HYW0    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1106-1128YHNRVERPSKDRGQRVRKLQLSDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 10.5, cyto_nucl 8.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG plj:VFPFJ_00649  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MDRARKRELRALNERAWSGEKDVFPVSGSLDSSLKKNTAFIKRLRTAVTAATLPTFLQEIRTLSLHKYLSEIISACYEGLCKLKSPGEIDAGVEIVSALHQRFGPAEFTEYLAWLLGKGMATPDKSFLKTLSPEAREKEEKERITRQRALLRVITELWLVAVLRTLDDATKPDDTTKGAAGKVPELKVRSGAGKATGGAEPFPLEVLKDLLGYDREHANLPLLVVFVKAFSWDILGVKAAGADGRKTVEEDGMASTLSAGRSQDADGNTEANASDQPLTPPDLADRFRSVLKRYFDDVTAHIVRDQKSIQSQARRNAEAYVKSGEVFEDRQASYEKLVKAQDRLVSNAQVVADAIGAEMPDLKDAEDPLATSSGSIGLVKTGDYLRSMADGPGIWADEDERRFYENLVDLKGKVPPILLEDGKKKKSDGDDQVGRKVDPAEGSDSTKAEVNDDQSTAIANKTIGAQVDALLARLPELTNKDAIDQTAVDFCFLNSKASRNRLVKALTEVPKGRSDLLPSWSRLVATLGRYMSDVPKGLVEYLDAEFRSLQRRKDKDFLGQVRLSNIRYLAELTKFGAVPEHVVFHCLKVSLDDFSRMNIEILCNLIENCGRYLLKNPDTAPRMASFLETLQRKKSVQHIGQPERMLIDNAVYYVDPPERPAIEQEERTPMELFVRKLVYTDLTKRNYGKVLKQIRRLHWEEADVVAILEKVFSKPGKVKYGNIHLLGILLSALHRYHPDFVVKVVDNVIESVSFGLEVNDFRFFQRRIAEVKYLGELYNYRMLEHPVIFDTLYKIMTFGYGGPPVPGRFNAFDPPDDFFRIRLVATVLETCGMFFNRGAAGKKLDYFLSFFQYYVFTKASLPMEIEFVVQDIFALTRPQWKMVAGLEEAAKAFQLAIAQDQKTAGADKQAEPDDVSSGDSSDDDNGDVDEVEPYGDGEDESASEEDEVEQDDDDESVHDSDFNDEAIVVTRQEETVDPEDDADFEREYAKMMAESLESRKFERKPLFDVPLPVRPKNREASAAGPQSEEAPPASSSTMAFALLTKKGNRQQTRTVELPSDSTLAIAMKTQQQAEKEEQQRIKNLVLNYDLQQSEDQEPHERPSTFYHNRVERPSKDRGQRVRKLQLSDVDW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.58
3 0.53
4 0.45
5 0.39
6 0.38
7 0.32
8 0.3
9 0.31
10 0.28
11 0.25
12 0.23
13 0.21
14 0.17
15 0.17
16 0.16
17 0.17
18 0.18
19 0.2
20 0.23
21 0.23
22 0.22
23 0.25
24 0.32
25 0.39
26 0.45
27 0.49
28 0.56
29 0.59
30 0.63
31 0.61
32 0.55
33 0.47
34 0.44
35 0.41
36 0.32
37 0.28
38 0.25
39 0.22
40 0.19
41 0.17
42 0.15
43 0.11
44 0.12
45 0.14
46 0.15
47 0.18
48 0.2
49 0.21
50 0.21
51 0.28
52 0.27
53 0.24
54 0.25
55 0.24
56 0.23
57 0.25
58 0.24
59 0.18
60 0.19
61 0.19
62 0.16
63 0.14
64 0.14
65 0.12
66 0.16
67 0.15
68 0.15
69 0.19
70 0.23
71 0.26
72 0.29
73 0.31
74 0.31
75 0.3
76 0.29
77 0.26
78 0.22
79 0.18
80 0.15
81 0.11
82 0.06
83 0.06
84 0.08
85 0.08
86 0.09
87 0.1
88 0.11
89 0.12
90 0.14
91 0.16
92 0.15
93 0.19
94 0.18
95 0.2
96 0.2
97 0.19
98 0.17
99 0.15
100 0.13
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.11
107 0.15
108 0.17
109 0.18
110 0.22
111 0.25
112 0.27
113 0.28
114 0.25
115 0.28
116 0.28
117 0.35
118 0.39
119 0.4
120 0.43
121 0.45
122 0.52
123 0.51
124 0.52
125 0.54
126 0.54
127 0.55
128 0.58
129 0.64
130 0.66
131 0.69
132 0.72
133 0.69
134 0.68
135 0.67
136 0.65
137 0.59
138 0.51
139 0.44
140 0.39
141 0.33
142 0.25
143 0.21
144 0.15
145 0.12
146 0.1
147 0.08
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.12
156 0.13
157 0.16
158 0.17
159 0.18
160 0.19
161 0.2
