Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HL13

Protein Details
Accession A0A179HL13    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-41GDVLTKKKLDPHRSRCHGASHydrophilic
67-95QKYQGALYKEKNKKQKHHHDKPAEQKQIEHydrophilic
227-256SKSERRKTKDSEVKKDKKRKRLHVEVPGDQBasic
296-315SPASPLKKTKHSKHAKSTHVHydrophilic
323-355ITGGSKSKSHKKKSTSKKKSHGHKERKEPKLIEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-247KSERRKTKDSEVKKDKKRKR
328-353KSKSHKKKSTSKKKSHGHKERKEPKL
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 13.333, mito 12, cyto_mito 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039999  LYAR  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG plj:VFPFJ_05254  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51804  ZF_C2HC_LYAR  
Amino Acid Sequences MADARSHRRARDTAVTLLAACGDVLTKKKLDPHRSRCHGASFTCIDCMVHFQGVQYRSHTSCITEDQKYQGALYKEKNKKQKHHHDKPAEQKQIERPKNMAQQPYVEDVGEDREYEPWNDSAGHTEDERSPAEPPPEAPTPPAAATEEHVNVFDFLVATGQTPNASNMNLPRDQMGPDVGDSTSLVRYEYNAEEYLDPTSLMDADNEPLVQYGTGPVPSGAFVTPASKSERRKTKDSEVKKDKKRKRLHVEVPGDQVMTDAPPVLHSGLTGGLKTLMRPTLPPSPDYSGGDVADNSPASPLKKTKHSKHAKSTHVGNSLFDMITGGSKSKSHKKKSTSKKKSHGHKERKEPKLIEFRPQSKDGKSDNPDGQMVVFKPRADAFLSFVNKGPESERGCSVNKALKRYHRERQASGTGAGKSKEEKELWKDLRLRRNERGEIVLFSISE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.46
3 0.39
4 0.36
5 0.29
6 0.19
7 0.14
8 0.09
9 0.07
10 0.09
11 0.13
12 0.17
13 0.18
14 0.2
15 0.29
16 0.39
17 0.49
18 0.57
19 0.65
20 0.72
21 0.78
22 0.82
23 0.77
24 0.75
25 0.7
26 0.6
27 0.57
28 0.5
29 0.43
30 0.38
31 0.35
32 0.27
33 0.21
34 0.25
35 0.21
36 0.18
37 0.17
38 0.17
39 0.23
40 0.25
41 0.27
42 0.24
43 0.27
44 0.26
45 0.3
46 0.29
47 0.25
48 0.25
49 0.31
50 0.34
51 0.33
52 0.34
53 0.35
54 0.37
55 0.35
56 0.33
57 0.31
58 0.28
59 0.3
60 0.36
61 0.43
62 0.49
63 0.57
64 0.66
65 0.7
66 0.76
67 0.82
68 0.85
69 0.86
70 0.88
71 0.91
72 0.91
73 0.91
74 0.92
75 0.92
76 0.89
77 0.79
78 0.73
79 0.73
80 0.73
81 0.7
82 0.62
83 0.55
84 0.55
85 0.63
86 0.63
87 0.58
88 0.49
89 0.48
90 0.47
91 0.47
92 0.4
93 0.3
94 0.24
95 0.19
96 0.21
97 0.17
98 0.15
99 0.11
100 0.13
101 0.15
102 0.16
103 0.17
104 0.13
105 0.14
106 0.14
107 0.14
108 0.16
109 0.17
110 0.17
111 0.15
112 0.17
113 0.17
114 0.19
115 0.2
116 0.16
117 0.16
118 0.18
119 0.19
120 0.18
121 0.18
122 0.2
123 0.22
124 0.22
125 0.21
126 0.2
127 0.2
128 0.2
129 0.2
130 0.15
131 0.13
132 0.14
133 0.16
134 0.16
135 0.14
136 0.14
137 0.13
138 0.12
139 0.11
140 0.1
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.13
155 0.17
156 0.18
157 0.17
158 0.17
159 0.17
160 0.18
161 0.17
162 0.15
163 0.11
164 0.1
165 0.11
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.08
173 0.06
174 0.07
175 0.1
176 0.11
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.11
184 0.1
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.07
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.09
213 0.14
214 0.18
215 0.22
216 0.3
217 0.39
218 0.42
219 0.48
220 0.52
221 0.57
222 0.62
223 0.67
224 0.7
225 0.71
226 0.77
227 0.8
228 0.86
229 0.83
230 0.84
231 0.85
232 0.84
233 0.83
234 0.84
235 0.83
236 0.83
237 0.81
238 0.74
239 0.68
240 0.58
241 0.48
242 0.37
243 0.28
244 0.18
245 0.12
246 0.08
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.06
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.11
263 0.1
264 0.1
265 0.11
266 0.15
267 0.22
268 0.23
269 0.24
270 0.25
271 0.28
272 0.3
273 0.31
274 0.29
275 0.22
276 0.21
277 0.21
278 0.17
279 0.13
280 0.13
281 0.11
282 0.09
283 0.08
284 0.1
285 0.1
286 0.13
287 0.18
288 0.2
289 0.31
290 0.4
291 0.47
292 0.57
293 0.66
294 0.72
295 0.78
296 0.83
297 0.8
298 0.76
299 0.75
300 0.71
301 0.68
302 0.59
303 0.49
304 0.42
305 0.37
306 0.31
307 0.23
308 0.16
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.09
313 0.08
314 0.1
315 0.16
316 0.26
317 0.35
318 0.43
319 0.51
320 0.6
321 0.7
322 0.79
323 0.86
324 0.87
325 0.88
326 0.89
327 0.9
328 0.91
329 0.92
330 0.92
331 0.91
332 0.9
333 0.91
334 0.9
335 0.89
336 0.87
337 0.78
338 0.76
339 0.76
340 0.68
341 0.67
342 0.66
343 0.64
344 0.61
345 0.64
346 0.6
347 0.51
348 0.56
349 0.51
350 0.52
351 0.5
352 0.52
353 0.5
354 0.49
355 0.47
356 0.4
357 0.36
358 0.3
359 0.26
360 0.26
361 0.24
362 0.21
363 0.23
364 0.23
365 0.24
366 0.23
367 0.23
368 0.19
369 0.25
370 0.28
371 0.27
372 0.28
373 0.3
374 0.28
375 0.28
376 0.27
377 0.27
378 0.29
379 0.31
380 0.32
381 0.33
382 0.35
383 0.36
384 0.39
385 0.39
386 0.38
387 0.42
388 0.45
389 0.51
390 0.59
391 0.65
392 0.69
393 0.72
394 0.75
395 0.74
396 0.74
397 0.73
398 0.66
399 0.61
400 0.56
401 0.49
402 0.45
403 0.42
404 0.35
405 0.31
406 0.31
407 0.36
408 0.34
409 0.38
410 0.41
411 0.51
412 0.52
413 0.57
414 0.62
415 0.63
416 0.69
417 0.72
418 0.74
419 0.72
420 0.78
421 0.76
422 0.71
423 0.69
424 0.62
425 0.55
426 0.5