Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HM32

Protein Details
Accession A0A179HM32    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
186-205QSDGRPTKRRRRSSAASGSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
194-196RRR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045161  Utp18  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG plj:VFPFJ_05081  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MAAEKDQWVSDQEQSDSDMSSDLSSDDDIAINTTSNAAMFDKDSDEEELERLVLGNKASFRENLFKDGGDLYGDGADDQDVELADADTAGMEDVEDADLFMIDTGAPGAGSALSKPTPASKKTEQGDVPAWEDSDDERLAISLAKATRLRKLRTTEAEDVISGTEYSRRLRQQFLRLNPAPAWAQQSDGRPTKRRRRSSAASGSSSDSSGSDDEDASAPPLDKFLRDVNQLAGLGGGSKKRPLRPEVIDMQRTREIPDKHKMPVECLSFHPEYPVLLSASTASILYLHHIAPDAQPPNPQLTSVQVKQVDVRRAEFLYPQGDKIFFAGRRRYFHHWDLPSGVVQKTSRVAGHQEEHKSMERFKLSPCGRYMGIVASSRKGGGIINVISVATAQWIAAARLQSRHGIADFAWWSTGDGMTILGKDGQVGEYSMESRSFLGVWQDDGSVGAIVIALGGHRGPEALGDDRWVAVGSNTGITNIYDRNELIVPNTSSSDTNDGDGGDDRITIKERPTPTRTFEQLVTPITVLTFSPDGQLLAFGSRQTKDALRLVHLPSCTVYRNWPTAQTPLGRITAVAFGRDSGLLAVGNDAGKIRLWHIRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.24
4 0.21
5 0.16
6 0.13
7 0.12
8 0.12
9 0.09
10 0.09
11 0.09
12 0.09
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.1
17 0.1
18 0.1
19 0.09
20 0.1
21 0.09
22 0.08
23 0.1
24 0.09
25 0.1
26 0.1
27 0.12
28 0.14
29 0.14
30 0.16
31 0.17
32 0.18
33 0.18
34 0.17
35 0.16
36 0.14
37 0.13
38 0.12
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.14
43 0.15
44 0.18
45 0.2
46 0.21
47 0.24
48 0.31
49 0.32
50 0.34
51 0.33
52 0.31
53 0.31
54 0.3
55 0.26
56 0.18
57 0.16
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.09
62 0.08
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.05
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.04
81 0.05
82 0.05
83 0.04
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.04
89 0.03
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.03
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.05
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.18
104 0.24
105 0.26
106 0.34
107 0.36
108 0.45
109 0.47
110 0.54
111 0.47
112 0.46
113 0.48
114 0.43
115 0.39
116 0.32
117 0.29
118 0.21
119 0.21
120 0.17
121 0.15
122 0.13
123 0.1
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.1
131 0.15
132 0.19
133 0.2
134 0.28
135 0.35
136 0.38
137 0.41
138 0.47
139 0.51
140 0.54
141 0.61
142 0.59
143 0.54
144 0.51
145 0.44
146 0.38
147 0.3
148 0.23
149 0.15
150 0.1
151 0.1
152 0.11
153 0.13
154 0.19
155 0.24
156 0.26
157 0.34
158 0.4
159 0.47
160 0.54
161 0.58
162 0.62
163 0.58
164 0.59
165 0.52
166 0.48
167 0.38
168 0.31
169 0.3
170 0.2
171 0.21
172 0.22
173 0.25
174 0.3
175 0.35
176 0.39
177 0.43
178 0.52
179 0.6
180 0.67
181 0.72
182 0.73
183 0.76
184 0.78
185 0.8
186 0.81
187 0.76
188 0.69
189 0.61
190 0.56
191 0.47
192 0.4
193 0.29
194 0.19
195 0.14
196 0.11
197 0.1
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.1
211 0.13
212 0.16
213 0.18
214 0.19
215 0.18
216 0.2
217 0.19
218 0.17
219 0.13
220 0.09
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.12
226 0.16
227 0.2
228 0.25
229 0.28
230 0.34
231 0.36
232 0.42