162 0.21
163 0.24
164 0.23
165 0.21
166 0.23
167 0.23
168 0.27
169 0.3
170 0.3
171 0.31
172 0.3
173 0.3
174 0.3
175 0.31
176 0.28
177 0.24
178 0.24
179 0.22
180 0.2
181 0.2
182 0.2
183 0.19
184 0.17
185 0.15
186 0.14
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.08
191 0.07
192 0.08
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.1
198 0.12
199 0.12
200 0.14
201 0.15
202 0.15
203 0.16
204 0.17
205 0.16
206 0.15
207 0.15
208 0.13
209 0.11
210 0.1
211 0.09
212 0.08
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.12
234 0.13
235 0.12
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.1
250 0.14
251 0.14
252 0.16
253 0.15
254 0.16
255 0.15
256 0.14
257 0.13
258 0.1
259 0.09
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.11
265 0.14
266 0.14
267 0.14
268 0.15
269 0.19
270 0.2
271 0.22
272 0.23
273 0.22
274 0.26
275 0.29
276 0.3
277 0.33
278 0.35
279 0.36
280 0.37
281 0.37
282 0.35
283 0.34
284 0.31
285 0.31
286 0.28
287 0.25
288 0.24
289 0.26
290 0.26
291 0.26
292 0.26
293 0.22
294 0.24
295 0.3
296 0.34
297 0.39
298 0.44
299 0.49
300 0.54
301 0.53
302 0.5
303 0.47
304 0.46
305 0.39
306 0.36
307 0.3
308 0.24
309 0.23
310 0.22
311 0.18
312 0.15
313 0.14
314 0.13
315 0.15
316 0.15
317 0.16
318 0.18
319 0.18
320 0.18
321 0.23
322 0.22
323 0.21
324 0.25
325 0.26
326 0.27
327 0.3
328 0.31
329 0.27
330 0.31
331 0.29
332 0.27
333 0.25
334 0.24
335 0.2
336 0.15
337 0.13
338 0.1
339 0.07
340 0.05
341 0.05
342 0.04
343 0.04
344 0.03
345 0.05
346 0.04
347 0.05
348 0.05
349 0.06
350 0.06
351 0.07
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.08
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.1
375 0.09
376 0.09
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.07
382 0.06
383 0.07
384 0.11
385 0.12
386 0.13
387 0.13
388 0.14
389 0.15
390 0.15
391 0.17
392 0.18
393 0.19
394 0.2
395 0.2
396 0.19
397 0.2
398 0.22
399 0.19
400 0.14
401 0.12
402 0.1
403 0.12
404 0.16
405 0.16
406 0.17
407 0.25
408 0.32
409 0.35
410 0.35
411 0.33
412 0.33
413 0.37
414 0.42
415 0.41
416 0.43
417 0.48
418 0.5
419 0.54
420 0.52
421 0.46
422 0.38
423 0.31
424 0.24
425 0.17
426 0.16
427 0.15
428 0.15
429 0.17
430 0.17
431 0.17
432 0.16
433 0.17
434 0.16
435 0.13
436 0.13
437 0.14
438 0.14
439 0.14
440 0.14
441 0.11
442 0.12
443 0.11
444 0.1
445 0.07
446 0.06
447 0.06
448 0.07
449 0.08
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.09
455 0.08
456 0.08
457 0.07
458 0.07
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.09
464 0.1
465 0.12
466 0.12
467 0.13
468 0.13
469 0.13
470 0.12
471 0.09
472 0.09
473 0.1
474 0.1
475 0.09
476 0.09
477 0.08
478 0.12
479 0.12
480 0.14
481 0.12
482 0.17
483 0.21
484 0.25
485 0.33
486 0.31
487 0.33
488 0.34
489 0.35
490 0.32
491 0.32
492 0.36
493 0.31
494 0.33
495 0.33
496 0.31
497 0.31
498 0.31
