Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179F3V9

Protein Details
Accession A0A179F3V9    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
170-247EDKKERDQDSRHRKHRHRHRSRDRDRNHDHDHERRHRRHRSYSRSRSPRRRRRDDSEDEYKHRHRRARDTDERSPPRRBasic
303-326RDGSRYKHRDARQRDERRNGNHRDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
178-325DSRHRKHRHRHRSRDRDRNHDHDHERRHRRHRSYSRSRSPRRRRRDDSEDEYKHRHRRARDTDERSPPRRDRDRSEDRHGHGHSDSRRRHEDKQRRGSGSEERQRRRSPSLEDRRRSHGRRDDEARDGSRYKHRDARQRDERRNGNHR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG plj:VFPFJ_11533  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MGGGDLNLKKSFHPTLRRNQAAVYDEEQKALAERKRTQQRINEIKEERAKEELQRQLEAAGGKKRVDRVDWMYQGPTDGQAGTSEETEAYLLGKRRIDNLIKGTEHKQLEKAAGQESFMALQNANSARDTASKIRDDPLLAIKRQEQAAYEAMMNDPIKRRQLLSSMGIEDKKERDQDSRHRKHRHRHRSRDRDRNHDHDHERRHRRHRSYSRSRSPRRRRRDDSEDEYKHRHRRARDTDERSPPRRDRDRSEDRHGHGHSDSRRRHEDKQRRGSGSEERQRRRSPSLEDRRRSHGRRDDEARDGSRYKHRDARQRDERRNGNHRDGRYPPRDTNGDSKKDEEAERARRLAAMQSAASELDQDRDARLRQLEERERAAREADDRARDRAGDRGFINGLHKQAGNMALSERMGRARQGYQRDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.6
3 0.7
4 0.75
5 0.69
6 0.64
7 0.62
8 0.55
9 0.52
10 0.45
11 0.42
12 0.37
13 0.36
14 0.34
15 0.27
16 0.26
17 0.29
18 0.29
19 0.3
20 0.35
21 0.45
22 0.55
23 0.63
24 0.67
25 0.69
26 0.75
27 0.78
28 0.79
29 0.79
30 0.71
31 0.73
32 0.73
33 0.68
34 0.59
35 0.53
36 0.49
37 0.45
38 0.5
39 0.5
40 0.45
41 0.42
42 0.4
43 0.36
44 0.36
45 0.32
46 0.28
47 0.27
48 0.27
49 0.28
50 0.31
51 0.36
52 0.36
53 0.36
54 0.38
55 0.39
56 0.45
57 0.47
58 0.46
59 0.42
60 0.39
61 0.38
62 0.31
63 0.25
64 0.16
65 0.12
66 0.1
67 0.1
68 0.12
69 0.11
70 0.11
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.07
77 0.1
78 0.13
79 0.16
80 0.19
81 0.2
82 0.23
83 0.3
84 0.33
85 0.35
86 0.37
87 0.4
88 0.39
89 0.42
90 0.42
91 0.43
92 0.42
93 0.38
94 0.35
95 0.3
96 0.32
97 0.31
98 0.29
99 0.25
100 0.23
101 0.21
102 0.19
103 0.17
104 0.15
105 0.14
106 0.12
107 0.09
108 0.09
109 0.13
110 0.14
111 0.14
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.15
116 0.19
117 0.19
118 0.23
119 0.24
120 0.25
121 0.27
122 0.28
123 0.26
124 0.24
125 0.29
126 0.29
127 0.27
128 0.28
129 0.29
130 0.3
131 0.3
132 0.28
133 0.2
134 0.18
135 0.19
136 0.18
137 0.16
138 0.13
139 0.12
140 0.15
141 0.14
142 0.13
143 0.16
144 0.17
145 0.2
146 0.2
147 0.22
148 0.2
149 0.24
150 0.26
151 0.26
152 0.25
153 0.25
154 0.26
155 0.26
156 0.24
157 0.22
158 0.21
159 0.2
160 0.21
161 0.2
162 0.23
163 0.29
164 0.39
165 0.48
166 0.56
167 0.62
168 0.7
169 0.75
170 0.81
171 0.86
172 0.87
173 0.86
174 0.88
175 0.9
176 0.91
177 0.94
178 0.94
179 0.88
180 0.87
181 0.82
182 0.79
183 0.74
184 0.71
185 0.67
186 0.63
187 0.67
188 0.67
189 0.7
190 0.7
191 0.73
192 0.75
193 0.76
194 0.8
195 0.8
196 0.81
197 0.82
198 0.85
199 0.85
200 0.87
201 0.89
202 0.9
203 0.91
204 0.9
205 0.9
206 0.89
207 0.87
208 0.85
209 0.85
210 0.83
211 0.79
212 0.79
213 0.74
214 0.67
215 0.65
216 0.63
217 0.6
218 0.57
219 0.55
220 0.5
221 0.55
222 0.62
223 0.66
224 0.7
225 0.71
226 0.74
227 0.79
228 0.81
229 0.76
230 0.73
231 0.68
232 0.67
233 0.68
234 0.64
235 0.61
236 0.63
237 0.69
238 0.68
239 0.73
240 0.71
241 0.64
242 0.66
243 0.59
244 0.52
245 0.42
246 0.42
247 0.4
248 0.42
249 0.44
250 0.43
251 0.51
252 0.52
253 0.6
254 0.65
255 0.69
256 0.7
257 0.77
258 0.79
259 0.73
260 0.7
261 0.65
262 0.63
263 0.63
264 0.6
265 0.59
266 0.56
267 0.61
268 0.63
269 0.64
270 0.61
271 0.56
272 0.56
273 0.57
274 0.63
275 0.67
276 0.7
277 0.69
278 0.71
279 0.76
280 0.71
281 0.7
282 0.67
283 0.64
284 0.64
285 0.67
286 0.64
287 0.61
288 0.62
289 0.55
290 0.51
291 0.45
292 0.41
293 0.43
294 0.42
295 0.41
296 0.44
297 0.49
298 0.55
299 0.62
300 0.68
301 0.71
302 0.77
303 0.81
304 0.82
305 0.83
306 0.82
307 0.83
308 0.8
309 0.79
310 0.75
311 0.69
312 0.66
313 0.66
314 0.66
315 0.64
316 0.63
317 0.56
318 0.55
319 0.56
320 0.53
321 0.55
322 0.55
323 0.54
324 0.5
325 0.5
326 0.46
327 0.47
328 0.44
329 0.41
330 0.41
331 0.43
332 0.46
333 0.44
334 0.42
335 0.39
336 0.38
337 0.35
338 0.3
339 0.24
340 0.2
341 0.19
342 0.2
343 0.19
344 0.18
345 0.15
346 0.12
347 0.11
348 0.12
349 0.12
350 0.13
351 0.17
352 0.19
353 0.21
354 0.24
355 0.26
356 0.3
357 0.4
358 0.46
359 0.47
360 0.53
361 0.53
362 0.52
363 0.5
364 0.46
365 0.39
366 0.33
367 0.37
368 0.36
369 0.41
370 0.41
371 0.43
372 0.43
373 0.41
374 0.4
375 0.39
376 0.36
377 0.32
378 0.29
379 0.31
380 0.3
381 0.3
382 0.33
383 0.29
384 0.28
385 0.26
386 0.26
387 0.22
388 0.24
389 0.26
390 0.23
391 0.2
392 0.19
393 0.18
394 0.19
395 0.2
396 0.18
397 0.18
398 0.19
399 0.21
400 0.24
401 0.3
402 0.37
403 0.44