233 0.46
234 0.49
235 0.51
236 0.47
237 0.48
238 0.44
239 0.4
240 0.36
241 0.35
242 0.32
243 0.31
244 0.39
245 0.37
246 0.36
247 0.4
248 0.38
249 0.35
250 0.38
251 0.35
252 0.29
253 0.27
254 0.31
255 0.27
256 0.27
257 0.24
258 0.18
259 0.15
260 0.14
261 0.14
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.07
268 0.06
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.05
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.13
280 0.13
281 0.12
282 0.14
283 0.15
284 0.18
285 0.17
286 0.16
287 0.11
288 0.14
289 0.19
290 0.18
291 0.22
292 0.2
293 0.2
294 0.24
295 0.28
296 0.3
297 0.25
298 0.26
299 0.23
300 0.23
301 0.24
302 0.21
303 0.18
304 0.18
305 0.17
306 0.16
307 0.15
308 0.15
309 0.14
310 0.14
311 0.17
312 0.15
313 0.19
314 0.26
315 0.29
316 0.31
317 0.36
318 0.42
319 0.43
320 0.46
321 0.49
322 0.43
323 0.41
324 0.4
325 0.37
326 0.32
327 0.28
328 0.23
329 0.17
330 0.16
331 0.16
332 0.15
333 0.15
334 0.13
335 0.12
336 0.15
337 0.16
338 0.2
339 0.24
340 0.26
341 0.26
342 0.29
343 0.32
344 0.3
345 0.28
346 0.29
347 0.26
348 0.24
349 0.24
350 0.31
351 0.28
352 0.31
353 0.31
354 0.3
355 0.27
356 0.27
357 0.26
358 0.18
359 0.2
360 0.19
361 0.18
362 0.16
363 0.16
364 0.16
365 0.15
366 0.13
367 0.1
368 0.08
369 0.11
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.07
377 0.04
378 0.04
379 0.03
380 0.04
381 0.05
382 0.06
383 0.08
384 0.1
385 0.1
386 0.12
387 0.14
388 0.15
389 0.15
390 0.16
391 0.14
392 0.14
393 0.12
394 0.16
395 0.15
396 0.14
397 0.13
398 0.12
399 0.12
400 0.12
401 0.12
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.08
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.09
422 0.09
423 0.08
424 0.08
425 0.11
426 0.11
427 0.12
428 0.12
429 0.12
430 0.11
431 0.12
432 0.11
433 0.07
434 0.07
435 0.05
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.03
440 0.02
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.04
446 0.04
447 0.05
448 0.08
449 0.1
450 0.1
451 0.12
452 0.12
453 0.12
454 0.13
455 0.12
456 0.09
457 0.07
458 0.09
459 0.08
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.1
465 0.13
466 0.12
467 0.13
468 0.12
469 0.12
470 0.15
471 0.15
472 0.15
473 0.15
474 0.19
475 0.19
476 0.19
477 0.21
478 0.19
479 0.19
480 0.21
481 0.24
482 0.18
483 0.18
484 0.17
485 0.16
486 0.16
487 0.16
488 0.15
489 0.11
490 0.11
491 0.11
492 0.12
493 0.15
494 0.15
495 0.17
496 0.22
497 0.28
498 0.35
499 0.4
500 0.44
501 0.47
502 0.53
503 0.55
504 0.52
505 0.48
506 0.45
507 0.43
508 0.41
509 0.36
510 0.29
511 0.24
512 0.21
513 0.19
514 0.14
515 0.13
516 0.12
517 0.1
518 0.12
519 0.12
520 0.12
521 0.11
522 0.12
523 0.1
524 0.1
525 0.11
526 0.11
527 0.15
528 0.15
529 0.17
530 0.19
531 0.21
532 0.24
533 0.29
534 0.3
535 0.3
536 0.35
537 0.38
538 0.39
539 0.36
540 0.32
541 0.29
542 0.3
543 0.29
544 0.25
545 0.29
546 0.31
547 0.37
548 0.37
549 0.42
550 0.41
551 0.43
552 0.47
553 0.43
554 0.4
555 0.38
556 0.38
557 0.32
558 0.29
559 0.26
560 0.28
561 0.24
562 0.22
563 0.18
564 0.17
565 0.18
566 0.18
567 0.17
568 0.1
569 0.11
570 0.09
571 0.09
572 0.1
573 0.1
574 0.1
575 0.1
576 0.1
577 0.1
578 0.11
579 0.12
580 0.14