499 0.28
500 0.2
501 0.21
502 0.19
503 0.22
504 0.23
505 0.22
506 0.23
507 0.22
508 0.21
509 0.17
510 0.16
511 0.14
512 0.12
513 0.15
514 0.13
515 0.13
516 0.13
517 0.14
518 0.13
519 0.12
520 0.11
521 0.08
522 0.09
523 0.09
524 0.09
525 0.08
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.09
534 0.17
535 0.19
536 0.23
537 0.31
538 0.36
539 0.4
540 0.46
541 0.47
542 0.45
543 0.51
544 0.5
545 0.47
546 0.45
547 0.4
548 0.37
549 0.37
550 0.31
551 0.22
552 0.19
553 0.13
554 0.11
555 0.12
556 0.11
557 0.1
558 0.1
559 0.1
560 0.11
561 0.11
562 0.1
563 0.1
564 0.08
565 0.09
566 0.09
567 0.1
568 0.08
569 0.1
570 0.11
571 0.1
572 0.11
573 0.09
574 0.08
575 0.08
576 0.09
577 0.09
578 0.09
579 0.11
580 0.11
581 0.11
582 0.12
583 0.11
584 0.1
585 0.09
586 0.09
587 0.07
588 0.07
589 0.07
590 0.06
591 0.06
592 0.06
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.09
597 0.09
598 0.09
599 0.15
600 0.21
601 0.23
602 0.25
603 0.26
604 0.3
605 0.33
606 0.33
607 0.29
608 0.22
609 0.21
610 0.18
611 0.18
612 0.12
613 0.1
614 0.15
615 0.17
616 0.18
617 0.19
618 0.21
619 0.21
620 0.22
621 0.29
622 0.33
623 0.34
624 0.39
625 0.47
626 0.5
627 0.53
628 0.52
629 0.44
630 0.36
631 0.33
632 0.26
633 0.16
634 0.11
635 0.07
636 0.07
637 0.07
638 0.06
639 0.05
640 0.07
641 0.08
642 0.07
643 0.09
644 0.11
645 0.11
646 0.11
647 0.13
648 0.17
649 0.19
650 0.21
651 0.21
652 0.25
653 0.25
654 0.26
655 0.25
656 0.19
657 0.2
658 0.22
659 0.21
660 0.18
661 0.19
662 0.17
663 0.17
664 0.18
665 0.16
666 0.16
667 0.23
668 0.27
669 0.29
670 0.32
671 0.33
672 0.34
673 0.37
674 0.37
675 0.35
676 0.37
677 0.45
678 0.48
679 0.57
680 0.62
681 0.61
682 0.66
683 0.65
684 0.59
685 0.5
686 0.46
687 0.37
688 0.3
689 0.25
690 0.17
691 0.13
692 0.1
693 0.08
694 0.06
695 0.05
696 0.05
697 0.05
698 0.07
699 0.08
700 0.11
701 0.16
702 0.22
703 0.31
704 0.33
705 0.37
706 0.41
707 0.5
708 0.51
709 0.47
710 0.41
711 0.32
712 0.3
713 0.25
714 0.19
715 0.1
716 0.05
717 0.04
718 0.04
719 0.05
720 0.05
721 0.06
722 0.08
723 0.1
724 0.12
725 0.14
726 0.13
727 0.14
728 0.19
729 0.18
730 0.18
731 0.16
732 0.15
733 0.13
734 0.12
735 0.12
736 0.06
737 0.06
738 0.05
739 0.05
740 0.05
741 0.04
742 0.05
743 0.05
744 0.06
745 0.07
746 0.09
747 0.1
748 0.11
749 0.16
750 0.17
751 0.19
752 0.22
753 0.24
754 0.26
755 0.29
756 0.32
757 0.28
758 0.28
759 0.26
760 0.24
761 0.21
762 0.18
763 0.15
764 0.15
765 0.19
766 0.18
767 0.17
768 0.17
769 0.19
770 0.21
771 0.21
772 0.19
773 0.13
774 0.14
775 0.13
776 0.13
777 0.13
778 0.11
779 0.11
780 0.1
781 0.09
782 0.08
783 0.08
784 0.08
785 0.07
786 0.09
787 0.1
788 0.1
789 0.11
790 0.13
791 0.13
792 0.15
793 0.15
794 0.16
795 0.16
796 0.19
797 0.23
798 0.23
799 0.24
800 0.24
801 0.26
802 0.25
803 0.27
804 0.25
805 0.19
806 0.19
807 0.19
808 0.17
809 0.15
810 0.13
