FuNGI

A0A179HL03

Protein Details

Accession

A0A179HL03

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-32	PEPAAASKAEKKHKKDKSEKKRAREDDAAA	Basic
51-83	DVAEAQPSKRDKKDKKKKDKKSKHEDEPVKAEA	Basic
89-115	AAEEAKAEKKKHKKKKHREAEEAPAAE	Basic
119-147	AKTEDDAEKKQKKKKKSKKHADEPVTADA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-75	SKAEKKHKKDKSEKKRAREDDAAAADAERKHKKSKSIAAAAADVAEAQPSKRDKKDKKKKDKKSKHE
92-138	EAKAEKKKHKKKKHREAEEAPAAEKLPAKTEDDAEKKQKKKKKSKKH
408-423	MRREKKVGGRAVERRR

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, mito_nucl 13, mito 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
KEGG	plj:VFPFJ_04400 -
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MSPEPAAASKAEKKHKKDKSEKKRAREDDAAAADAERKHKKSKSIAAAAADVAEAQPSKRDKKDKKKKDKKSKHEDEPVKAEAEEQQPAAEEAKAEKKKHKKKKHREAEEAPAAEKLPAKTEDDAEKKQKKKKKSKKHADEPVTADAAPTDPDAMDVDQPQTSSASQSSNVYQPPDIPASPRFPFFSQTVSLYEPLYPQGWAQPVTNSKYQHLQHLQNKYVPALRGVLLDYKNVAIGPEPGRDGAATDDDMPTTVLSQREYAVGFGWITADVELFVPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCFGRFNASVEARRLPPSWRWVSNESIEAHGFEETASVITADDHGVVRQVHSTGFWVDGQGERVKGKVRFRIRNFDAGTSGETSYLSLEGTMLDRESEKKLVKEEARTAQMRREKKVGGRAVERRRAPDFAMTRFEAEGAEKNEQQQEGQEQAEPDEEPKPEPWTVSRAQSEEMD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.76
3	0.81
4	0.84
5	0.87
6	0.88
7	0.91
8	0.92
9	0.92
10	0.93
11	0.89
12	0.87
13	0.83
14	0.76
15	0.74
16	0.67
17	0.58
18	0.47
19	0.41
20	0.36
21	0.31
22	0.34
23	0.33
24	0.33
25	0.4
26	0.45
27	0.53
28	0.59
29	0.66
30	0.69
31	0.69
32	0.7
33	0.64
34	0.61
35	0.53
36	0.43
37	0.33
38	0.22
39	0.14
40	0.11
41	0.08
42	0.07
43	0.13
44	0.18
45	0.25
46	0.34
47	0.45
48	0.54
49	0.65
50	0.76
51	0.82
52	0.88
53	0.92
54	0.95
55	0.96
56	0.97
57	0.96
58	0.96
59	0.96
60	0.95
61	0.94
62	0.91
63	0.87
64	0.82
65	0.73
66	0.63
67	0.52
68	0.43
69	0.38
70	0.33
71	0.28
72	0.21
73	0.19
74	0.18
75	0.19
76	0.19
77	0.13
78	0.11
79	0.12
80	0.22
81	0.29
82	0.31
83	0.4
84	0.5
85	0.6
86	0.71
87	0.78
88	0.8
89	0.85
90	0.93
91	0.95
92	0.95
93	0.94
94	0.9
95	0.89
96	0.86
97	0.76
98	0.65
99	0.55
100	0.45
101	0.36
102	0.31
103	0.21
104	0.17
105	0.17
106	0.19
107	0.2
108	0.23
109	0.3
110	0.33
111	0.39
112	0.45
113	0.52
114	0.57
115	0.64
116	0.68
117	0.71
118	0.76
119	0.81
120	0.83
121	0.85
122	0.89
123	0.92
124	0.95
125	0.95
126	0.91
127	0.87
128	0.8
129	0.72
130	0.62
131	0.5
132	0.39
133	0.29
134	0.21
135	0.15
136	0.1
137	0.07
138	0.05
139	0.06
140	0.07
141	0.08
142	0.08
143	0.09
144	0.1
145	0.1
146	0.1
147	0.1
148	0.1
149	0.1
150	0.1
151	0.1
152	0.1
153	0.11
154	0.12
155	0.14
156	0.16
157	0.17
158	0.17
159	0.16
160	0.16
161	0.18
162	0.19
163	0.17
164	0.16
165	0.18
166	0.22
167	0.23
168	0.23
