Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I3EDC5

Protein Details
Accession I3EDC5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
392-418EDTKRHQIVPRKIKKAMKNRYNHIKAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
401-425PRKIKKAMKNRYNHIKAEAKKELRR
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 8.5, cyto_nucl 7.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MGIHRIATLDRGSRRGIQARVFSDKELTQNEKHKEYMRAVKEVKLDHIFRKPFIDCLGGHTEGVTRIVRSTMQGELYASTSYDGTVKVWNMSKREEMETISLNQNTPVALSFLNDALLYSSGSNIFHRDVKYSDVLTGVQESLGSPDETEFIAGSGVLDIAGAGGTQFYASTVDGIEIFDKNRIKAVASYKGERQAKRLYISKNDMPLVYAIEGNKIVGYDNRTGKSEIEIVAKAEINAMSIDPMSPETIAAGTNNGEIYMYNTYYTGNSSTYITPPSRTLRGHTTAITDIEHSANGTRIVTGSTDRTVRIFTNDVTHRQEALYHNRRMQGVNAICCTSDNAYILSGSVDTNIRIWKLDPNSSTKICTRAEEDSRALGNVVKNKYRDVMQIEDTKRHQIVPRKIKKAMKNRYNHIKAEAKKELRRQNHGIIPEELQKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.47
3 0.49
4 0.48
5 0.52
6 0.54
7 0.59
8 0.55
9 0.49
10 0.46
11 0.43
12 0.42
13 0.41
14 0.41
15 0.4
16 0.48
17 0.52
18 0.51
19 0.53
20 0.53
21 0.53
22 0.55
23 0.58
24 0.54
25 0.57
26 0.56
27 0.57
28 0.57
29 0.52
30 0.51
31 0.48
32 0.47
33 0.44
34 0.51
35 0.49
36 0.45
37 0.49
38 0.43
39 0.38
40 0.37
41 0.35
42 0.26
43 0.29
44 0.33
45 0.29
46 0.27
47 0.25
48 0.24
49 0.21
50 0.24
51 0.19
52 0.13
53 0.13
54 0.14
55 0.14
56 0.15
57 0.16
58 0.16
59 0.16
60 0.16
61 0.16
62 0.16
63 0.17
64 0.15
65 0.13
66 0.11
67 0.09
68 0.09
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.12
73 0.13
74 0.16
75 0.22
76 0.26
77 0.27
78 0.3
79 0.34
80 0.34
81 0.37
82 0.34
83 0.31
84 0.3
85 0.29
86 0.29
87 0.29
88 0.26
89 0.23
90 0.22
91 0.2
92 0.17
93 0.15
94 0.12
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.08
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.06
107 0.07
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.11
112 0.12
113 0.16
114 0.16
115 0.18
116 0.18
117 0.21
118 0.23
119 0.22
120 0.2
121 0.17
122 0.17
123 0.15
124 0.15
125 0.11
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.03
145 0.03
146 0.02
147 0.02
148 0.02
149 0.02
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.02
155 0.03
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.18
173 0.22
174 0.27
175 0.29
176 0.31
177 0.32
178 0.39
179 0.45
180 0.41
181 0.4
182 0.38
183 0.38
184 0.4
185 0.43
186 0.39
187 0.39
188 0.44
189 0.43
190 0.39
191 0.37
192 0.33
193 0.27
194 0.24
195 0.19
196 0.14
197 0.12
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.1
207 0.14
208 0.17
209 0.18
210 0.2
211 0.2
212 0.2
213 0.2
214 0.19
215 0.16
216 0.15
217 0.14
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.11
222 0.1
223 0.09
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.09
255 0.08
256 0.09
257 0.1
258 0.11
259 0.12
260 0.16
261 0.16
262 0.16
263 0.19
264 0.22
265 0.24
266 0.24
267 0.27
268 0.29
269 0.33
270 0.34
271 0.31
272 0.3
273 0.27
274 0.27
275 0.24
276 0.18
277 0.15
278 0.13
279 0.12
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.1
291 0.12
292 0.13
293 0.14
294 0.14
295 0.15
296 0.15
297 0.17
298 0.17
299 0.16
300 0.23
301 0.26
302 0.3
303 0.34
304 0.34
305 0.31
306 0.29
307 0.33
308 0.3
309 0.38
310 0.42
311 0.4
312 0.43
313 0.46
314 0.47
315 0.44
316 0.41
317 0.39
318 0.36
319 0.35
320 0.34
321 0.3
322 0.29
323 0.28
324 0.28
325 0.2
326 0.17
327 0.14
328 0.13
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.1
333 0.09
334 0.07
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.1
339 0.12
340 0.12
341 0.13
342 0.14
343 0.2
344 0.24
345 0.3
346 0.31
347 0.36
348 0.42
349 0.43
350 0.45
351 0.41
352 0.42
353 0.37
354 0.37
355 0.34
356 0.36
357 0.4
358 0.41
359 0.4
360 0.38
361 0.37
362 0.35
363 0.31
364 0.26
365 0.25
366 0.28
367 0.31
368 0.33
369 0.34
370 0.35
371 0.38
372 0.37
373 0.39
374 0.36
375 0.36
376 0.36
377 0.44
378 0.46
379 0.5
380 0.49
381 0.5
382 0.46
383 0.44
384 0.45
385 0.46
386 0.54
387 0.59
388 0.67
389 0.68
390 0.75
391 0.79
392 0.82
393 0.83
394 0.83
395 0.82
396 0.81
397 0.83
398 0.86
399 0.85
400 0.79
401 0.76
402 0.74
403 0.7
404 0.7
405 0.71
406 0.68
407 0.69
408 0.75
409 0.77
410 0.77
411 0.79
412 0.77
413 0.75
414 0.73
415 0.71
416 0.66
417 0.59
418 0.54