811 0.11
812 0.12
813 0.12
814 0.1
815 0.1
816 0.1
817 0.09
818 0.1
819 0.09
820 0.09
821 0.08
822 0.09
823 0.11
824 0.14
825 0.16
826 0.17
827 0.2
828 0.2
829 0.22
830 0.22
831 0.2
832 0.18
833 0.19
834 0.18
835 0.21
836 0.2
837 0.18
838 0.17
839 0.19
840 0.19
841 0.2
842 0.19
843 0.14
844 0.14
845 0.19
846 0.19
847 0.17
848 0.18
849 0.15
850 0.16
851 0.15
852 0.15
853 0.1
854 0.09
855 0.08
856 0.07
857 0.06
858 0.05
859 0.05
860 0.05
861 0.07
862 0.07
863 0.15
864 0.16
865 0.18
866 0.19
867 0.19
868 0.2
869 0.21
870 0.24
871 0.17
872 0.18
873 0.16
874 0.16
875 0.16
876 0.13
877 0.11
878 0.07
879 0.07
880 0.06
881 0.06
882 0.06
883 0.11
884 0.16
885 0.16
886 0.17
887 0.17
888 0.17
889 0.17
890 0.18
891 0.14
892 0.15
893 0.17
894 0.18
895 0.24
896 0.26
897 0.26
898 0.24
899 0.24
900 0.2
901 0.18
902 0.17
903 0.12
904 0.1
905 0.1
906 0.1
907 0.09
908 0.09
909 0.09
910 0.08
911 0.08
912 0.08
913 0.08
914 0.08
915 0.07
916 0.06
917 0.06
918 0.06
919 0.05
920 0.05
921 0.05
922 0.05
923 0.05
924 0.05
925 0.05
926 0.05
927 0.08
928 0.08
929 0.08
930 0.07
931 0.08
932 0.08
933 0.08
934 0.1
935 0.08
936 0.08
937 0.08
938 0.08
939 0.08
940 0.08
941 0.08
942 0.08
943 0.08
944 0.08
945 0.09
946 0.09
947 0.11
948 0.11
949 0.11
950 0.09
951 0.08
952 0.09
953 0.11
954 0.11
955 0.09
956 0.1
957 0.1
958 0.1
959 0.11
960 0.12
961 0.15
962 0.18
963 0.19
964 0.18
965 0.18
966 0.18
967 0.18
968 0.2
969 0.16
970 0.12
971 0.11
972 0.12
973 0.11
974 0.13
975 0.13
976 0.12
977 0.1
978 0.1
979 0.11
980 0.12
981 0.15
982 0.18
983 0.23
984 0.24
985 0.27
986 0.34
987 0.35
988 0.42
989 0.49
990 0.48
991 0.49
992 0.56
993 0.6
994 0.55
995 0.61
996 0.57
997 0.57
998 0.58
999 0.56
1000 0.55
1001 0.53
1002 0.56
1003 0.56
1004 0.54
1005 0.51
1006 0.48
1007 0.49
1008 0.51
1009 0.52
1010 0.46
1011 0.4
1012 0.36
1013 0.34
1014 0.31
1015 0.26
1016 0.18
1017 0.14
1018 0.14
1019 0.15
1020 0.16
1021 0.13
1022 0.13
1023 0.14
1024 0.14
1025 0.11
1026 0.11
1027 0.11
1028 0.14
1029 0.17
1030 0.22
1031 0.22
1032 0.3
1033 0.37
1034 0.47
1035 0.53
1036 0.56
1037 0.63
1038 0.67
1039 0.71
1040 0.66
1041 0.63
1042 0.57
1043 0.5
1044 0.46
1045 0.38
1046 0.31
1047 0.24
1048 0.2
1049 0.18
1050 0.14
1051 0.13
1052 0.11
1053 0.12
1054 0.16
1055 0.2
1056 0.23
1057 0.25
1058 0.28
1059 0.33
1060 0.39
1061 0.46
1062 0.46
1063 0.53
1064 0.56
1065 0.57
1066 0.61
1067 0.59
1068 0.57
1069 0.52
1070 0.47
1071 0.43
1072 0.4
1073 0.38
1074 0.34
1075 0.37
1076 0.33
1077 0.3
1078 0.29
1079 0.28
1080 0.29
1081 0.29
1082 0.29
1083 0.28
1084 0.3
1085 0.33
1086 0.39
1087 0.36
1088 0.34
1089 0.38
1090 0.46
1091 0.47
1092 0.52
1093 0.56
1094 0.57
1095 0.63
1096 0.7
1097 0.72
1098 0.69
1099 0.68
1100 0.71
1101 0.71
1102 0.73
1103 0.77
1104 0.78
1105 0.79
1106 0.81
1107 0.85
1108 0.86
1109 0.83
1110 0.79
1111 0.76