169	0.23
170	0.21
171	0.24
172	0.22
173	0.22
174	0.18
175	0.19
176	0.19
177	0.18
178	0.18
179	0.16
180	0.16
181	0.13
182	0.13
183	0.11
184	0.1
185	0.08
186	0.1
187	0.11
188	0.12
189	0.12
190	0.15
191	0.18
192	0.22
193	0.26
194	0.24
195	0.24
196	0.29
197	0.3
198	0.33
199	0.35
200	0.4
201	0.42
202	0.48
203	0.49
204	0.44
205	0.44
206	0.37
207	0.35
208	0.26
209	0.21
210	0.16
211	0.14
212	0.12
213	0.12
214	0.15
215	0.13
216	0.13
217	0.12
218	0.11
219	0.1
220	0.1
221	0.09
222	0.05
223	0.08
224	0.1
225	0.1
226	0.1
227	0.1
228	0.11
229	0.1
230	0.1
231	0.08
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.07
239	0.06
240	0.06
241	0.07
242	0.07
243	0.08
244	0.09
245	0.09
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.08
250	0.08
251	0.07
252	0.06
253	0.06
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.06
266	0.05
267	0.06
268	0.05
269	0.06
270	0.07
271	0.07
272	0.09
273	0.09
274	0.09
275	0.08
276	0.08
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.06
281	0.05
282	0.05
283	0.07
284	0.08
285	0.08
286	0.07
287	0.07
288	0.09
289	0.09
290	0.11
291	0.14
292	0.16
293	0.19
294	0.21
295	0.24
296	0.24
297	0.26
298	0.26
299	0.24
300	0.26
301	0.32
302	0.35
303	0.36
304	0.39
305	0.39
306	0.42
307	0.41
308	0.41
309	0.34
310	0.3
311	0.27
312	0.22
313	0.2
314	0.16
315	0.13
316	0.09
317	0.08
318	0.06
319	0.06
320	0.05
321	0.04
322	0.04
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.06
327	0.06
328	0.06
329	0.09
330	0.09
331	0.09
332	0.1
333	0.11
334	0.1
335	0.1
336	0.12
337	0.1
338	0.12
339	0.11
340	0.1
341	0.11
342	0.12
343	0.14
344	0.15
345	0.16
346	0.14
347	0.16
348	0.21
349	0.26
350	0.31
351	0.37
352	0.45
353	0.54
354	0.59
355	0.68
356	0.66
357	0.7
358	0.66
359	0.59
360	0.51
361	0.42
362	0.39
363	0.3
364	0.27
365	0.18
366	0.15
367	0.13
368	0.12
369	0.11
370	0.08
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.07
375	0.08
376	0.07
377	0.08
378	0.09
379	0.12
380	0.15
381	0.21
382	0.23
383	0.24
384	0.28
385	0.35
386	0.39
387	0.44
388	0.48
389	0.49
390	0.53
391	0.54
392	0.53
393	0.53
394	0.56
395	0.55
396	0.53
397	0.52
398	0.5
399	0.53
400	0.61
401	0.6
402	0.58
403	0.62
404	0.67
405	0.71
406	0.75
407	0.71
408	0.67
409	0.64
410	0.59
411	0.52
412	0.52
413	0.47
414	0.43
415	0.46
416	0.42
417	0.39
418	0.37
419	0.35
420	0.26
421	0.23
422	0.25
423	0.24
424	0.27
425	0.26
426	0.3
427	0.34
428	0.34
429	0.32
430	0.29
431	0.29
432	0.28
433	0.28
434	0.27
435	0.23
436	0.24
437	0.25
438	0.22
439	0.19
440	0.2
441	0.2
442	0.2
443	0.21
444	0.25
445	0.24
446	0.27
447	0.28
448	0.3
449	0.33
450	0.39
451	0.42
452	0.39

A0A179HL03

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer