Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179GQ59

Protein Details
Accession A0A179GQ59    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-127AVATRKASKAAPKPRKPRRQKEPKPIVVVSHydrophilic
136-158ESPSKDQPWRKYKSPSKERASSPHydrophilic
223-255VQSGAKTKTKAKTKSKAKAKSKTKAKAVCRKADHydrophilic
410-438KGKAAAKPRKRAPKPSKKKAPPPKPILLSBasic
712-734AVATPEKRPRGRPRKTSVTEQPLHydrophilic
741-761AQPHATPKRGRGRPRKDSVSGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-122RKASKAAPKPRKPRRQKEPKP
228-248KTKTKAKTKSKAKAKSKTKAK
366-372KAPKKKP
404-434PKPNDTKGKAAAKPRKRAPKPSKKKAPPPKP
718-726KRPRGRPRK
744-783HATPKRGRGRPRKDSVSGPPGVSVAKAKAGPSTPKRPLRK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG plj:VFPFJ_09917  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MASPDVFLSSPARERRRLYDTMSSSPGLPSIQELASQKPRRPPLRSGSKAAPIPDDAPTTFTSAGSLWKSLQQADAAAKSTPAARAPTPEEVEDVDTAVATRKASKAAPKPRKPRRQKEPKPIVVVSEAAQSRGPESPSKDQPWRKYKSPSKERASSPIIELPKPGSDTAPCQDAGSKTSPFFVGHESPEAVKPAPVVEVEDKLPEVMQGQEGIGAVGPNDDVQSGAKTKTKAKTKSKAKAKSKTKAKAVCRKADDEPLQLEQAMGRRLDWTPPAKKTQIILDSDSPSTERADHNPPQSGEASKDQSFGSLLATFKCEEMAQQSVNSTSEEESTFLKKRKLLEFVSAPAQAASEPELAIVSPVKQKAPKKKPRTITALATAAYRPLTQPEPPSAVEAKAHSEPPKPNDTKGKAAAKPRKRAPKPSKKKAPPPKPILLSPGTALKQVAGQDFVFGTSSQLAREQSPSLLRDLQIAMKSSNQLDHADFVTPLNSDAIEPAEKRLSLWEAAARDADGDLFDVEVLNLVNGSQRLPGVAREEDPFGYIKGDEEPVELPPLPAAPTDNKTMDDDSFLTLSDILPAPAKKPAEIVDIAQQSSSSQSEAKVTSKRGQPTRHQEGSIAQAIREPTSTTTSAGEPEQALSYDHLSDAQLAKQVAQYGFKPIKKRGAMIALLQQCWRPGAQGQPAGTRLASTTSKSSSGRPTTPTAGGSASAVATPEKRPRGRPRKTSVTEQPLHEPPPSAQPHATPKRGRGRPRKDSVSGPPGVSVAKAKAGPSTPKRPLRKPVIEIPDSEGDAGADSSDTPWSSPDATFSPPQPVDLTMSVGEDTELTLTISPTDQQTELFMFVTKAVTTAPRTTDPANPSWHEKILLYDPIVIEDLTSWLNCGQLTRVGYDGEVSSGEIKAWCESKSICCLWKVNLRGKERKRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.54
3 0.58
4 0.59
5 0.57
6 0.59
7 0.58
8 0.58
9 0.57
10 0.5
11 0.44
12 0.4
13 0.35
14 0.25
15 0.19
16 0.16
17 0.15
18 0.15
19 0.18
20 0.2
21 0.26
22 0.36
23 0.42
24 0.45
25 0.51
26 0.6
27 0.65
28 0.69
29 0.7
30 0.7
31 0.76
32 0.77
33 0.75
34 0.72
35 0.71
36 0.69
37 0.62
38 0.55
39 0.46
40 0.42
41 0.38
42 0.35
43 0.27
44 0.26
45 0.25
46 0.25
47 0.23
48 0.2
49 0.18
50 0.15
51 0.2
52 0.19
53 0.2
54 0.17
55 0.21
56 0.23
57 0.23
58 0.25
59 0.2
60 0.21
61 0.24
62 0.25
63 0.22
64 0.21
65 0.2
66 0.18
67 0.2
68 0.19
69 0.18
70 0.19
71 0.19
72 0.24
73 0.29
74 0.35
75 0.36
76 0.34
77 0.32
78 0.3
79 0.31
80 0.26
81 0.22
82 0.15
83 0.12
84 0.11
85 0.12
86 0.12
87 0.1
88 0.13
89 0.14
90 0.17
91 0.21
92 0.3
93 0.38
94 0.48
95 0.58
96 0.66
97 0.75
98 0.83
99 0.91
100 0.93
101 0.93
102 0.93
103 0.94
104 0.95
105 0.95
106 0.95
107 0.93
108 0.9
109 0.8
110 0.71
111 0.62
112 0.53
113 0.42
114 0.38
115 0.3
116 0.23
117 0.23
118 0.2
119 0.2
120 0.21
121 0.23
122 0.2
123 0.27
124 0.34
125 0.4
126 0.47
127 0.55
128 0.6
129 0.68
130 0.73
131 0.74
132 0.72
133 0.75
134 0.78
135 0.79
136 0.82
137 0.82
138 0.81
139 0.82
140 0.79
141 0.76
142 0.71
143 0.62
144 0.55
145 0.52
146 0.47
147 0.39
148 0.36
149 0.31
150 0.29
151 0.28
152 0.25
153 0.2
154 0.19
155 0.23
156 0.24
157 0.24
158 0.21
159 0.2
160 0.23
161 0.22
162 0.24
163 0.23
164 0.23
165 0.21
166 0.22
167 0.23
168 0.2
169 0.2
170 0.22
171 0.21
172 0.21
173 0.23
174 0.23
175 0.23
176 0.24
177 0.25
178 0.2
179 0.17
180 0.15
181 0.13
182 0.13
183 0.11
184 0.14
185 0.14
186 0.15
187 0.16
188 0.16
189 0.16
190 0.15
191 0.14
192 0.11
193 0.1
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.08
212 0.1
213 0.12
214 0.16
215 0.18
216 0.25
217 0.33
218 0.42
219 0.49
220 0.58
221 0.66
222 0.73
223 0.8
224 0.84
225 0.87
226 0.87
227 0.88
228 0.88
229 0.87
230 0.87
231 0.86
232 0.85
233 0.83
234 0.83
235 0.82
236 0.81
237 0.8
238 0.74
239 0.7
240 0.63
241 0.64
242 0.57
243 0.51
244 0.45
245 0.38
246 0.34
247 0.29
248 0.26
249 0.18
250 0.18
251 0.17
252 0.14
253 0.12
254 0.14
255 0.14
256 0.17
257 0.22
258 0.26
259 0.3
260 0.34
261 0.4
262 0.39
263 0.41
264 0.4
265 0.41
266 0.39
267 0.35
268 0.35
269 0.33
270 0.34
271 0.32
272 0.31
273 0.25
274 0.2
275 0.18
276 0.16
277 0.14
278 0.15
279 0.23
280 0.27
281 0.3
282 0.35
283 0.34
284 0.35
285 0.35
286 0.31
287 0.28
288 0.27
289 0.28
290 0.24
291 0.25
292 0.22
293 0.21
294 0.2
295 0.17
296 0.14
297 0.11
298 0.11
299 0.1
300 0.12
301 0.12
302 0.11
303 0.11
304 0.1
305 0.08
306 0.1
307 0.13
308 0.12
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.14
313 0.14
314 0.11
315 0.09
316 0.1
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.15
321 0.19
322 0.22
323 0.25
324 0.26
325 0.31
326 0.35
327 0.39
328 0.37
329 0.38
330 0.38
331 0.37
332 0.38
333 0.33
334 0.28
335 0.21
336 0.19
337 0.13
338 0.11
339 0.1
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.07
346 0.07
347 0.06
348 0.09
349 0.11
350 0.13
351 0.19
352 0.26
353 0.36
354 0.47
355 0.56
356 0.62
357 0.7
358 0.76
359 0.77
360 0.79
361 0.73
362 0.66
363 0.61
364 0.53
365 0.45
366 0.38
367 0.3
368 0.23
369 0.18
370 0.14
371 0.09
372 0.1
373 0.11
374 0.12
375 0.14
376 0.16
377 0.19
378 0.19
379 0.22
380 0.2
381 0.19
382 0.18
383 0.17
384 0.17
385 0.16
386 0.18
387 0.17
388 0.21
389 0.24
390 0.27
391 0.36
392 0.34
393 0.36
394 0.43
395 0.44
396 0.44
397 0.48
398 0.51
399 0.46
400 0.55
401 0.61
402 0.6
403 0.64
404 0.67
405 0.71
406 0.68
407 0.75
408 0.76
409 0.78
410 0.81
411 0.84
412 0.87
413 0.84
414 0.91
415 0.9
416 0.9
417 0.88
418 0.85
419 0.81
420 0.73
421 0.66
422 0.6
423 0.51
424 0.41
425 0.31
426 0.28
427 0.21
428 0.19
429 0.17
430 0.12
431 0.12
432 0.13
433 0.13
434 0.1
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.08
440 0.07
441 0.07
442 0.06
443 0.07
444 0.07
445 0.09
446 0.09
447 0.09
448 0.11
449 0.11
450 0.11
451 0.13
452 0.14
453 0.14
454 0.15
455 0.14
456 0.14
457 0.14
458 0.15
459 0.14
460 0.14
461 0.13
462 0.12
463 0.13
464 0.12
465 0.13
466 0.12
467 0.12
468 0.11
469 0.12
470 0.12
471 0.11
472 0.11
473 0.1
474 0.09
475 0.08
476 0.08
477 0.06
478 0.06
479 0.05
480 0.05
481 0.06
482 0.07
483 0.07
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.11
489 0.11
490 0.1
491 0.11
492 0.12
493 0.11
494 0.12
495 0.12
496 0.1
497 0.09
498 0.08
499 0.08
500 0.05
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.03
506 0.03
507 0.04
508 0.03
509 0.03
510 0.03
511 0.03
512 0.04
513 0.04
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.06
518 0.07
519 0.08
520 0.11
521 0.12
522 0.13
523 0.13
524 0.15
525 0.14
526 0.15
527 0.14
528 0.11
529 0.1
530 0.09
531 0.08
532 0.08
533 0.09
534 0.08
535 0.09
536 0.09
537 0.09
538 0.11
539 0.11
540 0.09
541 0.08
542 0.08
543 0.08
544 0.07
545 0.09
546 0.1
547 0.12
548 0.16
549 0.16
550 0.17
551 0.18
552 0.2
553 0.18
554 0.17
555 0.15
556 0.13
557 0.12
558 0.11
559 0.1
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.07
564 0.06
565 0.09
566 0.09
567 0.1
568 0.14
569 0.14
570 0.13
571 0.14
572 0.16
573 0.17
574 0.18
575 0.18
576 0.2
577 0.21
578 0.21
579 0.2
580 0.18
581 0.14
582 0.15
583 0.14
584 0.09
585 0.08
586 0.08
587 0.11
588 0.13
589 0.17
590 0.19
591 0.23
592 0.28
593 0.33
594 0.4
595 0.44
596 0.49
597 0.54
598 0.6
599 0.66
600 0.63
601 0.58
602 0.52
603 0.47
604 0.45
605 0.42
606 0.32
607 0.22
608 0.21
609 0.21
610 0.21
611 0.19
612 0.15
613 0.11
614 0.15
615 0.16
616 0.14
617 0.15
618 0.15
619 0.16
620 0.15
621 0.15
622 0.11
623 0.11
624 0.11
625 0.1
626 0.1
627 0.09
628 0.1
629 0.09
630 0.09
631 0.09
632 0.08
633 0.1
634 0.1
635 0.1
636 0.13
637 0.12
638 0.13
639 0.14
640 0.17
641 0.16
642 0.17
643 0.17
644 0.22
645 0.29
646 0.32
647 0.36
648 0.36
649 0.44
650 0.44
651 0.45
652 0.41
653 0.41
654 0.39
655 0.37
656 0.4
657 0.34
658 0.34
659 0.33
660 0.29
661 0.23
662 0.22
663 0.2
664 0.13
665 0.12
666 0.18
667 0.23
668 0.27
669 0.28
670 0.3
671 0.32
672 0.31
673 0.29
674 0.22
675 0.16
676 0.16
677 0.16
678 0.15
679 0.17
680 0.18
681 0.22
682 0.23
683 0.26
684 0.31
685 0.35
686 0.36
687 0.37
688 0.39
689 0.39
690 0.4
691 0.37
692 0.3
693 0.25
694 0.22
695 0.18
696 0.14
697 0.1
698 0.08
699 0.08
700 0.08
701 0.09
702 0.13
703 0.2
704 0.28
705 0.32
706 0.41
707 0.52
708 0.62
709 0.7
710 0.76
711 0.78
712 0.8
713 0.82
714 0.82
715 0.81
716 0.79
717 0.74
718 0.67
719 0.64
720 0.57
721 0.55
722 0.46
723 0.38
724 0.29
725 0.34
726 0.34
727 0.31
728 0.28
729 0.31
730 0.4
731 0.47
732 0.54
733 0.48
734 0.54
735 0.61
736 0.68
737 0.74
738 0.74
739 0.77
740 0.79
741 0.85
742 0.84
743 0.77
744 0.76
745 0.74
746 0.71
747 0.64
748 0.53
749 0.45
750 0.38
751 0.34
752 0.28
753 0.21
754 0.14
755 0.15
756 0.16
757 0.16
758 0.19
759 0.23
760 0.31
761 0.37
762 0.45
763 0.51
764 0.59
765 0.67
766 0.71
767 0.76
768 0.78
769 0.79
770 0.75
771 0.75
772 0.75
773 0.69
774 0.63
775 0.58
776 0.51
777 0.43
778 0.37
779 0.27
780 0.18
781 0.16
782 0.15
783 0.09
784 0.06
785 0.05
786 0.06
787 0.08
788 0.08
789 0.08
790 0.09
791 0.11
792 0.13
793 0.13
794 0.16
795 0.16
796 0.2
797 0.23
798 0.24
799 0.3
800 0.28
801 0.29
802 0.27
803 0.26
804 0.26
805 0.24
806 0.26
807 0.17
808 0.18
809 0.17
810 0.15
811 0.14
812 0.1
813 0.09
814 0.07
815 0.07
816 0.06
817 0.07
818 0.07
819 0.08
820 0.08
821 0.09
822 0.11
823 0.13
824 0.13
825 0.13
826 0.15
827 0.16
828 0.17
829 0.16
830 0.15
831 0.13
832 0.13
833 0.14
834 0.11
835 0.1
836 0.1
837 0.14
838 0.17
839 0.21
840 0.24
841 0.26
842 0.29
843 0.32
844 0.38
845 0.39
846 0.4
847 0.42
848 0.41
849 0.45
850 0.46
851 0.45
852 0.4
853 0.35
854 0.35
855 0.34
856 0.35
857 0.29
858 0.28
859 0.26
860 0.26
861 0.27
862 0.21
863 0.16
864 0.12
865 0.13
866 0.11
867 0.1
868 0.1
869 0.09
870 0.11
871 0.11
872 0.12
873 0.12
874 0.16
875 0.18
876 0.19
877 0.2
878 0.19
879 0.19
880 0.2
881 0.18
882 0.13
883 0.12
884 0.11
885 0.12
886 0.11
887 0.12
888 0.12
889 0.13
890 0.15
891 0.17
892 0.17
893 0.19
894 0.21
895 0.25
896 0.31
897 0.35
898 0.35
899 0.38
900 0.4
901 0.44
902 0.5
903 0.53
904 0.55
905 0.59
906 0.64
907 0.7